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三刺鱼分支分化时间不确定性估计研究数据
2026年2月10日 30 106 7
数据集概述 本数据集围绕三刺鱼主要分支的分化时间估计展开，通过串联法和多物种溯祖（MSC）模型分析单核苷酸多态性数据，探讨谱系分选不完全（ILS）对分化时间估计的影响，同时测试不同校准策略的作用。数据集包含分析所需的输入文件、流程文件、XML文件及两种方法得到的一致树，为鱼类进化时间线研究提供参考。 文件详解 压缩文件： 文件名称：Files.zip...
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Squamata_Based_有鳞目蜥蜴与蛇类系统发育研究数据
2026年1月29日 30 173 85
数据集概述 本数据集为有鳞目（蜥蜴和蛇类）系统发育研究的相关数据，包含161种有鳞目物种的44个核基因序列（共33717个碱基对）分析结果。采用串联法和物种树法解析系统发育关系，解决了部分分类争议，揭示了 dibamids 与 gekkotans 为其他有鳞目姐妹群、盲蛇类为并系群等新发现，数据集含4个相关文件。 文件详解...
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沈等人_补充材料_盲肠科_Plethodontidae_演化时间研究数据
2026年1月21日 30 124 73
数据集概述 本数据集为Plethodontidae蝾螈科演化时间研究的补充材料，包含基于50个独立核标记（共48,582 bp）的系统发育重建与分化时间分析相关数据，用于解决该科早期快速分化导致的系统发育关系争议，修正其起源时间假说。 文件详解 文件名称：Shen_et_al_Supplementary_Materials.zip 文件格式：ZIP...
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Menonvillea_Based_安第斯山十字花科属气候生态位演化研究数据
2026年1月20日 30 54 40
数据集概述 本数据集围绕安第斯山十字花科Menonvillea属的气候生态位演化研究构建，包含物种分布、分子序列、系统发育树、分析文档及模型配置文件等11个文件，覆盖系统发育分析、生态位建模等核心研究内容，支撑该属生态位演化模式、适应性特征及系统发育保守性的研究验证。 文件详解 物种分布数据 文件名称：Species_Ocurrence.xlsx...
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Dryad_Source_Cetacea分子系统发育宏进化制度推断影响分析数据
2026年1月19日 30 149 51
数据集概述 本数据集围绕“不完全谱系分选对基于串联法的分子系统发育宏进化制度推断的影响”展开，以鲸目（Cetacea）海豚科的分化速率变化为基础模拟数据，对比串联法与溯祖法系统发育推断对宏进化制度恢复的效果。数据集包含1个压缩文件，用于支持相关进化生物学研究。 文件详解 压缩文件（archive_files） 文件名称：dryad.zip...
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Ischyropsalidoidea_Based_节肢动物超科系统发育基因组学分析数据
2026年1月14日 30 192 140
数据集概述 本数据集是针对盲蛛超科Ischyropsalidoidea系统发育关系的基因组学分析成果，包含10个相关文件。通过整合转录组与桑格测序数据，采用多种系统发育分析方法（如串联法、溯祖法等），解决了该类群早期分化的系统发育问题，为节肢动物分类与演化研究提供了数据支持。 文件详解 基因树文件...
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eutherian_mammal_phylogenomics_系统发育基因组学研究数据
2026年1月14日 30 203 157
数据集概述 本数据集为真兽类哺乳动物系统发育基因组学研究数据，包含37个物种的447个核基因全基因组数据，用于解决真兽类哺乳动物系统发育中的冲突问题。通过串联法与多物种溯祖模型的对比分析，揭示基因树异质性对系统发育重建的影响，明确真兽类系统发育关系及根位置。 文件详解 文件名称：README_for_gene447_final.docx...
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Squamate_Phylogenomic_Based爬行动物系统发育基因组学分析数据
2026年1月14日 30 146 31
数据集概述 本数据集基于4178个核基因座的靶向序列捕获数据，对32种有鳞目爬行动物（蜥蜴和蛇）及5个外类群进行系统发育基因组学分析。通过串联法和物种树方法，明确蛇类在蜥蜴科中的起源位置，解决了鬣蜥类蜥蜴的争议性分类地位。数据集包含6个文件，为研究有鳞目高级分类关系提供强支持的假设。 文件详解 RAxML输入文件（TXT格式）...
