Katz_Data_from_原核生物与真核生物域间横向基因转移研究数据

数据集概述

本数据集聚焦原核生物与真核生物的域间横向基因转移（LGT）研究，通过系统发育组学流程生成13465个单基因树，纳入487种真核生物、303种细菌和118种古菌。重点分析存在-缺失数据以识别域间转移事件，共发现1138个仅存在于原核生物和不超过3个主要真核生物分支的基因，多数符合近期LGT模式，除光合真核生物的内共生基因转移（EGT）外，古老转移事件较少。

文件详解

• 压缩文件1：Katz trees for dryad.zip
• 文件格式：ZIP
• 内容说明：包含研究中生成的单基因树相关数据，用于系统发育分析。
• 压缩文件2：Katz alignments for dryad.zip
• 文件格式：ZIP
• 内容说明：包含基因序列比对数据，支持基因树构建和横向基因转移事件的识别。

适用场景

• 进化生物学研究：分析原核生物与真核生物域间横向基因转移的模式和历史。
• 基因组学分析：探究横向基因转移对真核生物基因组进化的贡献。
• 系统发育重建：利用单基因树数据重建深层进化节点。
• 内共生基因转移研究：比较横向基因转移与内共生基因转移在真核生物演化中的作用。