找到56个数据集

标签: 参考序列

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  • eDNA淡水系统鱼类元条形码研究障碍分析数据

    2026年2月9日 30 169 98

    数据集概述 本数据集为新热带区等生物多样性高的淡水系统鱼类eDNA宏条形码研究相关数据，包含3个文件，涉及12S rRNA基因片段的分类分辨率评估、亚马逊地区水样eDNA与传统网捕采样的生物多样性比较分析，以及自制的373条新热带鱼类参考序列数据，用于鱼类生物多样性监测方法的验证与优化研究。 文件详解 README-file.xlsx...
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  • 来自掘穴蜉蝣的数据_系统发育与獠牙进化研究

    2026年2月2日 30 106 95

    数据集概述 本数据集包含穴居蜉蝣（蜉蝣目）的系统发育基因组学研究数据，涉及7个穴居蜉蝣科的19个内群类群和4个外群类群的遗传数据，包括核糖体DNA基因、蛋白质编码位点及参考序列等，用于分析系统发育关系及下颌 tusks 的进化。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT 字段映射介绍：数据集说明文档，包含引用信息、数据文件清单及各文件内容概述...
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  • Bylot岛旅鼠冬季饮食DNA元条形码分析数据

    2026年2月1日 30 150 26

    数据集概述 本数据集基于粪便DNA元条形码技术，分析Bylot岛两种同域分布旅鼠（环颈旅鼠、棕旅鼠）的冬季饮食重叠度。研究发现两者饮食以柳属植物为主，苔藓仅为棕旅鼠次要食物，而占植被生物量50%以上的四棱岩须未被摄食。数据包含76个旅鼠冬季巢样本的序列文件及参考资料，揭示高饮食重叠下的潜在资源竞争情况。 文件详解 README文件...
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  • GBS_Based_针叶树群体基因组分析策略优化数据

    2026年1月31日 30 141 42

    数据集概述 本数据集为针叶树群体基因组分析中基因分型测序（GBS）策略优化研究的数据，包含GBS实验设计、数据处理流程及分析结果，涉及限制性内切酶选择、测序深度、片段大小筛选等参数优化，以及UNEAK、Stacks、GATK等分析流程测试，为缺乏参考基因组的物种提供无参考SNP calling策略指导。 文件详解 参考序列文件 文件名称：9pt-...
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  • Global_Sewage_3_Based全球污水研究数据集

    2026年1月29日 30 87 50

    数据集概述 本数据集为Global Sewage 3相关数据，包含6个文件，无目录层级。文件类型涵盖CSV、XLSX、Parquet、ZIP，其中CSV文件占比50%。数据涉及污水相关的序列计数、聚类信息、抗性基因分析等内容，可用于环境科学领域的污水研究与分析。 文件详解 CSV文件（共3个）...
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  • PrimerMiner_Based_COI引物开发与验证参考数据

    2026年1月28日 30 142 48

    数据集概述 本数据集是R包PrimerMiner的配套数据，用于DNA宏条形码引物的开发与计算机模拟验证。包含COI基因的参考序列数据，通过批量下载BOLD和NCBI数据库的序列并聚类为操作分类单元（OTUs）生成，支持针对特定类群或生态系统的引物优化，解决现有工具缺乏批量处理参考序列的问题。 文件详解 COI Folmer region.zip...
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  • ATCC_Even_Mock_Based_微生物组分析参考序列数据

    2026年1月27日 30 184 72

    数据集概述 本数据集包含ATCC Even Mock Community的16S rRNA基因参考序列及相关辅助文件，旨在支持微生物组分析中的模拟群落（mock community）质控与偏差评估。数据涵盖适用于DADA2分析工具的参考序列文件、数据库文件、物种信息表及流程复现代码，共9个文件，可用于微生物组实验中阳性对照的物种分类注释与偏差验证。...
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  • epiGBS2_Based_浮萍克隆系DNA甲基化与环境暴露研究数据

    2026年1月25日 30 38 3

    数据集概述 本数据集包含浮萍（Lemna minor L.）克隆系的原始表型数据及DNA甲基化中间数据，对应论文“DNA methylation in clonal Duckweed lineages (Lemna minor L.) reflects current and historical environmental...
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  • Paramoeba_brachiphila_18S_rDNA序列数据

    2026年1月25日 30 163 153

    数据集概述 本数据集包含分离出的Paramoeba brachiphila菌株的18S核糖体DNA（rDNA）序列数据，核心内容为该微生物的分子序列信息，是生物研究领域中用于分析物种遗传特征的基础数据，数据集仅包含一个文件。 文件详解 文件名称：Diadema mass mortality Ecol&Evol 2020...
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  • GenBank_Magnoliopsida_ASV系统发育构建参考序列数据

    2026年1月21日 30 59 41

    数据集概述 本数据集为论文补充材料4，包含从GenBank下载的参考序列，用于构建Magnoliopsida类群的ASV系统发育树。数据支撑海洋真核生物DNA测序在生物多样性调查中的应用研究，共包含一个文件。 文件详解 文件名称：oo_1375191.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • Gesneriaceae_Based_核基因靶向捕获_系统基因组学研究数据

