eDNA淡水系统鱼类元条形码研究障碍分析数据

数据集概述

本数据集为新热带区等生物多样性高的淡水系统鱼类eDNA宏条形码研究相关数据,包含3个文件,涉及12S rRNA基因片段的分类分辨率评估、亚马逊地区水样eDNA与传统网捕采样的生物多样性比较分析,以及自制的373条新热带鱼类参考序列数据,用于鱼类生物多样性监测方法的验证与优化研究。

文件详解

  • README-file.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 内容介绍:可能包含数据集说明、样本信息、实验设计、分析步骤等元数据或实验记录
  • Fish_S2_L001_R1_001.fastq.gz
  • 文件格式:FASTQ.GZ(压缩的测序数据格式)
  • 内容介绍:鱼类eDNA宏条形码测序的R1端原始读数文件,包含测序序列及其质量信息
  • Fish_S2_L001_R2_001.fastq.gz
  • 文件格式:FASTQ.GZ(压缩的测序数据格式)
  • 内容介绍:鱼类eDNA宏条形码测序的R2端原始读数文件,与R1端配对,用于序列拼接和分析

数据来源

论文“eDNA in a bottleneck: obstacles to fish metabarcoding studies in megadiverse freshwater systems”

适用场景

  • 淡水鱼类eDNA宏条形码方法优化: 用于评估12S rRNA基因片段的分类分辨率,探索多标记或定制阈值等改进策略
  • 生物多样性监测技术比较: 分析eDNA宏条形码与传统网捕采样在α、β多样性评估中的差异
  • 新热带区淡水鱼类参考数据库构建: 基于373条新热带鱼类序列,完善鱼类eDNA分类参考体系
  • 淡水生态系统生物多样性评估: 支持亚马逊等生物多样性高的淡水系统鱼类群落结构监测与分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 950.91 MiB
最后更新 2026年2月9日
创建于 2026年2月9日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。