数据集概述
本数据集包含欧洲鳗鲡(Anguilla anguilla)不同生命阶段(淡水、海水、性成熟雄性)嗅觉上皮的转录组测序数据及基因表达分析结果,聚焦性成熟阶段特异性表达的化学感应受体(TAAR、OR、V1R、V2R)及GPCR信号转导基因,共含4个文件。
文件详解
- 文件名称:
README_for_Aanguilla_olfactory_epithelium_transcriptome_assembly.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供嗅觉上皮转录组组装数据的说明文档,包含数据来源、处理方法等背景信息
- 文件名称:
README_for_Aanguilla_olfactory_expression_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明基因表达数据的归一化方法、样本分组(淡水FW/海水SW/性成熟SM)及BLAST比对结果(Refseq蛋白GI号、描述)等
- 文件名称:
Aanguilla_olfactory_epithelium_transcriptome_assembly.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:嗅觉上皮转录组组装的核苷酸序列文件,包含13个TAAR、112个OR、6个V1R、38个V2R等化学感应受体的全长转录本
- 文件名称:
Aanguilla_olfactory_expression_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:中位归一化的基因表达量数据,含不同生命阶段的表达值、BLAST比对注释信息及差异表达分析结果
数据来源
论文“Deep sequencing of the olfactory epithelium reveals specific chemosensory receptors are expressed at sexual maturity in the European eel Anguilla anguilla”
适用场景
- 鱼类嗅觉系统发育研究:分析不同生命阶段化学感应受体的表达变化,探究嗅觉功能与生命周期的关联
- 繁殖相关基因筛选:识别性成熟阶段特异性表达的OR、V2R等受体基因,研究其在繁殖行为中的作用
- GPCR信号通路分析:解析不同生命阶段GPCR信号转导基因的差异表达模式,探索信号通路调控机制
- 分子进化研究:基于早期分支硬骨鱼类的转录组数据,分析化学感应受体基因家族的进化历程