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基于UCE技术的墨西哥短吻石龙子_Plestiodon_brevirostris_系统分类学_生物地理学及基因组学研究数据
2025年12月27日 30 156 14
数据集概述 本数据集为Plestiodon brevirostris组石龙子生物地理学系统基因组学研究的原始数据，包含58个样本的3282个超保守元件（UCEs）序列及相关分析文件。数据用于构建时间校准的系统发育树，探究该组石龙子的地理分布历史与墨西哥跨火山带形成的关联，共包含4个文件。 文件详解 README文件...
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新世界鼠耳蝠线粒体与核基因组进化历史冲突数据集
2025年12月24日 30 9 2
数据集概述 该数据集聚焦新世界鼠耳蝠的基因组进化研究，包含37个代表性物种的完整线粒体基因组序列及3648个超保守元件（UCEs）的靶向测序数据，通过多种系统发育方法分析核基因与线粒体基因树的冲突，探索驱动鼠耳蝠独特进化历史的因素。 文件详解...
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地松鼠快速辐射类群系统发育分辨率研究数据集
2025年12月20日 30 182 86
数据集概述 本数据集围绕旱獭族地松鼠快速辐射类群的系统发育分辨率展开，通过3950余个超保守元件（UCE）位点，评估4种不同推断方法（RAxML、ASTRAL、NJst、SVDquartets）对系统发育估计的敏感性，以及不同过滤场景下的拓扑结构和支持度差异。 文件详解 文档与说明文件: README.txt:...
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近期植物辐射分化研究数据集_基因分型测序方法
2025年12月19日 30 16 8
数据集概述 该数据集围绕近期植物辐射分化研究展开，通过基因分型测序（GBS）结合形态计量分析，探究地中海西部柳穿鱼属植物的物种边界与系统发育关系，评估不同分析方法对聚类阈值的鲁棒性，揭示形态分化与传粉者驱动的多样化模式。 文件详解 核心数据文件： SNPs.zip：压缩文件，可能包含单核苷酸多态性（SNPs）相关数据...
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异常区附近串联法失效研究数据集
2025年12月10日 30 196 4
数据集概述 本数据集围绕基因组测序中串联法在物种树构建的失效问题展开，聚焦异常区（因不完全谱系分选导致最常见基因树与物种树不匹配的参数空间）内外，分析似然法与简约法在串联数据上的性能差异，为改进物种树恢复方法提供理论与实验依据。 文件详解 说明文档（.txt格式）：...
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多基因座物种树估计方法评估数据集
2025年12月9日 30 37 2
数据集概述 本数据集围绕多基因座物种树估计方法评估展开，包含基因树、序列数据、模拟与生物数据压缩包及说明文档，用于研究不完全谱系分选（ILS）对物种树准确性的影响，对比MP-EST、串联法等方法的性能。 文件详解 文件名称: README_for_sequencedata.alignments：文本文件，提供序列数据相关说明 文件名称:...
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重组对物种树分析影响研究数据集
2025年12月8日 30 77 68
数据集概述 本数据集围绕系统发育学中重组对物种树分析的影响展开，探讨种内重组作为基因树与物种树不一致的潜在来源，分析其对不同物种树方法（如合并法）的干扰及与物种形成历史要素的相互作用。 文件详解 文件名称: species_trees.nex：NEX格式文件，可能包含用于物种树分析的系统发育数据，如基因序列或树结构信息。 文件名称:...
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金虎尾目物种树异质性影响因素研究数据集
2025年12月6日 30 177 99
数据集概述 本数据集聚焦被子植物金虎尾目（Malpighiales）物种树构建问题，包含423个单拷贝基因座数据及相关分析结果，探究基因树估计误差、不完全谱系分选和基因流对该类群系统发育分辨率的影响，为理解快速辐射类群的进化机制提供数据支持。 文件详解 文件名称：Supplementary_Materials.pdf 文件格式：PDF...
