数据集概述
本数据集包含鳞脚蜗牛（Chrysomallon squamiferum）的全基因组组装、转录组学数据及相关分析结果，旨在揭示生物矿化装甲多样化的基因组机制。数据涵盖基因组序列、注释文件、组织特异性转录组差异表达分析结果等，为研究生物矿化进化提供基础数据。
文件详解
- 基因组与注释文件
- 文件名称：Csq_v1.1.fa.gz、csq_1.1.gff.gz、SFGB1v1.0.maker.transcripts_clean.fa.gz、SFGB1v1.0.maker.proteins_clean.fa.gz
- 文件格式：.gz（压缩格式）
- 字段映射介绍：包含鳞脚蜗牛基因组序列、基因注释信息、转录本序列及蛋白质序列，为基因组结构与功能分析提供基础数据。
- 转录组差异表达分析文件
- 文件名称：Scale_Raw_Deseq_output.txt、OG_Raw_Deseq_output.txt、Mantle_Raw_Deseq_output.txt、Gill_Raw_Deseq_output.txt、Scale_result_Kairei_vs_Solitaire.txt、Mantle_result_Kairei_vs_Solitaire.txt
- 文件格式：.txt
- 字段映射介绍：包含组织特异性（鳞片、外套膜、鳃等）转录组差异表达分析结果，字段包括基因ID、表达量均值（Mean_Scale、Mean_Others等）、表达变化量（Mean_Change）、对数倍数变化（LogFC）、P值（Pvalue）、校正后P值（FDR）等。
- 注释表格文件
- 文件名称：SFG_annotation_Table.xlsx
- 文件格式：.xlsx
- 字段映射介绍：包含鳞脚蜗牛基因组注释相关的结构化表格数据，具体字段未明确，但推测为基因功能注释、分类等信息。
数据来源
论文“The scaly-foot snail genome and the ancient origins of biomineralised armour”
适用场景
- 生物矿化装甲进化研究: 分析鳞脚蜗牛基因组中与生物矿化装甲形成相关的基因及调控机制。
- 基因组功能注释: 利用基因组序列与注释文件，开展基因结构、功能及进化分析。
- 组织特异性基因表达研究: 通过转录组差异表达数据，探究鳞片、外套膜等组织在生物矿化过程中的基因表达模式。
- 铁化合物生物合成机制研究: 基于基因组与转录组数据，揭示鳞脚蜗牛铁注入骨骼的分子机制。
- 生物矿化工具包进化分析: 比较鳞脚蜗牛与其他冠轮动物基因组，研究生物矿化工具包的进化历史。
