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CEFCON_Based_单细胞转录组细胞命运调控因子研究数据
2026年2月8日 30 46 43
数据集概述 本数据集为论文“Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with...
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IAN_Based_转录组学数据集评估_性能测试数据
2026年1月31日 30 138 28
数据集概述 本数据集包含用于评估IAN性能的两个已发表RNA-Seq转录组学数据集，分别来自葡萄膜炎患者与健康对照的差异表达基因（DEG）研究，以及贝赫切特病（BD）患者与健康对照的原始RNA-Seq数据。数据经标准化整理，用于支持生物信息学工具性能验证，共包含4个文件。 文件详解 文件名称：uveitis-...
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胶质母细胞瘤_星形胶质细胞_尿素循环_异质性分析数据
2026年1月31日 30 113 73
数据集概述 本数据集为胶质母细胞瘤研究相关数据，包含14个文件，覆盖临床信息、基因突变、基因矩阵、细胞标志物、生存分析、基因互作、通路富集等内容，用于支持单细胞RNA测序与 bulk转录组联合分析，揭示星形胶质细胞尿素循环的异质性特征。 文件详解 临床与基因突变类 TableS2 clinical.json（JSON格式）：临床信息数据 TableS3...
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Melatonin_Mice_Ovary_RNA_Seq_基因表达数据
2026年1月26日 30 75 56
数据集概述 本数据集为褪黑素处理小鼠卵巢的RNA测序数据，通过对10日龄小鼠注射褪黑素至17日龄后采集卵巢样本测序，用于研究褪黑素对小鼠早期卵泡生长的影响。数据集仅包含一个压缩文件。 文件详解 文件名称：RNA-seq_result.zip 文件格式：ZIP...
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Spatially_Resolved_周围神经鞘瘤良恶性空间转录组学研究数据
2026年1月20日 30 107 93
数据集概述 本数据集为周围神经鞘瘤（PNSTs）良恶性空间转录组学研究数据，涵盖良性及恶性PNSTs的空间转录组信息，通过空间聚类分析、加权相关网络分析等方法构建基因表达模块，整合转录数据与组织学特征，旨在揭示PNSTs的空间异质性及生物学特性，包含2个文件。 文件详解 文件名称：Sample_list.xlsx 文件格式：XLSX...
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PreNeu_Based_肿瘤相关中性粒细胞前体DNA修复影响研究数据
2026年1月22日 30 85 77
数据集概述 本数据集包含3项单细胞测序实验的基因表达矩阵，聚焦肿瘤相关中性粒细胞前体（PreNeu）对乳腺癌细胞DNA修复的影响。PreNeu富集于女性高增殖激素依赖性乳腺癌，通过分泌琥珀酸抑制同源重组，促进PARP-1调控的易错DNA修复，增加肿瘤基因组不稳定性。数据支持分析PreNeu与PARP抑制剂敏感性的关联。 文件详解...
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GSE113293_Based_小鼠睾丸单细胞RNA测序基因调控分析数据
2026年1月22日 30 123 8
数据集概述 本数据集为小鼠睾丸单细胞RNA测序的处理数据，来自研究5种小鼠品系睾丸基因调控与病理学的统一单细胞分析。包含细胞元数据、标准化表达矩阵、基因注释、基因本体富集等关键分析结果，以及质控、基因调控概率矩阵等辅助数据，支持对睾丸细胞类型、基因表达模式及调控机制的研究。 文件详解 核心分析对象压缩包： 文件名称：SDA_objects.zip...
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Treg_Based_肿瘤微环境靶向免疫及CD8_T细胞耗竭逆转研究数据
2026年1月21日 30 210 85
数据集概述 本数据集记录了通过空间和功能靶向肿瘤微环境中调节性T细胞（Treg）以诱导强效抗肿瘤免疫并逆转CD8 T细胞耗竭的研究实验数据。内容包含从野生型（WT）和基因敲除（KO）小鼠中分离的Treg细胞RNA测序及下游分析结果，涉及基因表达矩阵、差异表达基因列表、目标基因列表及可视化代码，总计4个文件。 文件详解 数据文件...
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Ciona_a9_49lineage_原脊椎动物模型神经嵴谱系单细胞分析数据
2026年1月20日 30 10 5
数据集概述 本数据集为原脊椎动物模型Ciona幼虫的单细胞RNA-seq重分析数据，基于Cao等人的原始数据（GSE131155），重新映射到2022年发布的Ciona...
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Camptotheca_De_novo_喜树基因组组装与抗癌化合物生物合成研究数据
2026年1月15日 30 76 54
数据集概述 本数据集包含喜树（Camptotheca acuminata）的高质量从头基因组组装及相关注释数据，喜树是抗癌化合物喜树碱的天然来源。数据涵盖基因组序列、基因模型、功能注释、BUSCO评估结果、基因表达矩阵及系统发育树等，共15个文件，为喜树碱生物合成途径研究及药物开发提供基础。 文件详解 基因组组装文件...
