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Onychostoma_lepturum_淡水鱼类线粒体基因组特征与系统发育分析补充数据
数据集概述 本数据集为淡水鱼类细尾白甲鱼(Onychostoma lepturum)线粒体基因组研究的补充材料,来自论文“Complete mitochondrial genome of the freshwater fish Onychostoma lepturum (Teleostei, Cyprinidae): genome...
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Galaxy_Training_Network_JBrowse基因组数据可视化教程数据集
数据集概述 本数据集是Galaxy Training Network中JBrowse基因组数据可视化教程的配套数据,包含10个不同类型的基因组相关文件,覆盖DNA测序、RNA-Seq、基因注释、变异数据等内容,用于支持JBrowse工具的可视化操作训练与实践。 文件详解 基因组序列文件 文件名称:genome.fa 文件格式:FA...
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Tetranychus_urticae_Tomato_Based宿主适应转录组研究完整数据
数据集概述 本数据集基于二斑叶螨(Tetranychus urticae)适应番茄宿主的实验,记录了植食性昆虫与宿主植物在适应性过程中的转录组变化。实验将叶螨从豆类转移至番茄繁殖30代,通过对比适应与非适应叶螨及其对番茄的影响,揭示宿主适应相关的基因表达调控机制。数据集包含6份文件,涵盖基因注释、转录组差异分析及宿主植物损伤数据。 文件详解...
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Gasterosteus_nipponicus_日本海棘鱼neo_Y染色体有害突变积累研究数据
数据集概述 本数据集聚焦日本海棘鱼(Gasterosteus nipponicus)neo-Y染色体的有害突变积累情况,通过分析其非重组区域的非同义突变,探究年轻neo-Y染色体的退化进程,为鱼类同形性染色体的进化研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:List_of_deleterious_mutations.zip 文件格式:ZIP...
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HSV_Ancient_recombination_events_HSV病毒进化与重组研究数据
数据集概述 本数据集包含人类单纯疱疹病毒1型(HSV-1)和2型(HSV-2)的基因组相关数据,用于研究两者间的古老重组事件及HSV-2的进化历史。数据支持分析HSV-2的两个主要谱系(撒哈拉以南非洲谱系和全球分布谱系)特征,以及全球谱系与HSV-1的重组机制,共包含2个压缩文件。 文件详解 文件名称:alignments.zip 文件格式:ZIP...
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戈氏拟杆菌_Stenotrophomonas_goyi_补充文件_细菌基因组与基因注释补充数据
数据集概述 本数据集包含原手稿“Stenotrophomonas goyi sp. nov., a novel bacterium associated with the alga Chlamydomonas reinhardtii”的两份补充表格,分别为Stenotrophomonas...
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Brentisentis_yangtzensis_Source_线粒体基因组分子数据_2019
数据集概述 本数据集为杨茨布伦线虫(Brentisentis yangtzensis Yu & Wu, 1989)的完整线粒体基因组分子数据,是相关研究论文的补充材料,用于支持该物种线粒体基因组的特征分析,为棘头动物(Acanthocephala)的分子遗传学研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:oo_315160.xlsx...
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补充材料_基于天牛科Batocera_horsfieldi线粒体基因组的系统发育分析_2023年
数据集概述 本数据集为论文《Characterization of the complete mitochondrial genome of the longhorn beetle, Batocera horsfieldi (Coleoptera, Cerambycidae) and its phylogenetic analysis with...
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Domain_Scanning_Based_人类转录因子基因高质量注释蛋白亚型结构域扫描结果数据
数据集概述 本数据集包含针对人类转录因子基因产生的一组高质量注释蛋白亚型的结构域扫描结果,通过对特定蛋白亚型的结构域分析,为研究转录因子蛋白的功能结构提供基础数据支持,数据集仅包含一个文件。 文件详解 文件名称:Table_S3.xlsx 文件格式:XLSX...
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OGRDB_Mouse_IGH_Germline_Reference_Set_LEWES_EiJ
数据集概述 本数据集为小鼠LEWES/EiJ品系的IGH基因胚系参考集,包含4个文件,涉及许可说明、带间隙/无间隙的FASTA序列文件及JSON格式数据,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),用于生物信息学领域的基因研究。 文件详解 licence.txt 文件格式:TXT...
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Single_strain_control_of_microbial_consortia_研究数据
数据集概述 本数据集包含论文"Single strain control of microbial consortia"中呈现的质粒图谱、微孔板读数仪、流式细胞术、模拟和图像数据,共6个文件,主要为质粒图谱文件和一个压缩包文件,用于支持微生物群落单菌株控制的研究。 文件详解 质粒图谱文件(共5个)...
