数据集概述
本数据集包含3项单细胞测序实验的基因表达矩阵，聚焦肿瘤相关中性粒细胞前体（PreNeu）对乳腺癌细胞DNA修复的影响。PreNeu富集于女性高增殖激素依赖性乳腺癌，通过分泌琥珀酸抑制同源重组，促进PARP-1调控的易错DNA修复，增加肿瘤基因组不稳定性。数据支持分析PreNeu与PARP抑制剂敏感性的关联。
文件详解
- 实验1数据文件：smartseq2_experiment1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含luminal B型乳腺肿瘤活检来源的成熟中性粒细胞（MatNeu）和中性粒细胞前体（PreNeu）的SMART-Seq2 RNA测序原始计数基因表达矩阵
- 实验2数据文件：smartseq2_experiment2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含luminal B型乳腺肿瘤活检或人脐带血单个核细胞来源的MatNeu和PreNeu的SMART-Seq2 RNA测序vst标准化基因表达值矩阵
- 实验3数据文件：sc_LumB_PreNeu_MatNeu_experiment3.RDS
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：包含高增殖ER+乳腺癌活检样本的BD Rhapsody单细胞RNA测序数据，以R语言Seurat对象格式存储，涵盖细胞聚类、基因表达、通路富集等分析结果
数据来源
论文“Tumor-associated neutrophil precursors impair homologous DNA repair and promote sensitivity to PARP-inhibition”
适用场景
- 肿瘤免疫微环境研究：分析PreNeu在激素依赖性乳腺癌中的富集特征及对肿瘤进展的调控机制
- DNA修复通路机制研究：探究PreNeu分泌的琥珀酸对同源重组修复的抑制作用及PARP-1介导的非同源末端连接通路激活机制
- PARP抑制剂敏感性预测：基于PreNeu评分与乳腺癌患者拷贝数变异的相关性，开发PARP抑制剂疗效预测模型
- 肿瘤治疗靶点筛选：验证靶向PreNeu相关通路对增强肿瘤细胞杀伤效果的潜在价值
- 单细胞转录组数据分析：利用SMART-Seq2和BD Rhapsody数据，开展中性粒细胞亚群分型及功能注释研究
