Dryad_Based_澳大利亚海狮粪便DNA焦磷酸测序饮食分析数据_2009

数据集概述

本数据集为澳大利亚海狮(Arctocephalus pusillus doriferus)饮食分析研究的原始数据,通过焦磷酸测序技术从三个繁殖 colony(Seal Rocks、Lady Julia Percy、Skerries)的270份粪便样本中提取猎物DNA,识别出54种硬骨鱼、4种软骨鱼和4种头足类动物,揭示不同 colony 猎物组成差异,共包含12个相关文件。

文件详解

  • 说明文档类(TXT格式)
  • 文件名称:README_for_Seq Quality (zipped) Folder.txt、README_for_1.SealRocks.454Reads.txt、README_for_2.LadyJuliaPercy.454Reads.txt、README_for_3.Skerries.454Reads.txt、README_for_Reference Sequences 16S long.txt、README_for_Reference Sequences 16S short.txt
  • 内容:对应各文件/文件夹的说明文档,解释数据来源、处理方法或参考序列信息
  • 测序数据类(FNA格式)
  • 文件名称:1.SealRocks.454Reads.fna、2.LadyJuliaPercy.454Reads.fna、3.Skerries.454Reads.fna
  • 内容:三个繁殖 colony 的Roche GS-FLX平台原始测序序列文件
  • 参考序列类(TXT格式)
  • 文件名称:Reference Sequences 16S long.txt、Reference Sequences 16S short.txt
  • 内容:线粒体16S基因的长短参考序列,包含物种分类信息(如澳大利亚海狮序列)
  • 质量文件类(ZIP格式)
  • 文件名称:Seq Quality (zipped) Folder.zip
  • 内容:压缩文件夹,包含序列质量相关数据

数据来源

Dryad数据平台,对应论文“Analysis of Australian fur seal diet by pyrosequencing prey DNA in faeces”(作者DEAGLE, BRUCE E.等)

适用场景

  • 海洋哺乳动物饮食结构研究: 分析澳大利亚海狮的猎物组成及不同繁殖地的饮食差异
  • 分子生态学技术应用: 验证焦磷酸测序技术在动物粪便DNA饮食分析中的有效性
  • 海洋生态系统 trophic 关系分析: 通过猎物组成揭示海狮与海洋生物群落的营养联系
  • 猎物资源可用性评估: 结合不同 colony 猎物DNA比例差异,推断区域猎物资源分布特征
  • 饮食分析技术对比: 对比DNA焦磷酸测序与传统硬组织分析方法的物种识别能力差异
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 7.92 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。