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南美安第斯山十字花科Stenodraba属分子系统发育与生态位分析数据集
数据集概述 本数据集围绕南美安第斯山十字花科植物Stenodraba属的分类地位展开,包含分子系统发育数据(核基因ITS、质体基因trnL-F和trnH-psbA)及生态位分析结果,验证其分类归属与进化关系,为该属恢复提供科学依据。 文件详解 分子系统发育文件: 序列数据文件:如ITS_EUDEMEAE.fas、trnL-...
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马达加斯加西北部侏儒壁虎分子系统学与新物种描述数据集
数据集概述 本数据集为论文《马达加斯加西北部神秘侏儒壁虎Lygodactylus ornatus的分子系统学及L. verticillatus群新物种描述》的配套数据,包含原始DNA比对及系统发育树文件,支持对该区域侏儒壁虎物种分类与进化关系的研究。 文件详解...
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Kewa属植物系统分类与系统发育数据集
数据集概述 本数据集聚焦于单型科Kewaceae中Kewa属的分类修订与系统发育研究,包含6个物种的形态特征、分类处理、地理分布及基于质体与核基因序列的系统发育分析结果,为该属植物的分类学与进化研究提供支撑。 文件详解...
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龟类与鳄类进化隔离及威胁的系统发育与空间分布数据集
数据集概述 该数据集围绕龟类与鳄类的进化隔离、威胁状态及系统发育特征展开,结合分子、形态学证据与机器学习算法,评估现存物种的多样化、威胁等级及进化独特性,预测未评估物种的威胁风险并识别高威胁区域。 文件详解 该数据集包含9个文件,具体说明如下: - 文档类文件: -...
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蜘蛛科林蛛科全证据系统发育分析补充文件包
数据集概述 本数据集为林蛛科(Linyphiidae)全证据系统发育分析的补充文件包,包含基因序列、表型矩阵、系统发育树等核心数据文件,支持Silva-Moreira等人相关研究的复现与扩展分析。 文件详解 该数据集包含69个文件,按类型分类说明如下: -...
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四足动物近缘种识别系统发育基因组数据集
数据集概述 本数据集为四足动物近缘种识别的系统发育基因组研究数据,包含用于解决早期肉鳍鱼类分化短深节点的多文件数据,涉及基因序列块、分析脚本及补充文档,支持脊椎动物系统发育学中四足动物近缘种的研究。 文件详解...
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多洛数据新型距离研究数据集
数据集概述 该数据集围绕多洛过程(Dollo process)下的二元(存在/缺失)数据距离展开研究,引入了新型的加性多洛距离(ADD),通过模拟数据对比多种二元距离的性能,并将ADD应用于桉树DArT数据集和细菌基因家族数据,提供相关案例分析结果。 文件详解 案例研究文件(.nex格式):...
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鸟类系统发育基因组数据类型与分类单元采样影响研究数据集
数据集概述 本数据集围绕鸟类系统发育基因组学研究展开,聚焦新鸟亚纲早期分化节点的系统发育树冲突问题,通过构建含90%非编码序列的235种鸟类数据矩阵,对比分析数据类型、分类单元数量及位点数量对系统发育树拓扑结构的影响,揭示数据类型为导致树结构不一致的关键因素。 文件详解 压缩文件(.gz格式):...
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现存小嘴贝目_腕足动物门_形态与分子数据联合分析数据集
数据集概述 本数据集围绕现存小嘴贝目腕足动物的形态与分子数据联合分析展开,包含形态特征矩阵、核糖体DNA序列及系列系统发育分析结果,用于探究形态与分子数据的系统发育信号冲突,评估形态系统学在该类群中的适用性。 文件详解 文档类文件(.docx格式,共5个):...
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多指状地卷属地衣共生特异性宏进化数据集
数据集概述 本数据集聚焦多指状地卷属(Peltigera section Polydactylon)地衣真菌与念珠藻(Nostoc)共生体的特异性宏进化研究,包含系统发育分析序列、补充图表及表格,为探究共生伙伴特异性模式及进化机制提供数据支持。 文件详解 系统发育分析文件(.nex格式,共7个):...
