数据集概述
本数据集为北美泥炭地Sphagnum核心微生物组研究的补充表格，包含10个Excel文件。研究覆盖美国5个州17个泥炭地/沼泽站点的18种Sphagnum物种，通过宏基因组、宏转录组和双同位素示踪实验，揭示固氮-甲烷氧化微生物在泥炭地碳氮循环中的核心作用，核心微生物组12个属占相对丰度的60%。
文件详解
- 文件名称：Table S1. Samples collected in this study.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录研究中采集的样本信息，包括站点、Sphagnum物种等基础元数据
- 文件名称：Table S2. Amplicons PCR conditions.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：列出扩增子PCR实验的条件参数
- 文件名称：Table S4. Taxonomic composition of the Sphagnum-associated microbial communities at the phylum level.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Sphagnum关联微生物群落的门水平分类组成数据
- 文件名称：Table S5. Taxonomic composition of the Sphagnum-associated microbial communities at the order level.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Sphagnum关联微生物群落的目水平分类组成数据
- 文件名称：Table S7. Taxonomic composition of the prokaryotic Sphagnum-associated core microbiome.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：原核生物中Sphagnum核心微生物组的分类组成数据
- 文件名称：Table S8. Summary of metagenomic and metatranscriptomic libraries quality control.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：宏基因组和宏转录组文库的质量控制汇总数据
- 文件名称：Table S9. Taxonomic composition of contig community at the phylum level.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：contig群落的门水平分类组成数据
- 文件名称：Table S10. The heat map of the Chip-SIP data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Chip-SIP实验数据的热图相关数据
数据来源
论文“Defining the Sphagnum core microbiome across the North American continent reveals a central role for diazotrophic-methanotrophs in the nitrogen and carbon cycles of boreal peatland ecosystems”
适用场景
- 泥炭地微生物生态学研究: 分析Sphagnum核心微生物组的群落组成及空间分布规律
- 碳氮循环耦合机制分析: 探究固氮-甲烷氧化微生物在泥炭地碳氮循环中的功能作用
- 微生物分类组成研究: 基于门、目水平分类数据，解析Sphagnum关联微生物的多样性特征
- 生态系统功能评估: 评估贫营养泥炭地中微生物对碳氮循环的支撑作用及生态功能
- 实验方法参考: 为相关微生物组研究提供扩增子PCR条件、测序文库质控等实验方法参考
