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补充数据_植物生命树基因组规模系统发育数据
2026年2月1日 30 88 44
数据集概述 本数据集为论文“Genome-Scale Phylogenetics: Inferring the Plant Tree of Life from 18,896 Discordant Gene...
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Basidiomycota_Source_担子菌门系统发育基因组学研究补充数据
2026年1月19日 30 190 163
数据集概述 本数据集为担子菌门(Basidiomycota)系统发育基因组学研究的补充数据,聚焦于解决其亚门(锈菌、黑粉菌、蘑菇形成真菌)间的深层演化关系。通过分析模型选择、缺失数据、分类群采样等因素对系统发育推断的影响,探讨演化过程中的潜在偏倚来源,为真菌演化研究提供支持。 文件详解 文件名称:Prasanna et al...
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Phylogenetic_Data_系统发育信号分析_串联比对与基因树研究数据
2026年1月19日 30 118 61
数据集概述 本数据集围绕原核生物与真核生物的串联比对及基因树展开分析,包含原核生物3个分类深度(γ变形菌、变形菌、原核生物)的248个基因树(315个基因组),以及真核生物2个分类深度(动植物真菌跨类群、真菌内部)的279个基因树(85个基因组),用于探究系统发育树不一致的来源及单基因与串联比对的重叠程度。 文件详解...
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Anchored_Phylogenomics_Source_马达加斯加伪蝰蛇系统发育比较研究数据集
2026年1月6日 30 9 1
数据集概述 本数据集为马达加斯加伪蝰蛇(Pseudoxyrhophiinae)系统发育研究的原始数据,包含基于5个Sanger测序基因位点和377个锚定基因组位点的两种分子数据集,用于比较不同测序规模和分析方法对物种树构建的影响,为蛇类系统进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:AHE_Snake_ProbeDesign.zip 文件格式:ZIP...
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PickMe算法物种树重建样本选择数据集
2025年12月23日 30 182 115
数据集概述 本数据集围绕PickMe算法展开,该算法通过贝叶斯框架为基因树中的四分体拓扑分配后验概率,计算样本可靠性得分以辅助物种树重建的样本选择。数据集包含算法应用于乳草属目标捕获数据的相关文件,为系统发育基因组学研究提供样本筛选工具支持。 文件详解...
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面包果属_Artocarpus_Moraceae_系统发育研究数据集
2025年12月21日 30 196 147
数据集概述 该数据集包含面包果属(Artocarpus)517基因的系统发育研究数据,覆盖96%的类群,整合新鲜叶片与博物馆标本(最长106年)的DNA序列。内容涉及序列组装、基因树分析、分区策略等,为该属分类修订及目标富集数据研究提供基础。 文件详解 数据集包含10个文件,具体说明如下: -...
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基因树不一致性_单纯形图与溯祖模型下的统计检验数据集
2025年12月19日 30 14 8
数据集概述 本数据集围绕基因树不一致性问题,介绍了基于四重一致因子的单纯形图可视化工具,用于探索基因树集合的不一致模式,并与溯祖模型(MSC)的预期不一致性对比,同时提供统计检验方法评估数据与模型的契合度。 文件详解 文件名称: SimplexAppendix_Rev.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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欧洲鳞翅目DNA条形码基因树物种水平并系与多系性数据集
2025年12月4日 30 22 12
数据集概述 本数据集聚焦欧洲鳞翅目COI条形码序列数据,通过"Monophylizer"工具检测4977个物种、41583个标本的基因树非单系性,分析建树方法、采样等因素的影响,为DNA条形码物种界定研究提供数据支持。 文件详解 ML trees.zip:压缩文件,可能包含使用最大似然法构建的基因树数据文件...



