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Dryad_Chavhan_et_al_大肠杆菌种群大小与环境波动交互作用研究数据
数据集概述 本数据集为大肠杆菌实验进化研究的配套数据，聚焦无性繁殖生物适应成本的理论与实验差异问题。通过在不同种群大小和环境波动条件下的实验，探究种群大小与环境波动的交互作用对适应成本的影响机制，为理论预期与实验结果的矛盾提供新解释。 文件详解 文件名称：Chavhan_et_al_Dryad_Eco_Letters.xlsx 文件格式：XLSX...
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Escherichia_coli_Based_长期进化实验基因型与频率依赖交互数据
数据集概述 本数据集源自大肠杆菌25年（60,000代）长期进化实验，聚焦Ara−1种群。通过分析每500代冷冻的全种群样本中42个已知突变，重建该种群20,000代内的基因型进化史，揭示选择性清除、克隆干扰及频率依赖交互等进化动力学特征，含2个压缩文件。 文件详解 文件名称：Ara-1_Genotyping-DRYAD.zip 文件格式：ZIP...
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Karpetal_Based_加州有机农场农业实践对害虫控制及生菜产量影响研究数据
数据集概述 本数据集为加州中央海岸有机农场的景观尺度田间实验数据，探究食品安全导向的农业实践（堆肥应用、半自然植被移除）对害虫控制服务、生菜产量及节肢动物多样性的影响，包含实验数据及说明文档。 文件详解 数据文件： 文件名称：Karpetal_PestControl_Data.xlsx 文件格式：XLSX...
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RSOS_REF17113_Based_银纳米颗粒医疗设备涂层剂多步骤筛选原始数据
数据集概述 本数据集为银纳米颗粒医疗设备涂层剂筛选研究的原始数据，包含四种不同涂层成分与浓度的银纳米颗粒的抗菌活性、细胞毒性及理化特性数据。通过多步骤方法评估其在医疗场景中的适用性，旨在平衡抗菌效果与人体安全性，为医疗设备涂层剂的候选筛选提供支持。 文件详解 文件名称：RAW DATA RSOS-REF17113.xlsx 文件格式：XLSX...
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capIC_MS_MS_Based_大肠杆菌环丙沙星处理代谢物定量研究数据2022
数据集概述 本数据集通过毛细管离子色谱串联质谱（capIC-MS/MS）技术，定量分析经环丙沙星、新型抗菌肽BTP-001及二者联用处理后的大肠杆菌的磷酸化代谢物、有机酸和三羧酸循环（TCA）中间体。数据包含代谢物浓度、归一化处理结果及统计分析相关信息，支持微生物代谢响应机制研究。 文件详解...
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埃希氏大肠杆菌与志贺氏杆菌引发的帕金森病_阑尾感染与外周免疫功能障碍的关联研究数据
数据集概述 本数据集为帕金森病研究相关数据，聚焦阑尾的大肠杆菌-志贺氏菌感染与帕金森病患者外周免疫障碍的关联，包含1个数据文件，可支持医学研究人员探索该感染与疾病免疫机制的潜在关系。 文件详解 文件名称：Date.xlsx 文件格式：XLSX...
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PONE_D_17_11810_Based_质粒介导大肠杆菌基因表达系统流式细胞术数据
数据集概述 本数据集包含一个压缩包，内有用于生成论文“A plasmid-based Escherichia coli gene expression system with cell-to-cell variation below the extrinsic noise...
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Project_Tycho_Based_美国2000_2010大肠杆菌感染报告病例数据
数据集概述 本数据集为Project Tycho项目下的美国2000-2010年大肠杆菌感染报告病例数据，包含特定疾病条件的病例计数，数据从美国疾控中心等权威卫生机构提取，经标准化处理（添加疾病、地点标识符），保留原始计数未修改，含不同报告来源、获取地点等维度的病例时间序列。 文件详解 文件名称：US.71057007.xml 文件格式：XML...
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Plasticity_Epistasis_大肠杆菌代谢基因缺失适应性实验数据_2015
数据集概述 本数据集聚焦大肠杆菌代谢基因缺失后的适应性研究，记录了缺失1-3种氨基酸生物合成基因的突变株与野生型在不同碳源环境中的竞争适应性数据，用于分析可塑性和上位性对细菌适应性的影响，为理解细菌基因组精简机制提供实验依据。 文件详解 文件名称：Relative_fitness_Epistasis_Dsouza_et_al_2015.xlsx...
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RT_qPCR_Based_基因表达dCT值数据_结肠_小肠_肝脏及结肠类器官_数据集
数据集概述 本数据集包含RT-qPCR检测的基因表达dCT值，样本来源为无菌小鼠单定植表达胆汁盐水解酶的大肠杆菌后，其结肠、小肠、肝脏组织及结肠类器官（经胆汁酸、LPS或两者混合处理）。对照组包括定植非BSH表达大肠杆菌的小鼠、未定植小鼠及常规饲养小鼠，数据以β-肌动蛋白为内参进行标准化。 文件详解 文件名称：RTqPCR dCT BSH.xlsx...
