找到52个数据集

标签: 差异表达分析

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  • 益生菌共培养环境_基因表达差异分析数据

    2026年2月10日 30 47 13

    数据集概述 本数据集包含益生菌在单培养、共培养、pH控制单培养三种环境下的基因芯片原始信号数据及差异表达分析结果。原始数据通过Feature Extraction软件量化,差异分析使用limma工具完成,共含十六份文件,用于研究培养环境对益生菌应激耐受性和胃肠道生存能力的影响。 文件详解 原始基因芯片信号数据(TXT格式)...
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  • 昆虫CHC分化_脂肪酸合酶与延长酶进化研究数据

    2026年2月1日 30 88 52

    数据集概述 本数据集围绕两种同域蚱蜢物种(Chorthippus biguttulus和C. mollis)表皮碳氢化合物(CHCs)分化展开,分析昆虫脂肪酸合酶(FAS)与延长酶的进化特征,包括CHC甲基分支差异、基因家族扩张及转录水平差异,为昆虫生殖隔离分子机制研究提供支撑。 文件详解 Count matrix DE analysis.xlsx...
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  • Dryad_豆科_根瘤菌共生基因组互作转录组数据

    2026年2月1日 30 84 41

    数据集概述 本数据集包含蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)四个基因型与两种根瘤菌(Ensifer meliloti、E. medicae)共生后的根瘤转录组数据,涉及宿主、共生菌及二者互作对基因表达的影响,涵盖差异表达分析结果、基因功能注释、表型数据等,共24个文件,用于揭示豆科-根瘤菌共生中基因组互作的分子机制。 文件详解...
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  • EoRNA_Based_大麦基因转录本丰度数据库数据

    2026年1月31日 30 168 10

    数据集概述 本数据集基于大麦参考转录本数据集BaRTv1.0,整合22项RNA-seq实验的843个样本数据,构建大麦基因表达数据库EoRNA。包含基因和转录本丰度(TPM值)、基因模型信息,支持通过基因名或BLAST查询,可用于分析品种、组织及条件特异性表达与可变剪接,提供可视化与数据提取功能。 文件详解...
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  • VSOP_Based_人类单核细胞转录组及元数据_研究数据集

    2026年1月29日 30 129 123

    数据集概述 本数据集包含转录组原始计数数据及配套元数据,用于复现Hussein等人关于极小超顺磁性氧化铁颗粒(VSOP)对人类单核细胞表型和功能影响的研究分析。数据集共3个文件,涵盖全血和单核细胞的转录组原始数据及实验元数据。 文件详解 文件名称:metadata_wholeblood.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • RNA_seq_Based_转录组组装与差异表达量化策略评估数据

    2026年1月28日 30 95 28

    数据集概述 本数据集为RNA-seq实验转录组组装与差异表达量化的模拟评估数据,包含16个文件,涵盖脚本、代码及压缩包。用于探究转录组特征、技术处理及生物信息学流程对转录组质量和差异表达推断的影响,为RNA-seq实验设计与分析提供方法学参考。 文件详解 代码脚本文件...
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  • 转录组分析_免疫组织中特定基因的表达数据_三刺鱼在湖河栖息地的研究成果

    2026年1月26日 30 167 129

    数据集概述 本数据集为三刺鱼湖河栖息地免疫组织转录组分析数据,包含四地野生三刺鱼的头肾、脾脏组织转录组文库,涉及基因表达计数、差异表达分析及功能富集结果,用于探究湖河栖息地寄生虫压力下的基因表达差异,共6个文件。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_count_htseq.txt 文件格式:TXT...
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  • Melatonin_Mice_Ovary_RNA_Seq_基因表达数据

    2026年1月26日 30 200 116

    数据集概述 本数据集为褪黑素处理小鼠卵巢的RNA测序数据,通过对10日龄小鼠注射褪黑素至17日龄后采集卵巢样本测序,用于研究褪黑素对小鼠早期卵泡生长的影响。数据集仅包含一个压缩文件。 文件详解 文件名称:RNA-seq_result.zip 文件格式:ZIP...
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  • nf_core_rnaseq_Based_RNA_seq计数表测试数据

    2026年1月26日 30 207 184

    数据集概述 本数据集是基于GSE40419肺腺癌研究数据,通过nf-core/rnaseq流程生成的RNA-seq计数表示例,用于下游RNA-seq分析测试。包含22个文件,涵盖基因和转录本水平的表达结果、合并后的计数与TPM值文件、元数据及质控报告等,支持基因表达分析相关工具的测试验证。 文件详解 单样本结果文件...
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  • Acropora_Based_珊瑚幼虫红色荧光与滞育状态关联研究数据

    2026年1月23日 30 29 27

    数据集概述 本数据集围绕造礁石珊瑚Acropora millepora幼虫的荧光形态展开,包含三种荧光形态幼虫在不同光处理下的基因表达数据,以及相关功能分析结果,旨在探究红色荧光与幼虫扩散潜力、滞育状态的关联,为珊瑚幼虫扩散的分子机制研究提供支撑。 文件详解 基因表达与功能分析类文件 文件名称:KOGtableDeltaRanks.csv...
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  • rna_seq_0hr_08092019_Based_Volcano样本0小时转录组测序数据

