数据集概述
该数据集包含面包果属（Artocarpus）517基因的系统发育研究数据，覆盖96%的类群，整合新鲜叶片与博物馆标本（最长106年）的DNA序列。内容涉及序列组装、基因树分析、分区策略等，为该属分类修订及目标富集数据研究提供基础。
文件详解
数据集包含10个文件，具体说明如下：
- README_nametable.txt：文本文件，提供序列名称修正对照表，含比对中的旧名称、树文件与图表中的修正名称、原始 reads 文件前缀
- trees_for_dryad.zip：压缩文件，包含系统发育树相关数据
- Tables_S1-S4.zip：压缩文件，包含补充表S1至S4
- supermatrices.zip：压缩文件，包含超级矩阵数据
- supercontig_raw_unaligned.zip：压缩文件，包含超级contig原始未比对序列
- supercontig_aligned_trimmed.zip：压缩文件，包含超级contig比对后修剪的序列
- Figs_S1-S25.zip：压缩文件，包含补充图S1至S25
- exon_raw_unaligned.zip：压缩文件，包含外显子原始未比对序列
- exon_aligned_trimmed.zip：压缩文件，包含外显子比对后修剪的序列
- Appendix_1_and_2.pdf：PDF文件，包含附录1和附录2
适用场景
- 植物系统发育研究：分析面包果属的分类关系与类群修订
- 分子进化分析：探究基因树冲突、序列分区对系统发育分辨率的影响
- 博物馆标本DNA研究：优化退化DNA的目标富集序列组装方法
- 生物信息学方法验证：测试不同数据分析工具与策略的稳健性
- 分类学应用：为面包果属物种的分类修订提供分子数据支持
