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爵床科系统发育与洲际间断分布研究数据集
数据集概述 本数据集围绕爵床科（Acanthaceae）的系统发育与生物地理研究展开，包含基于化石校准的分化时间分析结果、洲际间断分布模拟测试文件及相关可视化图表，为揭示爵床科演化历史与地理分布模式提供数据支持。 文件详解 系统发育分析文件（.xml格式，共4个）： Analysis4A_no max age.xml、Analysis4B_max...
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Dixonius属ND2基因序列未校正p距离数据表
数据集概述 本数据集为Dixonius属不同物种间及物种内ND2基因序列的未校正p距离（百分比）表格。数据包含16个Dixonius物种或种群的基因序列比对结果，展示了物种间（下三角）及物种内（对角线）的遗传距离，为该属物种的分类与系统发育研究提供遗传数据支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 内容说明:...
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Laparocerus属系统发育时间树补充材料3
数据集概述 本数据集为《Laparocerus属系统发育分析》研究的补充材料3，包含基于MEGA7生成的Laparocerus属（鞘翅目象甲科）时间树（Chronogram），记录了该属在马卡罗尼西亚地区的分化时间及置信区间，支持岛屿殖民化与物种多样化研究。 文件详解 文件名称: oo_120904.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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兽脚类恐龙化石不同尖端定年方法的拓扑结构_分化时间与宏进化推断数据集
数据集概述 该数据集围绕兽脚类恐龙化石的尖端定年分析展开，对比不同尖端定年方法（如BEAST2）与传统后验时间校准方法（如cal3）的结果差异，探究其对系统发育拓扑结构、分化时间及宏进化推断（如体型演化模式）的影响，为古生物学研究提供多方法定年的对比数据支持。 文件详解 该数据集包含23个文件，主要类型及内容如下： - 文档与说明文件: -...
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亚洲叶生蛙属Leptobrachella进化时间尺度补充材料
数据集概述 该数据集是关于亚洲叶生蛙属（Leptobrachella）进化时间尺度的补充材料，源自对该属物种多样化爆发及动态的研究，包含一张图片文件，为相关进化生物学研究提供可视化支持。 文件详解 文件名称: oo_1242033.png 文件格式: PNG（.png） 内容说明:...
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伊朗_图兰区单籽黄精属起源与分化研究数据集
数据集概述 本数据集围绕单籽黄精属（Gagea）的起源与分化展开研究，聚焦伊朗-图兰（IT）植物区系。通过分析核糖体DNA ITS区域及叶绿体基因间隔区序列，结合生物地理分布重建，揭示该属起源于西南亚，于早中新世开始分化，并逐步扩散至地中海、东亚、欧亚大陆等区域的时空演化过程。 文件详解 文件名称:...
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蝴蝶分化时间贝叶斯分析先验与后验数据集
数据集概述 本数据集为Chazot等人2018年关于蝴蝶分化时间贝叶斯分析的研究数据，包含分类单元列表、分子矩阵、不同分析条件下生成的时间校准树等内容，支持蝴蝶演化时间研究的复现与扩展分析。 文件详解 分类单元与基因信息文件： S_1_List_of_taxa.xlsx：Excel格式，包含研究涉及的分类单元名称及对应的Genbank登录号...
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Dixonius属物种ND2基因序列差异数据表
数据集概述 本数据集为Dixonius属部分物种基于1396碱基对ND2基因及其侧翼tRNA序列的两两序列差异表，呈现不同物种间的遗传分化程度，支持柬埔寨西部喀斯特群岛新物种的分类学研究。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 内容说明: 包含Dixonius属12个类群（含新种noctivagus sp....
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被子植物系统发育化石花整合数据集
数据集概述 该数据集围绕被子植物系统发育研究，整合化石花的分子与形态学证据，包含24个化石花的系统发育位置分析数据，涵盖1201种现存被子植物的30个花部性状及分子骨架数据，支持多种系统发育分析方法验证。 文件详解 文献与说明文件：...
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珊瑚礁鱼类扩散能力与种群遗传结构及物种丰富度关联数据集
数据集概述 本数据集围绕珊瑚礁鱼类扩散能力展开，涵盖其种群遗传结构与物种丰富度的关联数据。通过对比底栖护卵型和浮游产卵型两种繁殖策略鱼类的基因流、种群分化及物种多样性差异，为揭示微进化与宏进化过程的连续性提供数据支持。 文件详解 系统发育树文件：...