    2026年1月21日 30 29 2

    数据集概述 本数据集为苦苣苔科（Gesneriaceae）核基因靶向捕获的系统基因组学研究数据，包含针对该科设计的830个单拷贝基因捕获探针、参考序列、系统发育树及补充表格等7个文件，用于解析苦苣苔科的系统发育关系，支持不同分类水平的进化研究。 文件详解 描述文件 文件名称：DESCRIPTION.txt 文件格式：TXT...
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  • Metabarcoding_Based太平洋表中层浮游桡足类群落结构分析数据

    2026年1月20日 30 175 45

    数据集概述 本数据集为太平洋表、中层浮游桡足类大规模宏条形码分析结果，覆盖太平洋70个站位及北冰洋3个站位。数据揭示群落结构、多样性分布规律，验证"热带起源"理论，探讨进化过程与环境因子（如海水温度）对桡足类多样性的影响，含8个相关文件。 文件详解 生物信息学协议文件 文件名称：Bioinformatic_protocol.docx 文件格式：DOCX...
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  • USEARCH_SINTAX_Based_dix_seq管道分类器参考数据集

    2026年1月20日 30 55 4

    数据集概述 本数据集包含dix-seq分析流程中使用的USEARCH SINTAX分类器参考数据库，具体包括rdp_16s_v18_sp、PR2_4.14和unite_10.05.2021三个数据库，用于扩增子数据的物种分类注释。 文件详解 文件名称：unite_10.05.2021.zip 文件格式：ZIP...
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  • BeetRepeats_Based_甜菜及近缘种重复序列参考数据库_v1_0

    2026年1月20日 30 2 0

    数据集概述...
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  • Fungal_18S_RefSeq_真菌核糖体RNA项目采集者鉴定者关联数据

    2026年1月20日 30 170 36

    数据集概述 本数据集包含真菌18S核糖体RNA参考序列目标基因座项目的自然历史标本数据，关联了标本的采集者与鉴定者信息。数据由志愿者在Bionomia平台标注，基于全球生物多样性信息设施（GBIF）聚合的标本数据，以Frictionless Data数据包格式组织，共9个文件。 文件详解 数据文件...
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  • Dryad_Based_澳大利亚海狮粪便DNA焦磷酸测序饮食分析数据_2009

    2026年1月19日 30 168 65

    数据集概述 本数据集为澳大利亚海狮（Arctocephalus pusillus doriferus）饮食分析研究的原始数据，通过焦磷酸测序技术从三个繁殖 colony（Seal Rocks、Lady Julia Percy、Skerries）的270份粪便样本中提取猎物DNA，识别出54种硬骨鱼、4种软骨鱼和4种头足类动物，揭示不同 colony...
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  • Helianthus_annuus_Based向日葵转录组微卫星基因表达分化研究数据

    2026年1月18日 30 132 110

    数据集概述 本数据集包含向日葵转录组图谱数据，研究微卫星在基因表达分化中的潜在作用。通过对美国堪萨斯州和俄克拉荷马州六个种群的向日葵进行转录组测序，分析不同纬度种群间差异表达转录本与微卫星的关联，探索适应性遗传变异机制。 文件详解 Reference_173.fasta 文件格式：FASTA...
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  • Pocillopora_Based_Indo_Pacific珊瑚多标准物种界定研究数据_2023

    2026年1月9日 30 165 135

    数据集概述 本数据集为Indo-Pacific海域Pocillopora珊瑚的物种界定研究数据，基于基因组学、形态学、生物地理学及共生生态学多标准展开。包含356个珊瑚群体的全基因组SNP数据、微形态测量数据、共生藻关联数据等，用于解析该属珊瑚系统发育、提出物种假说并验证多证据一致性，支持珊瑚分类修订与保护。 文件详解 基因组与遗传数据...
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  • BCI_Metabarcoding_Based巴拿马腐肉蝇DNA生物多样性监测数据

    2026年1月15日 30 206 30

    数据集概述 本数据集为评估腐肉蝇DNA宏条形码在生物多样性监测中的效能而产生，包含在巴拿马巴罗科罗拉多岛（BCI）开展的腐肉蝇采样及宏条形码分析相关数据。通过16S和12S引物进行测序，并对比BLAST与PROTAX工具的物种鉴定效果，检测到20种哺乳动物、4种鸟类和1种蜥蜴物种，为该技术在生物多样性监测中的应用提供数据支持。 文件详解...
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  • ZooKeys_补充材料_4_Monacha_cantiana种群分子分析补充数据

    2026年1月14日 30 169 165

    数据集概述 本数据集为论文《Monacha cantiana系统地理学下一步：法国北部与荷兰种群》的补充材料4，包含用于分子分析比较的GenBank ITS2序列数据，其中单倍型以粗体标注，支持对该物种种群遗传结构的研究。 文件详解 文件名称：oo_1031129.docx 文件格式：DOCX...
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