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早期陆生植物线粒体系统发育基因组学数据集
数据集概述 本数据集围绕早期陆生植物线粒体系统发育基因组学展开,通过新建20种苔藓植物线粒体基因组并补充40种链型植物数据,构建含60个分类群、41个线粒体基因的矩阵,分析核苷酸与氨基酸数据对系统发育推断的影响,探讨饱和效应、组成异质性等系统误差的作用。 文件详解 数据矩阵文件(.nex格式): Matrix_nt.nex:核苷酸序列数据矩阵文件...
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北美树花属_梅衣科_分子研究数据集
数据集概述 本数据集聚焦北美树花属(Alectoria)地衣的分子系统发育研究,通过ITS和Mcm7两个核基因分析9个类群的48个样本,探讨5个与A. sarmentosa相关或易混淆类群的分类界限,提出临时分类处理建议及新物种组合,并提供北美树花属物种检索表。 文件详解...
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西部_Plethodon_蝾螈历史物种分布模型与物种界限数据集
数据集概述 本数据集围绕西部Plethodon属蝾螈的物种界限研究,整合了历史物种分布模型(SDM)与分子分析数据。通过构建当前分布模型并回推至末次盛冰期(21 Ka)气候条件,结合分子方法探讨物种界限,为理解历史分布对物种划分的影响提供数据支持。 文件详解 该数据集包含26个文件,主要分为两类: - 分子数据文件(.nex格式,共21个): -...
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现代人类生殖基因中的古老适应性基因渗入数据集
数据集概述 本数据集聚焦现代人类生殖基因中来自尼安德特人或丹尼索瓦人的古老适应性基因渗入现象,包含基因渗入检测、正选择分析结果,以及高分辨率图片和补充表格,为研究古老基因渗入对现代人类生殖基因的影响提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型文件,具体说明如下: - 核心分析文件: -...
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寒武纪早中期环境变化下娜罗虫类节肢动物系统发育响应数据集
数据集概述 本数据集围绕寒武纪早中期环境变化对娜罗虫类节肢动物的系统发育响应展开,通过重建灭绝事件前后的系统发育关系,探究深水陆架生物对环境扰动的耐受性,为布尔吉斯页岩型生物群避难所假说提供实证支持。 文件详解 附录文档(.docx格式):...
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狐猴系统发育与分化时间数据集
数据集概述 本数据集整合形态学与DNA序列数据,通过尖端定年(TD)和化石化生死过程(FBD)模型,推断现生及灭绝狐猴的系统发育关系与分化时间,涉及马达加斯加特有狐猴88%的类群,为灵长类演化历史研究提供支持。 文件详解...
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有颌脊椎动物系统发育与早期演化分析数据集
数据集概述 本数据集围绕有颌脊椎动物的系统发育展开,通过修正形态学数据集并采用贝叶斯尖端定年形态钟方法,探究盾皮鱼类的单系性及有颌脊椎动物的早期演化速率,为理解颌起源这一关键进化事件提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplementary_information.pdf 文件格式: PDF 内容: 补充说明文档,包含研究方法、结果细节等辅助信息...
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木槿族_锦葵科_系统发育关系研究比对与树文件数据集
数据集概述 本数据集包含木槿族(锦葵科)系统发育关系研究的基因比对文件与系统发育树文件,基于迄今最全面的分类群采样构建,涉及传统定义的木槿属和孔雀葵属的多系性分析,以及新属的分类修订,为该族植物分类提供关键数据支持。 文件详解 数据集包含5个文件,具体说明如下: - 文件名称:README.md - 文件格式:Markdown(.md) -...
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系统发育分析中分层特征整合数据集
数据集概述 该数据集围绕系统发育分析中分层特征整合展开,包含用于评估新优化标准的合成与实证数据,涉及字符矩阵、字符类型文件及系统发育树文件,支持对比不同处理不适用字符方法的效果。 文件详解 核心数据文件:...
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异源多倍体同源基因亲本基因组分配与物种树推断数据集_烟堇属案例
数据集概述 本数据集围绕异源多倍体物种中同源基因向亲本基因组的分配方法展开,旨在解决复杂进化历史下的物种树推断问题。以植物烟堇属(罂粟科)为研究案例,包含用于基因组系统发育分析的序列比对文件及补充说明文档,为多倍体物种的网状进化关系研究提供数据支持。 文件详解 核心序列文件(.nex格式):...



