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Prophage_Based_噬菌体宿主共进化数学模型研究数据
2026年1月28日 30 69 44
数据集概述 本数据集为噬菌体作为遗传库促进宿主群落多样性和创新的研究相关数据,包含支持该研究的数学模型代码、模型运行结果文件及参数变更记录,用于分析原噬菌体序列对温和噬菌体与细菌协同进化的影响,共14个文件。 文件详解 代码文件(.m格式,共4个)...
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Klebsiella_Based_克雷伯氏菌原噬菌体互作与荚膜进化研究数据
2026年1月21日 30 1 0
数据集概述 本数据集围绕克雷伯氏菌原噬菌体的丰度、感染性及噬菌体-细菌互作展开,包含35株肺炎克雷伯菌复合种菌株的诱导噬菌体-细菌互作网络数据,揭示原噬菌体裂解循环、宿主范围与荚膜血清型的模块关系,以及噬菌体捕食下荚膜丢失的进化现象,共含4个数据文件。 文件详解 数据文件(共4个)...
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Viral_Dark_Matter_Based_微生物基因组病毒暗物质与宿主相互作用数据
2026年1月13日 30 141 122
数据集概述 本数据集通过挖掘公共细菌和古菌基因组数据,识别出12,498个高置信度病毒基因组及其关联的微生物宿主。数据补充了现有公共数据集,提供13个新细菌门的首条病毒序列,助力解析病毒组中未知序列空间,包含病毒分类、基因组重组、原噬菌体及共感染等分析内容。 文件详解 文件名称:VirSorter_Curated_Dataset_genbank-...
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鲍曼不动杆菌防御系统与原噬菌体关联分析数据集
2025年12月16日 30 70 2
数据集概述 本数据集围绕鲍曼不动杆菌防御系统展开分析,探究其与原噬菌体分布的关联,运用机器学习技术关联防御系统与原噬菌体的正负相关性,包含相关Python分析脚本及处理流程,为研究防御系统替换与原噬菌体分布的进化关系提供技术支持。 文件详解 核心文件: aba_defensome.zip: 压缩文件,包含所有分析脚本与数据处理文件...
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基于外向配对末端读段的细菌基因组原噬菌体识别与定位R脚本
2025年12月9日 30 160 26
数据集概述 该数据集包含一套R脚本及相关文件,展示如何使用mVIRs软件包的OPR finder功能识别外向配对末端读段(OPRs),并以此在鼠伤寒沙门氏菌LT2中定位p22原噬菌体。数据文件结构简洁,包含脚本源文件、输出文档及输入数据压缩包,为复现相关研究提供完整工具链。 文件详解 OPR_markdown.Rmd:R...