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Brachycephalus_Bd_GPL_Brazil_两栖动物宿主免疫反应研究数据
2026年1月14日 30 205 59
数据集概述 本数据集是论文“Host immune responses to enzootic and invasive pathogen lineages vary in magnitude, timing, and efficacy”的第二次发布版本，用于Zenodo存档。包含18个文件，涉及Brachycephalus pitanga暴露于Bd-...
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Helicoverpa_armigera_Based棉铃虫迁徙飞行活动全基因组转录特征研究数据
2026年1月12日 30 97 5
数据集概述 本数据集聚焦全球入侵害虫棉铃虫的迁徙飞行活动，通过系留飞行实验与转录组测序技术，分析不同飞行表型个体的全基因组转录特征。包含飞行距离表型数据、基因表达矩阵、差异表达分析结果及功能注释等文件，揭示迁徙飞行相关的基因表达变化，为昆虫迁徙分子机制研究提供基础数据。 文件详解 飞行表型数据 文件名称：flight_mill_total...
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甜菜夜蛾基因组与转录组分析数据集
2025年12月22日 30 133 30
数据集概述 该数据集包含甜菜夜蛾（Spodoptera exigua）的高质量基因组组装及覆盖主要发育阶段的转录组数据，涵盖基因组测序、基因注释及发育阶段特异性表达分析结果，为鳞翅目害虫防控提供潜在靶基因信息。 文件详解 ReadMe.pdf：PDF格式文档，可能包含数据集的详细说明、研究背景、分析方法及文件使用指南...
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MUUMI多组学数据整合R包案例研究输入输出文件数据集
2025年12月15日 30 94 54
数据集概述 本数据集包含论文《MUUMI: an R package for statistical and network-based meta-analysis for MUlti-omics data Integration》中两个案例研究的输入与输出文件，支持复现研究结果，涉及特发性肺纤维化转录组数据及THP-1巨噬细胞多组学数据的整合分析。...
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肾上腺皮质癌空间转录组学处理数据集
2025年12月15日 30 68 39
数据集概述 该数据集为人类肾上腺皮质癌（ACC）样本的空间转录组学处理数据，包含经10x Genomics Visium平台处理生成的图像文件与过滤后表达矩阵，支持研究肾上腺皮质癌组织的基因表达空间分布特征。 文件详解 该数据集包含9个文件，具体说明如下： - 过滤后表达矩阵文件（共3个，.gz格式）： -...
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肿瘤相关巨噬细胞功能表型分子机制研究数据集
2025年12月14日 30 141 90
数据集概述 本数据集围绕肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）功能表型的分子机制展开，包含空间转录组、空间代谢组及两者匹配的多组学数据，用于研究肿瘤微环境中TAMs表型形成的调控因素及重编程机制。 文件详解 文件名称: Alignment.zip，文件格式: ZIP压缩包，内容: 空间转录组与空间代谢组数据的点对匹配结果，包含统一坐标系下的空间关联信息...
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帚虫基因组支持触手冠动物单系性数据集
2025年12月14日 30 209 83
数据集概述 本数据集包含帚虫Phoronis australis的染色体水平基因组组装、基因模型及转录组数据，还涵盖腕足动物、苔藓动物等相关物种的基因模型与转录组组装，为研究触手冠动物（Lophophorata）的单系性提供基因组结构与转录组表达证据。 文件详解 帚虫（Phoronis australis）相关文件：...
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单细胞RNA测序分析指南数据集
2025年12月13日 30 209 87
数据集概述 本数据集为单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析提供指导数据，包含骨髓样本的基因表达矩阵、用于细胞类型注释的参考数据集，支持Seurat、Azimuth和SingleR等分析工具的应用。 文件详解 该数据集包含三个核心压缩文件，具体说明如下： - data.zip: - 文件格式: ZIP压缩包 - 内容:...
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van_Hijfte_GBM_2022_A_Based_胶质母细胞瘤单细胞转录组分析完整数据
2025年12月13日 30 188 30
数据集概述 该数据集包含2022年A版本的van Hijfte胶质母细胞瘤（GBM）单细胞核RNA测序原始计数数据，涵盖MGMT甲基化、EGFR不稳定、IDH野生型等肿瘤特征，以及患者性别和切除年龄信息。 文件详解 单细胞核RNA测序核心文件（.gz格式）： barcodes.tsv.gz：存储细胞条形码信息...
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SimpleTidy_GeneCoEx仓库示例基因表达矩阵数据集
2025年12月11日 30 31 26
数据集概述 本数据集是SimpleTidy_GeneCoEx仓库使用的示例基因表达矩阵，由kallisto生成，数据来源于Shinozaki等人2018年的研究，包含代表性转录本的TPM表达数据，为基因共表达分析相关研究提供示例数据支持。 文件详解 文件名称：Shinozaki_tpm_representative_transcripts.zip...
