数据集概述
本数据集聚焦大肠杆菌代谢基因缺失后的适应性研究,记录了缺失1-3种氨基酸生物合成基因的突变株与野生型在不同碳源环境中的竞争适应性数据,用于分析可塑性和上位性对细菌适应性的影响,为理解细菌基因组精简机制提供实验依据。
文件详解
- 文件名称:Relative_fitness_Epistasis_Dsouza_et_al_2015.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含大肠杆菌不同代谢基因缺失突变株(缺失1-3种氨基酸生物合成基因)与原养型野生型在两种碳源环境中的相对适应性数据,涉及上位性互作、可塑性效应及适应性变化趋势等核心实验结果。
数据来源
论文“Plasticity and epistasis strongly affect bacterial fitness after losing multiple metabolic genes”
适用场景
- 微生物适应性研究:分析代谢基因缺失对大肠杆菌适应性的影响及上位性互作模式。
- 基因组精简机制探究:研究细菌丢失“必需”代谢基因的选择优势及驱动因素。
- 代谢网络进化分析:结合1432个细菌代谢网络的计算分析结果,探索营养缺陷型组合的共存规律。
- 环境适应性机制研究:比较不同碳源环境下细菌适应性的差异,揭示环境因素对代谢基因缺失适应性的调节作用。