USEARCH_SINTAX_Based_dix_seq管道分类器参考数据集

数据集概述

本数据集包含dix-seq分析流程中使用的USEARCH SINTAX分类器参考数据库,具体包括rdp_16s_v18_sp、PR2_4.14和unite_10.05.2021三个数据库,用于扩增子数据的物种分类注释。

文件详解

  • 文件名称:unite_10.05.2021.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:unite数据库压缩包,用于真菌等物种分类注释的参考序列数据集
  • 文件名称:rdp_16s_v18_sp.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:RDP数据库16S rRNA基因v18版本物种水平参考序列压缩包,用于原核生物分类注释
  • 文件名称:PR2_4.14.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:PR2数据库4.14版本参考序列压缩包,用于真核生物核糖体RNA基因分类注释

数据来源

预印本论文“Dix-seq: An integrated pipeline for fast amplicon data analysis”

适用场景

  • 扩增子数据分析:用于dix-seq管道中通过USEARCH SINTAX算法进行物种分类注释
  • 微生物群落研究:支持16S rRNA、ITS等扩增子数据的物种组成分析
  • 生物信息工具验证:作为参考数据集评估USEARCH SINTAX分类器的注释准确性
  • 多组学数据整合:为微生物组与其他组学数据的联合分析提供分类学基础
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 61.42 MiB
最后更新 2026年1月20日
创建于 2026年1月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。