    2026年1月17日 30 204 0

    数据集概述 本数据集为Volcano样本在0小时时间点的RNA-seq转录组测序数据,包含1个文件,无目录层级结构,未区分训练/测试、数据/标签或原始/处理数据类型,文件格式统一为.xlsx。 文件详解 文件名称:RNA-seq data for Volcano_0h.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Dryad_Hamilton_etal_果蝇防御共生转录响应研究数据集

    2026年1月22日 30 107 77

    数据集概述 本数据集围绕果蝇(Drosophila neotestacea)与共生菌Spiroplasma的防御共生关系展开,通过定量PCR和转录组测序探究共生菌抵御线虫寄生虫(Howardula aoronymphium)的机制,重点分析毒素生产、竞争及免疫激活三种可能模式,为昆虫可遗传防御共生机制研究提供数据支持。 文件详解...
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  • Nucella_lapillus_内分泌干扰机制研究转录组与体内实验数据

    2026年1月22日 30 174 73

    数据集概述 本数据集围绕海洋指示生物狗岩螺(Nucella lapillus)的内分泌干扰机制展开,整合转录组学与体内实验数据,揭示三丁基锡(TBT)诱导性畸变(imposex)的分子机制,发现过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)通路的潜在作用,为脊椎动物与无脊椎动物内分泌干扰信号通路的共性研究提供数据支持。 文件详解...
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  • Cardiocondyla_Based_蚁后异地交配免疫反应与寿命研究数据

    2026年1月21日 30 6 2

    数据集概述 本数据集记录了蚂蚁Cardiocondyla obscurior蚁后与同域/异地雄蚁交配后的寿命、繁殖成功率差异及转录组变化。包含3个文件,涉及交配后蚁后免疫基因表达、寿命及繁殖数据,用于揭示雌雄协同进化对蚁后适合度的影响机制。 文件详解 繁殖与寿命数据文件 文件名称:fitness_data.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • high_altitude_Based_急性高海拔暴露炎症基因表达研究数据

    2026年1月21日 30 167 55

    数据集概述 本数据集记录了15名健康海平面居民在急性高海拔暴露三天内的炎症基因表达变化,通过RNA测序和NanoString数字mRNA检测技术,分析炎症相关基因及通路(如NF-kB、TLR信号)的表达差异,以及部分基因与急性高山病(AMS)和血氧饱和度的关联,共包含4个文件。 文件详解...
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  • TGIRT_seq_Based炎症性乳腺癌肿瘤与血液样本转录组分析补充数据

    2026年1月21日 30 10 2

    数据集概述 本数据集为炎症性乳腺癌肿瘤与血液样本TGIRT-seq分析的补充文件,包含测序数据的比对统计、差异表达分析、峰值检测及IDR分析结果,揭示转录增强对RNA剪接和血浆内含子RNA的影响,共含1个文件。 文件详解 文件名称:SupplementalFile.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含四类分析结果: 比对统计(mapping...
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  • Arbacia_lixula_Based_地中海海胆组织转录组与基因表达数据

    2026年1月20日 30 130 37

    数据集概述 本数据集为地中海生态关键物种Arbacia lixula的转录组与基因表达数据,包含体组织(体腔细胞、消化组织)和生殖组织(卵巢、睾丸)的转录组测序结果,以及从头组装的参考转录组和差异表达分析结果,共186084条转录本,可用于研究该物种的组织特异性基因表达及进化适应机制。 文件详解 Arbacia...
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  • Anguilla_anguilla_嗅觉上皮_性成熟阶段化学感应受体表达数据

    2026年1月20日 30 177 59

    数据集概述 本数据集包含欧洲鳗鲡(Anguilla anguilla)不同生命阶段(淡水、海水、性成熟雄性)嗅觉上皮的转录组测序数据及基因表达分析结果,聚焦性成熟阶段特异性表达的化学感应受体(TAAR、OR、V1R、V2R)及GPCR信号转导基因,共含4个文件。 文件详解...
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  • BAC_Disinfectants_Based新生鼠脑脂质稳态多组学研究数据

    2026年1月20日 30 186 53

    数据集概述 本数据集基于多组学研究,探究苯扎氯铵(BAC)消毒剤对新生鼠脑脂质与固醇稳态的影响。通过转录组学与质谱分析,揭示BAC经胎盘屏障进入新生鼠脑后,对胆固醇生物合成、LXR/RXR信号通路及脂质代谢的干扰机制,为BAC的发育神经毒性研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:Neonatal brain transcriptome...
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  • Dryad_Nebria_vandykei_高山步甲虫环境适应与进化研究数据

    2026年1月20日 30 119 22

    数据集概述 本数据集围绕高山步甲虫Nebria vandykei的环境适应展开研究,包含RNA测序分析的环境胁迫响应分子通路、与近缘物种的进化关系分析,以及高低海拔种群间正选择作用的检测结果,涉及冷、热、干旱胁迫下的基因表达与适应性进化机制。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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