数据集概述
本数据集围绕安第斯山十字花科Menonvillea属的气候生态位演化研究构建,包含物种分布、分子序列、系统发育树、分析文档及模型配置文件等11个文件,覆盖系统发育分析、生态位建模等核心研究内容,支撑该属生态位演化模式、适应性特征及系统发育保守性的研究验证。
文件详解
- 物种分布数据
- 文件名称:Species_Ocurrence.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Menonvillea属物种的地理分布信息,支撑气候生态位分析的基础数据
- 分子序列数据(NEX格式)
- 文件名称:trnH_BEAST.nex、rps16_BEAST.nex、trnLF_BEAST.nex、ITS_BEAST.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:分别对应trnH、rps16、trnLF、ITS基因片段的BEAST分析输入序列,包含物种分子序列信息
- 系统发育树数据(TRE格式)
- 文件名称:MCCT_concatenated_analyses.tre、MCCT_species_tree_analyses.tre、1000_trees_species_tree_analyses.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:包含串联分析、物种树分析的最大类群置信树(MCCT)及1000棵物种树样本,记录系统发育关系
- 模型配置文件(XML格式)
- 文件名称:MEN_concatenated-based_method.xml、MEN_coalescent-based_method.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:分别对应串联法和溯祖法的系统发育分析模型配置,包含分析参数设置
- 分析文档
- 文件名称:phylogenetic_analyses.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:系统发育分析相关的文档记录,包含研究方法或结果说明
适用场景
- 植物气候生态位演化研究: 分析Menonvillea属生态位随演化时间的变化模式,验证系统发育生态位保守性
- 系统发育分析: 基于分子序列数据构建物种系统发育树,探究属内物种的亲缘关系
- 适应性特征关联研究: 关联气候因子(如干旱程度、温度范围)与一年生习性等表型特征的演化关系
- 生态位模型验证: 测试气候生态位演化的模型拟合度(如布朗运动、Ornstein-Uhlenbeck模型)
- 安第斯山植物区系研究: 以Menonvillea属为案例,分析安第斯山地区植物的生态适应机制