数据集概述
本数据集为论文“Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with CEFCON”的配套数据资源,包含8个文件,涵盖细胞命运调控因子分析所需的各类数据,支持从单细胞转录组数据中解析细胞命运决策的驱动调控因子研究。
文件详解
- 压缩文件(共6个)
- 文件名称:CEFCON-data.zip、Harmonizome_nichenet.zip、PathwayCommons12.All.hgnc.zip、Omnipath_interaction.zip、NicheNet_human.zip、InBioMap.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含CEFCON分析工具数据、基因调控网络数据、通路数据、相互作用数据等各类生物信息学资源压缩包
- 单细胞转录组数据文件(共2个)
- 文件名称:mouse_hsc_nestorowa16_v0.h5ad、mouse_hsc_nestorowa16_v1.h5ad
- 文件格式:H5AD
- 字段映射介绍:小鼠造血干细胞(HSC)单细胞转录组数据文件,包含基因表达矩阵及细胞注释信息等单细胞分析核心数据
数据来源
论文“Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with CEFCON”
适用场景
- 细胞命运调控机制研究:用于从单细胞转录组数据中解析细胞命运决策的驱动调控因子
- 单细胞转录组数据分析:支持小鼠造血干细胞等细胞类型的单细胞转录组数据挖掘
- 基因调控网络构建:利用配套的调控网络、通路及相互作用数据构建细胞命运相关的基因调控网络
- 生物信息学工具验证:为CEFCON等细胞命运分析工具提供测试数据及参考资源