-
NeoBiota_补充资料_欧洲本土与外来里海_黑海片脚类动物线粒体基因组比较研究_2023年版
数据集概述 本数据集为论文“Comparative mitogenomics of native European and alien Ponto-Caspian amphipods”的补充材料1,包含研究中使用的样本来源及线粒体基因组相关信息,用于支持欧洲本土与外来里海-黑海片脚类的线粒体基因组比较研究,共含一个文件。 文件详解...
-
CHIV_Assembled_chimeric_viruses_Gb_files_病毒基因组数据
数据集概述 本数据集包含13个新发现的嵌合病毒(CHIV)基因组序列,这些病毒由单链RNA病毒和单链DNA病毒重组产生。数据记录了病毒衣壳蛋白(CP)基因从RNA病毒的捕获事件,以及复制蛋白(Rep)基因从不同单链DNA病毒的反复替换过程,为研究病毒进化关系提供基础。 文件详解 文件名称:Assembled_chimeric_viruses_Gb-...
-
Lactiplantibacillus_plantarum_LP8_泰国发酵虾源菌株基因组序列数据
数据集概述 本数据集包含从泰国式发酵虾中分离出的植物乳杆菌LP8菌株的基因组序列相关数据,以补充文档形式呈现,为该菌株的基因组学研究提供基础资料。 文件详解 文件名称:LP8_supplementary.docx 文件格式:DOCX...
-
Chrysomallon_squamiferum_Based鳞脚蜗牛基因组与生物矿化装甲进化研究数据
数据集概述 本数据集包含鳞脚蜗牛(Chrysomallon squamiferum)的全基因组组装、转录组学数据及相关分析结果,旨在揭示生物矿化装甲多样化的基因组机制。数据涵盖基因组序列、注释文件、组织特异性转录组差异表达分析结果等,为研究生物矿化进化提供基础数据。 文件详解 基因组与注释文件...
-
Melange_Pipeline_Roseobacter_sp_EG26基因组COG与Pfam注释数据
数据集概述 本数据集包含通过Melange pipeline生成的Roseobacter sp. EG26菌株基因组的COG(直系同源蛋白簇)和Pfam(蛋白家族)注释结果。该菌株分离自葡萄牙东北大西洋海域的温带八放珊瑚Eunicella...
-
Clostridium_Supplementary_Based_溶剂产生梭菌系统基因组学与遗传分析补充材料
数据集概述 本数据集为溶剂产生梭菌的系统基因组学与遗传分析补充材料,包含David Jones教授工业菌株库中270株溶剂产生梭菌的基因组序列及分析数据,涉及6个物种的系统发育、核心生物合成基因、次级代谢产物等特征,共12个文件,支持溶剂产生菌的工程改造及微生物化学合成研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.md 文件格式:MD...
-
Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据
数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件(TE)注释及质量控制数据,用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件,共27个文件,是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
-
Alternaria_alternata_bZIP_Based_链格孢菌转录因子胁迫响应与致病机制研究数据
数据集概述 本数据集围绕链格孢菌(Alternaria alternata)中bZIP转录因子展开,包含该真菌的基因组序列、基因注释及代谢通路分析文件,覆盖基因功能、KEGG通路、GO注释等信息,为研究其在胁迫响应与致病过程中的作用提供基础数据支撑。 文件详解 基因组序列文件...
-
Oregon_Biodiversity_Genome_Project_俄勒冈鱼类有丝分裂基因组参考数据库数据
数据集概述 本数据集为俄勒冈生物多样性基因组项目产出的鱼类有丝分裂基因组参考数据库,包含313个标本的完整有丝分裂基因组序列,覆盖俄勒冈州24科55属129种淡水、溯河洄游及河口鱼类。数据用于评估有丝分裂基因组在物种鉴定中的价值,为eDNA监测提供区域参考,助力生物多样性管理。 文件详解 文档文件 文件名称:README.md 文件格式:MD...
-
Dryad数据库中Chang_Larracuente基因组研究的黑腹果蝇Y染色体异染色质富集组装数据集_2018
数据集概述 本数据集基于异染色质富集组装策略,揭示黑腹果蝇Y染色体的序列与组织架构。数据补充了果蝇参考基因组的11.9 Mb序列,填补约百分之四十三点八的缺口,包含Y染色体重复序列、基因组织及进化相关信息,涉及crystal-Stellate基因家族的演化史与基因转换分析,共含2个文件。 文件详解 文档文件...
