数据集概述
本数据集是R包PrimerMiner的配套数据，用于DNA宏条形码引物的开发与计算机模拟验证。包含COI基因的参考序列数据，通过批量下载BOLD和NCBI数据库的序列并聚类为操作分类单元（OTUs）生成，支持针对特定类群或生态系统的引物优化，解决现有工具缺乏批量处理参考序列的问题。
文件详解
- COI Folmer region.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于引物开发的细胞色素c氧化酶亚基I（COI）Folmer区域参考序列数据，可能涵盖从数据库批量获取的原始序列及聚类后的OTU序列对齐结果
- COI Primer bind.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含引物结合位点相关的序列数据，支持使用PrimerMiner进行引物的计算机模拟验证，评估引物结合效率与潜在偏倚
数据来源
R包PrimerMiner配套数据（关联标题：Data from: PrimerMiner: an R package for development and in silico validation of DNA metabarcoding primers）
适用场景
- 宏条形码引物开发: 利用COI参考序列数据设计针对淡水无脊椎动物等类群的优化引物
- 引物计算机模拟验证: 通过PrimerMiner评估引物结合效率，减少扩增偏倚
- 生物多样性评估工具优化: 为DNA宏条形码技术的引物设计提供数据支持，提升生物多样性检测准确性
- 参考序列数据处理研究: 分析批量获取NCBI/BOLD数据库序列并聚类为OTU的方法学效果
