数据集概述
本数据集来自论文“Plant community stability is associated with a decoupling of prokaryote and fungal soil networks”,包含植物群落稳定性与土壤原核生物、真菌网络关联研究的相关数据,涉及土壤特征、微生物分类、网络聚类结果及原始测序数据等19个文件,支持土壤微生物网络与植物群落稳定性关系的分析。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,提供数据背景、文件结构及使用指引
- 文本数据文件(.txt格式,共12个)
- 文件名称:soil_characteristics.txt、tax_tab_fun.txt、count_tab_fun.txt、abbr.txt、Pot_position.txt等
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含土壤特征(如soil_pH_KCl、soil_N、soil_C等)、真菌分类表、真菌计数表、缩写说明、盆栽位置信息等结构化数据
- R数据文件(.rda格式,共4个)
- 文件名称:clusters.grass.fun_spinglass_100_5_r999_lam20.RDa、clusters.aban.16S_spinglass_100_5_r999_nlam20.RDa等
- 文件格式:RDa
- 字段映射介绍:土壤微生物网络聚类结果数据,存储草地、撂荒地的真菌和原核生物网络模块划分信息
- 压缩文件(.zip格式,共2个)
- 文件名称:Raw_reads_ITS.zip、Raw_reads_16S.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:土壤真菌(ITS)和原核生物(16S)的原始测序 reads 数据
数据来源
论文“Plant community stability is associated with a decoupling of prokaryote and fungal soil networks”(DOI: 10.1101/2022.06.21.496867)
适用场景
- 植物群落稳定性机制研究: 分析土壤原核生物与真菌网络解耦对植物群落稳定性的影响
- 土壤微生物网络分析: 利用聚类结果数据探究不同生境(草地、撂荒地)土壤微生物网络结构特征
- 土壤理化性质与微生物关联分析: 结合土壤特征数据,研究土壤环境因子对微生物群落及网络的调控作用
- 微生物测序数据分析: 基于原始测序数据开展土壤真菌和原核生物的多样性及组成研究