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普罗斯曼蛇属分类学综述表3数据集_16S和cyt_b基因序列分歧值
数据集概述 本数据集为普罗斯曼蛇属（Prosymna）分类学综述中的表3，包含16S和cyt-b两个基因片段的序列分歧值（未校正成对距离）。数据区分种内、种间分歧及标准误差，支持普罗斯曼蛇属物种分类研究，特别是新种描述的分子证据分析。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...
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分子进化速率时间依赖性研究数据集
数据集概述 本数据集围绕分子进化速率是否存在时间依赖性的争议问题展开，通过分析灵长类线粒体基因组不同选择约束位点的进化速率差异，揭示约束位点（非同义位点、D-loop、RNA）进化速率存在量级变化，而同义位点速率稳定，不受时间尺度影响。 文件详解 数据集包含一个PDF格式的文档文件，具体如下： - 文件名称:...
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IQ2MC系统发育时间树推断框架原始数据集
数据集概述 本数据集为论文“IQ2MC: A New Framework to Infer Phylogenetic Time Trees Using IQ-TREE 3 and MCMCTree with Mixture Models”的原始数据，包含实证数据、分析脚本及模拟数据，用于支持基于混合模型的系统发育时间树推断研究。 文件详解...
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化石采样对化石出生死亡过程估算分化时间影响数据集
数据集概述 本数据集围绕化石采样对化石出生死亡（FBD）过程估算分化时间的影响展开，通过实证数据与模拟框架，评估不同化石数据子采样方法对分化时间估算准确性的作用，为进化生物学时间尺度研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Positive_Control.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 可能包含实验的阳性对照数据及相关分析结果 文件名称:...
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小麦族全叶绿体基因组系统发育与杂交事件数据集
数据集概述 本数据集包含小麦族（Triticeae）近缘物种的全叶绿体基因组系统发育分析数据，涉及一百九十四份个体的ndhF基因位点和一百八十三份个体的全叶绿体基因组组装结果，覆盖五十三种小麦族物种及十五个属，用于探究该族的演化关系与杂交事件。 文件详解 表格文件（.xls格式）：...
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油鳗属物种复合体遗传距离分析表
数据集概述 本数据集为油鳗属（Ophidion）物种复合体分类修订研究中的遗传距离分析表。核心内容是基于K2P模型计算的10种油鳗属物种间的遗传距离（对角线下方）和标准误差（对角线上方），以及物种内遗传距离和标准误差（主对角线）。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容:...
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长尾黑颚猴进化辐射研究数据集
数据集概述 该数据集基于新一代DNA测序技术，对博物馆保存的117年历史标本进行线粒体基因组测序，包含92个长尾黑颚猴（Cercopithecini族）样本数据，用于推断其进化关系、分化时间及地理分布，揭示非洲森林变化对其辐射演化的影响。 文件详解 文档与图表文件： Guschanski_et_al_SI.doc：可能包含研究补充信息的Word文档...
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基因流对物种树估计影响的模拟研究数据集
数据集概述 该数据集基于模拟研究，探究基因流与不完全谱系分选对物种树估计的影响。通过模拟不同模型、规模、时间尺度和迁移率下的多基因座序列数据，分析贝叶斯方法及汇总统计方法对物种树拓扑结构、种群大小和分化时间的估计误差，为系统发育研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplemental Materials.pdf 文件格式: PDF...
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Manilkarinae亚族分化时间估算表
数据集概述 该数据集是关于山榄科Manilkarinae亚族内类群分化时间的估算表，包含关键节点的平均分化年龄（百万年）及95%最高后验密度区间数据，为研究该类群的系统发育关系提供时间尺度支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容: 表格数据包含以下字段映射：...
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物种树估计与物种界定中正向选择影响评估数据集
数据集概述 本数据集围绕多物种溯祖模型中正向选择对物种树估计、物种界定及参数推断的影响展开，通过计算机模拟不同演化场景（如分化时间、选择强度、基因座数量），分析正向选择对溯祖推断的作用，提供相关研究结果的可视化支持。 文件详解 该数据集包含6个PDF格式的图片文件，具体说明如下： - FigureS1.pdf:...
