数据集概述
本数据集围绕原核生物与真核生物的串联比对及基因树展开分析,包含原核生物3个分类深度(γ变形菌、变形菌、原核生物)的248个基因树(315个基因组),以及真核生物2个分类深度(动植物真菌跨类群、真菌内部)的279个基因树(85个基因组),用于探究系统发育树不一致的来源及单基因与串联比对的重叠程度。
文件详解
- 文件名称:resources.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含支持论文分析的相关资源,具体内容未提供详细预览,推测涵盖原核生物与真核生物的基因树数据、串联比对结果及系统发育分析相关的中间文件或结果文件。
数据来源
论文“Data from: Concatenated alignments and the case of the disappearing tree”
适用场景
- 系统发育信号研究: 分析串联比对与单基因树的系统发育信号一致性,探究信号重叠程度及不一致来源。
- 原核生物基因转移分析: 结合横向基因转移(LGT)机制,研究原核生物串联比对树与单基因树的差异及LGT的影响。
- 真核生物系统发育分析: 对比真核生物不同分类深度下串联比对与单基因树的一致性,为真核生物系统发育研究提供数据支持。
- 系统发育方法评估: 评估串联比对方法在处理不同类群(原核、真核)及不同分类深度数据时的有效性与局限性。