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真菌基因转移数据的基因组规模系统发育分析
2026年2月2日 30 1 0
数据集概述 本数据集为真菌基因组规模系统发育分析相关数据，包含基因家族选择、序列比对结果、基因树与物种树整合计算输出等内容，用于探究基因转移在真菌进化中的作用，支持比较基因组进化动力学研究，共含六个文件。 文件详解 README_for_TreeAConcatenate.txt 文件格式：TXT...
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DRYAD_Based_C4光合作用新基因平行进化研究数据
2026年1月30日 30 185 56
数据集概述 本数据集包含C4光合作用新基因平行进化研究的相关文件，涉及两种C4光合作用起源中基因复制的独立平行进化机制，重点分析维管束鞘细胞优先表达基因及SWEET-13转运蛋白的功能，为C4植物韧皮部装载机制提供新见解。 文件详解 README_for_Trees.txt 文件格式：TXT...
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BURP_Based_植物特异性蛋白家族分化与正选择研究数据
2026年1月29日 30 14 2
数据集概述 本数据集源自植物特异性BURP结构域蛋白家族的分化与正选择研究，包含15种植物基因组中鉴定的125个BURP蛋白编码基因相关信息，涉及4个主要植物谱系的13个高等植物物种。数据覆盖基因起源、分化模式、进化速率及功能分析，揭示该家族在植物适应陆地环境中的关键作用，文件总数为1个。 文件详解 文件名称：Figures, Tables, and...
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GeneSeqToFamily_Based基因家族进化分析数据
2026年1月28日 30 209 30
数据集概述 本数据集为GeneSeqToFamily项目相关的基因JSON数据压缩包，聚焦基因家族进化研究，涉及基因复制、家族收缩/扩张与生物适应的关联，以及同源基因分析、基因结构变化（如外显子边界保守性）等内容，支持基因家族进化机制的探索。 文件详解 文件名称：gene.json.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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Vertebrate_脊椎动物基因家族系统发育树数据集_2002
2026年1月28日 30 5 2
数据集概述 本数据集包含118个脊椎动物基因家族的系统发育树，用于James Cotton和Roderic Page在2002年发表的两篇论文。数据涵盖基因序列文件、系统发育树文件、分类重叠图及基因家族列表，支持基因进化关系与分类学分析。 文件详解 压缩包文件 文件名称：genes.zip 文件格式：ZIP...
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HGT_CYS_Based_鳞翅目昆虫半胱氨酸合酶基因功能分化研究数据
2026年1月26日 30 99 67
数据集概述 本数据集聚焦鳞翅目昆虫中水平转移（HGT）获得的半胱氨酸合酶（CYS）基因的功能分化研究，包含qPCR原始数据，用于分析HGT后基因复制的进化命运、表达模式差异及酶学特性分化，为理解昆虫适应不同食性的分子机制提供基础数据。 文件详解 文件名称：qPCR_raw_data.xlsx 文件格式：XLSX...
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Pristionchus_Based_多态性开关基因复制进化研究数据
2026年1月25日 30 39 32
数据集概述 本数据集围绕Pristionchus线虫口器多态性开关基因eud-1展开，通过反向遗传学和群体遗传学分析，探究基因复制在开关基因形成中的作用，验证退化互补、中性进化及功能特化等进化场景，包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：Sulfatase_mutant_sequences.zip 文件格式：ZIP...
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Malvolio_Based_昆虫Nramp家族基因复制与功能分化研究数据
2026年1月21日 30 40 25
数据集概述 本数据集聚焦于亚社会性甲虫Nicrophorus vespilloides中Malvolio基因（Nramp家族昆虫同源基因）的复制及亚/新功能化研究。通过分析该基因在不同组织、不同社会行为状态下的表达模式，探究其复制后功能分化的潜在机制，为昆虫基因功能进化研究提供支撑。 文件详解 文件名称：Malvolio_All_Tissues_RT-...
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ApoD_Gene_Cluster_Based硬骨鱼类载脂蛋白D基因簇扩展研究数据
2026年1月15日 30 72 67
数据集概述 本数据集为硬骨鱼类载脂蛋白D（ApoD）基因簇扩展研究的配套数据，包含基因序列、蛋白结构、转录组数据、表达谱、引物序列及选择压力分析结果，支持研究基因复制、簇维持与新功能形成，共6个文件。 文件详解 Additional_file_1_ML_tree_alignment.fas 文件格式：FAS...
