数据集概述
本数据集为噬菌体作为遗传库促进宿主群落多样性和创新的研究相关数据,包含支持该研究的数学模型代码、模型运行结果文件及参数变更记录,用于分析原噬菌体序列对温和噬菌体与细菌协同进化的影响,共14个文件。
文件详解
- 代码文件(.m格式,共4个)
- 文件名称:run_model.m、phage_host_evolve_nested.m、phage_host_evolve_oneone.m、evol_rate.m
- 字段映射介绍:包含噬菌体宿主共进化数学模型的运行代码、嵌套进化模型代码、一对一进化模型代码及进化速率计算代码
- 模型结果文件(.mat格式,共9个)
- 文件名称:makefigure2rev.mat、makefigure1rev.mat、makefigureS5rev.mat、makefigure3rev.mat、makefigureS3rev.mat、makefigureS2rev.mat(及其他未列举的.mat文件)
- 字段映射介绍:存储模型运行生成的结果数据,用于绘制研究相关图表
- 参数变更记录文件(.xlsx格式,共1个)
- 文件名称:Parameter changes for figures.xlsx
- 字段映射介绍:记录研究中用于生成图表的参数变更信息
数据来源
论文“Data from: Prophage as a genetic reservoir: Promoting diversity and driving innovation in the host community”
适用场景
- 噬菌体宿主协同进化研究: 分析原噬菌体序列对温和噬菌体与细菌协同进化的影响机制
- 噬菌体种群维持机制分析: 探究原噬菌体序列在宿主细胞抗性环境下维持噬菌体种群的作用
- 噬菌体宿主生态系统多样性研究: 研究原噬菌体重组对噬菌体类型多样性及生态系统共存的促进作用
- 宿主细胞群体创新驱动分析: 分析宿主携带的原噬菌体序列对宿主细胞群体进化创新的推动作用