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Zur_大肠杆菌锌调控结构与机制研究数据2014
2026年2月1日 30 79 40
数据集概述 本数据集围绕大肠杆菌Zur调节子的锌调控机制展开，包含锌结合Zur蛋白与PznuABC启动子的结合结构解析、Zur对不同启动子的协同结合特性、新调控基因pliG的发现及验证，以及体内外Zur-DNA结合亲和力与转录抑制水平的关联分析相关数据，共10个文件。 文件详解 文件名称：Gilston_etal_2014_Table...
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补充数据_原核生物中歧化硫酸盐还原的系统发育与演化研究
2026年1月31日 30 210 6
数据集概述 本数据集是论文《原核生物异化亚硫酸盐还原系统的系统发育与进化》的补充数据，包含5个文件，涵盖基因组信息、Ka/Ks值原始数据、COG信息、树重建用fasta文件及树文件，用于支持原核生物异化亚硫酸盐还原相关的系统发育与进化分析。 文件详解 Supplementary Data 1.xlsx 文件格式：XLSX...
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Rosetta_CASP11_未知蛋白质结构预测模型数据
2026年1月30日 30 21 4
数据集概述 本数据集包含利用进化信息结合Rosetta程序预测的蛋白质结构模型，涵盖CASP11测试中两个蛋白质家族的高精度从头预测结果，以及原核生物中58个无已知三维结构的大型蛋白质家族的结构模型，涉及超40万个蛋白质，为未知结构蛋白质的功能研究提供基础。 文件详解 文件名称：files_from_web.zip 文件格式：ZIP...
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LMAS_Source_微生物群落组装软件基准测试补充材料
2026年1月30日 30 71 47
数据集概述 本数据集为LMAS（自动化工作流程）的补充材料，包含用于基准测试传统及宏基因组原核生物从头组装软件的模拟数据与参考基因组信息。以ZymoBIOMICS微生物群落标准的8个细菌基因组和4个质粒（三重形式）为参考，通过inSilicoSeq生成带或不带错误的均匀分布模拟原始序列数据，共31个文件。 文件详解 表格文件（Tables）...
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QTP_Lake_Sediments_微生物群落与激发效应关联研究数据
2026年1月23日 30 165 46
数据集概述 本数据集围绕青藏高原湖泊沉积物的激发效应（PEs）及其微生物驱动因素展开研究。通过采集不同盐度湖泊沉积物构建微宇宙并原位温度培养，添加13C标记葡萄糖后评估7天和42天的PE强度，分析其与理化因子的相关性及微生物群落变化，为湖泊生态系统有机质矿化研究提供支撑。 文件详解 文件名称：Supporting_Information_S1.docx...
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Tang_etal_Based单细胞蓝藻环境诱导多细胞生命周期研究数据
2026年1月22日 30 196 80
数据集概述 本数据集为Tang、Pichugin、Hammerschmidt撰写的论文所用数据，核心内容是关于单细胞蓝藻在环境诱导下形成多细胞生命周期的研究数据，包含1个Excel文件，用于支撑相关科学研究结论。 文件详解 文件名称：Tang_etal.xlsx 文件格式：XLSX...
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Katz_Data_from_原核生物与真核生物域间横向基因转移研究数据
2026年1月22日 30 8 3
数据集概述 本数据集聚焦原核生物与真核生物的域间横向基因转移（LGT）研究，通过系统发育组学流程生成13465个单基因树，纳入487种真核生物、303种细菌和118种古菌。重点分析存在-...
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orderedPainting_Based_细菌基因组重组热区高效推断数据
2026年1月21日 30 7 0
数据集概述 本数据集为细菌基因组重组热区推断研究相关数据，基于有序染色算法开发的计算高效方法，识别细菌基因组中DNA频繁转移的“热区”。数据支持分析大肠杆菌和空肠弯曲菌基因组的重组事件，为空肠弯曲菌200个基因组分析结果，可用于原核生物群体基因组重组研究。 文件详解 文件名称：jejuni200_data.zip 文件格式：ZIP...
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USEARCH_SINTAX_Based_dix_seq管道分类器参考数据集
2026年1月20日 30 147 114
数据集概述 本数据集包含dix-seq分析流程中使用的USEARCH SINTAX分类器参考数据库，具体包括rdp_16s_v18_sp、PR2_4.14和unite_10.05.2021三个数据库，用于扩增子数据的物种分类注释。 文件详解 文件名称：unite_10.05.2021.zip 文件格式：ZIP...
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病毒生态学数据库2016_生物学评论_受保护版_原核生物与病毒丰度元分析数据
2026年1月20日 30 35 3
数据集概述 本数据集是针对原核生物与病毒丰度的元分析数据库，整合了210篇文献及5项未发表研究的数据。通过关键词检索多平台文献并筛选含病毒-原核生物比率（VPR/VBR）或病毒丰度的内容，补充缺失数据后整理而成，用于病毒生态学相关研究。 文件详解...
