数据集概述
本数据集为有鳞目(蜥蜴和蛇类)系统发育研究的相关数据,包含161种有鳞目物种的44个核基因序列(共33717个碱基对)分析结果。采用串联法和物种树法解析系统发育关系,解决了部分分类争议,揭示了 dibamids 与 gekkotans 为其他有鳞目姐妹群、盲蛇类为并系群等新发现,数据集含4个相关文件。
文件详解
- 文件名称:sq_models_RAXML
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:用于RAXML软件的模型相关数据文件,可能包含系统发育分析的模型参数设置信息。
- 文件名称:squamate44locus_*BEAST.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:*BEAST软件的输入文件,包含44个基因位点的有鳞目物种数据及分析参数配置,用于物种树构建。
- 文件名称:squam44locus_MrB.nexus
- 文件格式:NEXUS
- 字段映射介绍:MrBayes软件的输入文件,包含44个基因位点的有鳞目物种序列数据,用于贝叶斯系统发育分析。
- 文件名称:sq44locus_RAXML
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:用于RAXML软件的44个基因位点数据文件,包含有鳞目物种的基因序列及分析相关信息。
数据来源
论文“Resolving the phylogeny of lizards and snakes (Squamata) with extensive sampling of genes and species”
适用场景
- 爬行动物系统发育研究:解析有鳞目内部类群(如蜥蜴、蛇类)的亲缘关系与演化历史。
- 分子系统学方法验证:比较串联法与物种树法在大规模基因数据下的系统发育解析效果。
- 生物多样性演化分析:基于系统发育关系探讨有鳞目物种多样性的形成机制。
- 分类学修订支持:为有鳞目类群的分类地位(如 dibamids、盲蛇类的分类)提供分子数据依据。
- 基因组学研究参考:为有鳞目核基因序列的获取与分析提供数据支持。