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PETases_PHL7_PHL7mut3_Based嗜热PET酶大肠杆菌制备原始数据
数据集概述 本数据集记录了利用大肠杆菌制备高活性嗜热PET酶PHL7及其突变体PHL7mut3的相关原始数据，包含1个Excel格式文件，无目录结构，未划分训练测试集、数据标签集或原始处理集，文件类型单一。 文件详解 文件名称：AllRawData_forPublication.xlsx 文件格式：XLSX...
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Dryad_Arias_Hall_v3_抗生素耐药性对细菌噬菌体进化响应影响数据_v3
数据集概述 本数据集来自研究“抗生素耐药性等位基因对细菌响应病毒寄生虫的进化影响”，包含大肠杆菌（含8种耐药基因型及突变体）暴露于不同裂解性噬菌体后，960个种群的密度变化、噬菌体敏感性数据，以及细菌基因型差异与无寄生虫时生长速率、噬菌体抗性突变率的关联分析结果，共1个文件。 文件详解 文件名称：Dryad_Arias_Hall_v3.xlsx...
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Dryad_Based_大肠杆菌突变类型与基因多效性交互作用驱动实验进化平行性研究数据
数据集概述 本数据集围绕大肠杆菌实验进化平行性的核心问题，通过元分析探究基因多效性与突变类型的交互作用对进化可重复性的影响。数据支持验证“单核苷酸多态性（SNPs）通过靶向高多效性基因产生更大适应度收益”的假设，为理解进化重复机制提供遗传架构层面的证据。 文件详解 压缩文件 文件名称：Dryad.zip 文件格式：ZIP...
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MBR_PAC_Based_污水处理厂MBR_PAC耦合系统OMPs去除数据_2023
数据集概述 本数据集记录了全规模膜生物反应器（MBR）耦合粉末活性炭（PAC）系统对232种有机微污染物（OMPs）的去除性能，包含系统运行条件、常规污染物浓度、OMPs浓度及UHPLC-QTOF-MS分析数据，通过对比不同PAC投加浓度（0.1g/L、0.2g/L）下的处理效果，评估PAC对OMPs去除效率的提升作用。 文件详解...
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Altruism_Bacteria_Suicide_大肠杆菌噬菌体感染利他行为研究数据
数据集概述 本数据集围绕大肠杆菌在噬菌体感染时的自杀行为展开，验证低亲缘关系下利他行为的进化可能性。包含实验数据、分析脚本及说明文档，记录细菌自杀对存活个体的益处与自身成本，支持低代价利他行为作为宿主防御策略的研究，共31个文件。 文件详解 说明文档类（.txt）...
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Escherichia_coli_Growth_Optical_Density_Data
数据集概述 本数据集包含大肠杆菌在不同温度和不同葡萄糖浓度培养基中生长过程产生的光密度数据，共4个文件，均为xlsx格式，用于记录微生物生长实验的关键指标。 文件详解 文件名称：Repo2pct.xlsx 文件格式：xlsx 字段映射介绍：推测包含2%葡萄糖浓度条件下大肠杆菌生长的光密度数据，可能涉及时间、温度、光密度值等字段...
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查万等人_基于Dryad平台的遗传学研究_大肠杆菌种群规模与适应性权衡及生态特化研究数据
数据集概述 本数据集为大肠杆菌种群大小与适应性权衡关系的实验进化研究数据，探讨不同种群大小对适应性权衡和生态特化的影响。通过在两种营养限制环境中培养不同大小的大肠杆菌种群，从三个视角分析适应性权衡，并扩展至六种环境对验证结果普适性，揭示种群大小与适应性代价、生态特化的关联。 文件详解...
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Escherichia_coli_Based大肠杆菌50000代实验进化细胞形态变化数据
数据集概述 本数据集记录大肠杆菌在五万代实验进化过程中的细胞大小与形状变化，包含祖先菌株及12个种群在两千、一万和五万代时的静止期细胞体积测量数据，以及五万代指数生长期的补充测量。通过库尔特计数器和显微镜分析细胞体积分布与形态，结合基因组序列数据，揭示细胞形态进化趋势及相关基因变异。 文件详解 README文档 文件名称：README-cell-...
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Obligate_Mutualistic_Cooperation大肠杆菌进化适应性研究数据
数据集概述 本数据集围绕大肠杆菌专性互利共生合作的进化适应性展开，包含通过抗生素选择实验获取的相关数据。实验对比了依赖氨基酸交换的共培养互利共生菌株与自主生长菌株在环境压力下的适应能力，揭示了专性互利共生对生物进化适应能力的限制及共生关系崩溃现象。 文件详解 图表文件（Excel格式） 文件名称：Supplemental Fig....
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Plasmid_Design_Based_可调控双酶共表达质粒设计_纤维二糖全细胞生产数据
数据集概述 本数据集为论文“Plasmid design for tunable two-enzyme co-expression promotes whole-cell production of...