-
微型禾亚科_Micrairoideae_基于禾本科_Poaceae_Eriachneae族叶绿体基因组系统发育及C4光合作用进化研究原始数据集
数据集概述 本数据集包含支持Eriachneae族质体基因组系统发育研究及Micrairoideae亚科C4光合作用进化分析的相关数据,涵盖质体基因组序列、系统发育树、物种分布信息及补充文档,共9个文件,用于探究该类群的系统发育关系、光合途径及生境偏好。 文件详解 质体基因组序列文件(.fsa格式)...
-
RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415
数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料,包含经实验验证的植物NLR(核苷酸结合寡聚化结构域样受体)相关序列、注释及分析结果,涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据,为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件,具体说明如下: - 补充表格文件: -...
-
SARS_CoV_2冠状病毒序列组成复杂性适应性趋势补充数据集
数据集概述 本数据集是论文《SARS-CoV-2冠状病毒大流行期间序列组成复杂性的适应性趋势》的补充数据,包含病毒基因组序列组成复杂性(SCC)分析相关的表格、系统发育树、序列文件等,支持对病毒进化适应性趋势的研究。 文件详解 该数据集包含多个文件和压缩包,具体说明如下: - 补充表格文件: - SupplementaryTables...
-
新冠病毒变异株感染儿童和成人严重程度差异分析数据集
数据集概述 该数据集包含新冠病毒(SARS-CoV-2)基因组序列、相关非个人健康信息(non-PHI)元数据及代码,用于研究不同变异株感染儿童和成人的严重程度差异,支撑相关研究论文分析。 文件详解 文件名称:severity_analyses.zip 文件格式:ZIP压缩包(.zip) 文件内容:压缩包内包含研究所需的SARS-...
-
短吻鼻鱼视觉系统发育数据集
数据集概述 本数据集围绕短吻鼻鱼(Naso brevirostris)视觉系统发育展开,包含其视网膜细胞分布、光感受器细胞密度及视觉基因(视蛋白)表达等相关数据,反映该鱼从幼体到成体阶段视觉系统的变化特征。 文件详解 该数据集包含18个文件,具体说明如下: -...
-
沙丘锈色蛾Luperina_nickerlii亚种leechi基因组序列数据说明补充资料
数据集概述 本数据集是沙丘锈色蛾Luperina nickerlii亚种leechi基因组序列数据说明的补充资料,包含基于LSU分析的研究内容,提供该亚种为ZO雌性的相关证据。 文件详解 文件名称:Supplementary information.pdf 文件格式:PDF(.pdf) 文件内容:包含沙丘锈色蛾Luperina...
-
世界鱼类尼罗罗非鱼精英品系Abbassa基因组功能注释数据集
数据集概述 本数据集提供世界鱼类尼罗罗非鱼精英品系Abbassa基因组组装的功能注释信息,包含基因组序列、功能注释压缩包及HiC互作图谱,为罗非鱼基因组学研究提供基础数据支持。 文件详解 Supplementary_Material_1_functional_annotation.tar.gz:压缩文件,可能包含基因组功能注释的补充材料...
-
普通王蛇物种复合体谱系结构数据集
数据集概述 本数据集围绕普通王蛇物种复合体(Lampropeltis getula)的谱系结构展开,包含基因组序列数据、环境变量数据及分析结果文件,用于研究北美地区气候、地理与历史对其遗传分化及谱系形成的影响。 文件详解 遗传数据文件:...
-
江户明樱蛤染色体水平基因组组装数据集
数据集概述 本数据集为江户明樱蛤的染色体水平基因组组装数据,包含基因组序列、基因家族注释、系统发育树等信息,旨在揭示其血红素生物合成的分子基础,为贝类遗传育种与群体遗传学研究提供基因组资源。 文件详解 该数据集包含多个文件,具体说明如下: - 文档与说明文件: - readme.txt:文本格式,提供数据集标题、作者信息等基础说明 -...
-
农杆菌系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集为拟议新物种Agrobacterium bohemicum sp. nov.的系统发育分析提供完整数据支持,包含基因组序列、基因文件、系统发育树及相关分析文件,覆盖从原始序列到分析结果的全流程数据。 文件详解 该数据集包含82个文件,具体说明如下: - 基因组序列文件: -...