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Winter_Dalla_Based_昆虫Na_K_ATP酶亚基组合适应性研究数据2021
2026年1月12日 30 179 6
数据集概述 本数据集是Winter Dalla等人关于昆虫Na,K-ATP酶α/β亚基组合适应性研究的配套数据，包含酶活性测定实验的说明文档和原始数据。研究通过表达大乳草蝽的三种α亚基与三种β亚基的九种组合，测试其对强心苷毒素的抗性及动力学特性，揭示昆虫对宿主植物毒素的适应性机制，数据集共包含2个文件。 文件详解 说明文档...
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Lepidoptera_Trehalase_Gene_Duplication_Evolution_Data
2025年12月30日 30 210 144
数据集概述 本数据集为鳞翅目昆虫海藻糖酶（Treh）基因复制与功能多样化研究的原始数据，聚焦基因复制对昆虫环境适应的进化意义。数据记录了Treh1复制为Treh1a和Treh1b的分子进化证据，包括基因表达、酶学特性及选择压力分析相关的原始定量PCR数据，支持研究基因复制与昆虫适应多样化生境的关联机制。 文件详解 文件名称：Raw qPCR...
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弗里德赖希共济失调基因复制与休眠复制起点激活数据集
2025年12月22日 30 173 165
数据集概述 该数据集围绕弗里德赖希共济失调（FRDA）患者携带GAA重复序列扩张的Frataxin基因复制机制展开，对比正常与突变等位基因的复制特征，包括复制延迟、休眠复制起点激活及周围区域复制谱改变等实验结果，提供重复序列扩张基因复制事件的全景数据。 文件详解 该数据集包含8个文件，分为文档文件和压缩文件两类，具体说明如下： -...
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多标签树基因树和解解析多倍体事件数据集
2025年12月20日 30 126 49
数据集概述 该数据集为基因树和解算法研究的补充材料，聚焦多倍体事件解析。算法适配多标签树（MUL-trees），可准确识别异源多倍体亲本谱系、区分多倍体类型并统计基因复制与丢失事件，通过模拟数据及酵母、小麦真实数据验证，为多倍体物种基因组演化研究提供支持。 文件详解 文件名称: Tables_S1-5.xlsx 文件格式: XLSX 内容说明:...
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多基因座多物种溯祖模型与基因家族进化数据集
2025年12月15日 30 43 40
数据集概述 该数据集围绕“多基因座多物种溯祖”（MLMSC）模型展开，该模型是一种用于分析基因家族进化的新模型，整合了不完全谱系分选（ILS）与基因复制、转移、丢失（DTL）的相互作用，为基因树与物种树的模拟和推断提供框架。 文件详解 数据文件： 文件名称：hemiplasy_data.xlsx 文件格式：Excel（.xlsx）...
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SimPhy系统发育基因组模拟软件相关数据集
2025年12月15日 30 133 78
数据集概述 该数据集包含与SimPhy软件相关的补充材料，SimPhy是用于模拟基因、基因座和物种树进化的系统发育基因组模拟软件，可模拟不完全谱系分选、基因复制与丢失等导致物种树与基因树不一致的过程。 文件详解 文件名称：appendix1.pdf 文件格式：PDF 内容：可能包含SimPhy软件的附录说明文档，提供额外的技术细节或补充信息...
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基于贝叶斯方法的侧向基因转移分析数据集
2025年12月11日 30 166 86
数据集概述 本数据集包含基于贝叶斯MCMC方法分析侧向基因转移（LGT）的研究相关数据。该方法整合基因复制、丢失、LGT及序列进化，应用于柔膜菌纲和蓝细菌的全基因组分析，为理解LGT在原核生物进化中的作用提供支持。 文件详解 文件名称: si.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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植物次生代谢物驱动昆虫抗性平行分子进化数据集
2025年12月11日 30 123 26
数据集概述 本数据集围绕植物趋同演化的有毒次生代谢物（强心苷类）对昆虫Na,K-ATP酶抗性的平行分子进化展开研究，分析了五种叶甲科昆虫谱系对不同结构强心苷的适应机制，包括靶位点突变及基因复制情况，验证了抗性的分子基础。 文件详解 文件名称：NaKATPase_leaf miner flies_Petschenkaetal.pdf 文件格式：PDF...
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脊椎动物烟碱型乙酰胆碱受体进化数据集
2025年12月4日 30 58 33
数据集概述 该数据集聚焦脊椎动物烟碱型乙酰胆碱受体（nAChR）的进化研究，通过序列系统发育、染色体同线性及内含子位置分析，揭示其基因家族从脊椎动物祖先到现生类群的扩张与丢失过程，为理解该受体家族复杂性的起源提供数据支持。 文件详解 系统发育树文件： Maximum likelihood tree nAChR gene...