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Metagenomics_Based_Elkhorn_Slough微生物垫宏基因组分箱与注释数据集
数据集概述 本数据集为Elkhorn Slough微生物垫宏基因组分箱与注释的补充测序及注释数据,包含3个共组装数据集的MG-RAST注释、不同k-mer值(k29、k45、k63)共组装的 scaffolds 及Prodigal预测ORFs,以及用于分箱的scaffold覆盖度和注释信息,共5个压缩文件。 文件详解...
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CoralReefBacterioplankton_MAGs_Based_珊瑚礁浮游细菌基因组数据
数据集概述 本数据集包含27个珊瑚礁浮游细菌的宏基因组组装基因组(MAGs),对应论文“Excess labile carbon promotes the expression of virulence factors in coral reef bacterioplankton”的研究数据,用于支持珊瑚礁环境中浮游细菌毒力因子表达机制的分析。...
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Chrysomallon_squamiferum_Based鳞脚蜗牛基因组与生物矿化装甲进化研究数据
数据集概述 本数据集包含鳞脚蜗牛(Chrysomallon squamiferum)的全基因组组装、转录组学数据及相关分析结果,旨在揭示生物矿化装甲多样化的基因组机制。数据涵盖基因组序列、注释文件、组织特异性转录组差异表达分析结果等,为研究生物矿化进化提供基础数据。 文件详解 基因组与注释文件...
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CK2_Supplementary_Table_2_分子功能细胞组分生物过程Fisher检验补充数据
数据集概述 本数据集为CK2相关的补充表格2,包含通过Fisher检验得到的富集分子功能、细胞组分及生物过程信息,是分子生物学研究中基因功能富集分析的结构化参考资料,仅含一个文件。 文件详解 文件名称:Supplementary_table_2.docx 文件格式:DOCX...
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ECG_GWAS_Prioritization_Based_心电全基因组关联研究优先分析完整结果数据
数据集概述 本数据集为心电(ECG)全基因组关联研究(GWAS)优先分析的完整结果,包含1个文件,主要记录该分析的所有输出信息,为生物医学研究人员提供结构化的GWAS分析参考数据,便于了解ECG相关遗传位点的优先排序结果。 文件详解 文件名称:Table S3_ECGGWAS_full_221103.xlsx 文件格式:XLSX...
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Lucania_genetic_linkage_maps_and_synteny_基因组分化研究数据
数据集概述 本数据集包含两种近缘鳉鱼(Lucania goodei和L. parva)的遗传连锁图谱与同线性分析数据,涉及染色体核型分析、高密度SNP连锁图谱构建及物种间染色体融合事件验证,为研究物种分化伴随的基因组变化、生殖隔离遗传机制及盐度耐受性提供基础数据。 文件详解 文件名称:README_for_454large300Contigs.docx...
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Squalius_pyrenaicus_Based_伊比利亚濒危鲤科鱼类繁殖器官转录组数据_基因组资源
数据集概述 本数据集为伊比利亚特有濒危鲤科鱼类(Squalius pyrenaicus)繁殖相关器官的从头组装转录组数据,包含雌雄个体脑和性腺组织的转录组序列、基因注释及GO功能注释信息,可用于研究该物种性别决定机制、繁殖相关基因功能及进化特征,为濒危物种保护提供基因组资源支持。 文件详解 非冗余转录本序列文件...
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Providencia_manganoxydans_Based_虾源菌株功能与可移动遗传元件分析数据集
数据集概述 本数据集是虾源Providencia manganoxydans菌株的功能与可移动遗传元件分析数据,该菌株具有将可溶性锰[Mn(II)]氧化为不溶性锰[Mn(IV)]的独特能力,可用于锰富集环境的解毒。全基因组原始测序数据已存入NCBI GenBank和SRA数据库,数据集含1个文件。 文件详解 文件名称:Genomic data.docx...
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ZooKeys_Supplementary_material_日本天蛾线粒体基因注释列表数据_2018
数据集概述 本数据集为论文《日本天蛾(Theretra japonica)完整线粒体DNA特征及其在天蛾科(鳞翅目)中的系统发育地位》的补充材料2,包含日本天蛾线粒体基因的注释列表,是研究该物种线粒体基因组结构及天蛾科系统发育的基础数据。 文件详解 文件名称:oo_201070.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:包含日本天蛾(Theretra...