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Metazoa_LGT_Based后生动物隔离生殖系与域间水平基因转移研究数据
2026年1月19日 30 69 66
数据集概述 本数据集用于评估后生动物隔离生殖系对域间水平基因转移（LGT）的影响。通过分析900余种生物（细菌、古菌、真核生物）的单基因系统发育树，识别支持度良好的域间LGT事件，对比隔离生殖系出现前后的LGT模式差异，验证隔离生殖系是否为LGT障碍的假设。数据集包含3个文件，涉及双事件拓扑结构、基因列表及存在缺失比对数据。 文件详解...
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Phylogenetic_Data_系统发育信号分析_串联比对与基因树研究数据
2026年1月19日 30 145 68
数据集概述 本数据集围绕原核生物与真核生物的串联比对及基因树展开分析，包含原核生物3个分类深度（γ变形菌、变形菌、原核生物）的248个基因树（315个基因组），以及真核生物2个分类深度（动植物真菌跨类群、真菌内部）的279个基因树（85个基因组），用于探究系统发育树不一致的来源及单基因与串联比对的重叠程度。 文件详解...
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Sphagnum_Microbiome_Source_北美泥炭地碳氮循环微生物组研究补充数据
2026年1月17日 30 1 0
数据集概述 本数据集为北美泥炭地Sphagnum核心微生物组研究的补充表格，包含10个Excel文件。研究覆盖美国5个州17个泥炭地/沼泽站点的18种Sphagnum物种，通过宏基因组、宏转录组和双同位素示踪实验，揭示固氮-甲烷氧化微生物在泥炭地碳氮循环中的核心作用，核心微生物组12个属占相对丰度的60%。 文件详解 文件名称：Table S1....
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Plastisphere_Microbial_Based加勒比海微塑料定殖实验数据
2026年1月15日 30 195 10
数据集概述 本数据集记录了在巴拿马博卡斯德尔托罗开展的为期6周的微塑料原位孵化实验结果，研究6种常见塑料聚合物表面的微生物定殖情况。通过16S和18S rRNA基因测序及扫描电镜分析，探究塑料类型和孵化时间对原核生物及真核生物群落结构的影响，为理解海洋“塑料圈”微生物群落特异性提供数据支持。 文件详解...
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Soil_Network_Based_植物群落稳定性与土壤微生物网络关联研究数据集
2026年1月15日 30 55 33
数据集概述 本数据集来自论文“Plant community stability is associated with a decoupling of prokaryote and fungal soil...
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黄连_Coptis_chinensis_Franch_连续种植田原核生物和病毒群落组成数据
2026年1月12日 30 189 187
数据集概述 本数据集聚焦黄连连作田的微生物群落，包含原核生物和病毒的群落组成信息，涵盖OTU（操作分类单元）数据、病毒重叠群信息及对应的核苷酸序列，为研究连作条件下黄连根际微生物生态提供基础数据。 文件详解 文件名称：Prokaryotic OTU information.xlsx 文件格式：XLSX...
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Evolution_of_conjugation_Based_接合与IV型分泌系统进化研究数据
2026年1月12日 30 64 44
数据集概述 本数据集围绕原核生物接合作用及IV型分泌系统（T4SS）的进化展开，包含关键接合蛋白的系统发育分析结果，涉及单链DNA（ssDNA）与双链DNA（dsDNA）接合的进化分歧、T4SS的分类及功能适应性等核心内容，为理解遗传交换机制提供数据支持。 文件详解 文件名称：trees_and_alignments.zip 文件格式：ZIP...
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Network_Trophic_Relationship_微生物定殖者与枯木资源营养关系网络分析补充数据
2025年12月31日 30 62 26
数据集概述 本数据集为论文“Network analysis reflects the trophic relationship between microbial colonizers and deadwood...
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Salazar_MolEcol_2015_Malaspina_Expedition_原核生物群落数据_v1_0
2025年12月28日 30 179 104
数据集概述 本数据集为Salazar等人2015年发表于《Molecular Ecology》的研究配套数据，包含马拉斯皮纳2010探险中全球30个站位的附着态与游离态原核生物丰度表、辅助数据、系统发育树及分析代码，基于16S rDNA扩增子Illumina测序技术，是深海原核生物生活方式研究的基础数据。 文件详解...
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LMAS项目结果图表数据集
2025年12月18日 30 94 52
数据集概述 本数据集为LMAS（自动化原核生物组装软件基准测试工作流）项目的配套图表资源，包含该项目在验证概念阶段生成的可视化结果，用于展示基于模拟测序数据对组装软件性能评估的分析成果。 文件详解 该数据集包含13个独立文件，具体说明如下： - 栅格图像文件（.png格式，共5个）： - 包括Figure 1.png、Figure...
