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PLUMED_NEST_元动力学元推断_统计准确构象系综模拟输入数据
2026年1月23日 30 15 6
数据集概述 本数据集是论文“how to determine statistically accurate conformational ensembles by metadynamics metainference”的模拟复现所需输入文件，包含一个压缩包文件，用于支持通过元动力学元推断方法确定统计准确构象系综的模拟实验复现。 文件详解...
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DPPC_Slipids_Based_全水合磷脂双分子层MD模拟数据_原始文件
2026年1月20日 30 111 10
数据集概述 本数据集包含全水合DPPC磷脂双分子层的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件。采用Slipids力场与Gromacs 4.6.6软件，模拟条件为温度323K、128个脂质分子、3840个TIP3P水分子，共10个文件，涵盖模拟参数、结构、轨迹等关键数据。 文件详解 力场与拓扑文件...
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Molecular_Dynamic_Simulation_Based_CL5D加速SIRT6产物解离研究数据
2025年12月29日 30 13 10
数据集概述 本数据集包含CL5D加速SIRT6产物解离的分子动力学模拟相关数据，涵盖SIRT6及SIRT6-CL5D系统的初始结构、平衡结构快照、模拟配置文件及图表源数据，支持论文图表生成与模拟过程复现，总计包含14个文件。 文件详解 源数据文件 文件名称：Source Data.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：用于生成论文正文图表的源数据...
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沸石模板碳材料DFTB结构数据库
2025年12月22日 30 36 27
数据集概述 该数据集为沸石模板碳（ZTC）材料的DFTB结构数据库，包含经密度泛函紧束缚（DFTB）优化的CH、CHO等多组分结构模型，涵盖初始结构、优化结构、体积模量数据及分析工具，支持碳基固体结构与性能关系研究。 文件详解 初始结构文件： initial ZTC...
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OmpF通道残基电离预测的恒pH分子动力学模拟输入输出数据集
2025年12月18日 30 102 30
数据集概述 本数据集包含用于复现OmpF通道残基电离预测恒pH分子动力学（CpH-MD）模拟的输入文件及部分输出文件，作为预印本研究的补充资源，支持模拟可重复性与进一步分析。 文件详解 文件名称：Arxiu.zip 文件格式：ZIP压缩包 压缩包内包含（位于CpH-MD-DPPC目录）： 参数文件（.mdp格式）：恒pH分子动力学模拟参数配置...
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羧基化柱_6_芳烃主客体结合中无端点自由能技术综合评估数据集
2025年12月16日 30 114 102
数据集概述 本数据集聚焦羧基化柱[6]芳烃主客体结合研究，包含所有初始结构、Autodock对接的配体构象及计算结果，为无端点自由能技术的综合评估提供数据支持。 文件详解 文件名称: SI.pdf，文件格式: PDF，包含研究的补充信息，可能涉及实验方法、计算细节或结果说明 文件名称: Data.zip，文件格式:...
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晶体结构优化与选择方法研究支撑数据集
2025年12月15日 30 187 124
数据集概述 该数据集包含九种测试体系的晶体结构文件，支持“一种基于图论的随机晶体结构优化与选择通用方法”的研究。数据以CIF和XYZ格式存储，按体系分类，涵盖初始结构、优化结构及筛选结果等不同阶段的文件，为晶体结构计算方法的验证提供基础数据。 文件详解 核心文件：18个ZIP格式压缩包，按测试体系命名（如CIF-...
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微管结构编码力学与通信多尺度计算研究数据集
2025年12月10日 30 205 92
数据集概述 本数据集包含复现论文《Architecture-Encoded Mechanics and Communication in Microtubules: A Multiscale Computational Study》研究结果所需的原始数据，涉及微管结构编码力学与通信的多尺度计算研究，提供分子动力学模拟及弹性网络模型分析相关文件。...
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非晶态二氧化硅材料真实模型的B3LYP优化坐标数据集
2025年12月8日 30 113 73
数据集概述 本数据集包含通过B3LYP/6-31G(d,p)方法优化的非晶态二氧化硅模型坐标数据，以压缩文件形式存储，用户可根据羟基密度选择不同模型，需引用指定参考文献。 文件详解 文件名称: silica_final_structures.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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聚合物_脂质溶液分子动力学模拟的RNN预测数据集2022
2025年12月8日 30 54 9
数据集概述 本数据集包含用于研究聚合物-脂质溶液分子动力学模拟的文件与脚本，涉及GROMACS拓扑结构、初始结构文件，以及用于计算相互作用能、PyTorch模型训练和期望最大化聚类的脚本，还包括势能与相互作用能时间序列数据及相关预印本。 文件详解 GROMACS相关文件： DSPE+PEG.top：GROMACS拓扑文件，描述DSPE-...
