找到29个数据集

标签: 序列比对分析

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  • 狐蝠科线粒体基因组基因特异性替代率数据_2025年

    2026年1月31日 30 14 5

    数据集概述 本数据集包含蝙蝠科(Vespertilionidae)线粒体基因组的基因特异性替换率数据,以及三个新线粒体基因组的描述信息。数据涵盖基因注释、序列比对、系统发育树及BEAST分析结果,支持蝙蝠线粒体基因组进化研究,共含10个文件。 文件详解 注释数据文件 文件名称:annotation_data.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • raw_data_Based_生物学原始实验数据文件集

    2026年1月30日 30 73 66

    数据集概述 本数据集为生物学领域的原始实验数据文件集,包含三十个文件,覆盖FASTA、PDB、TXT、CSV、TSV、XLSX、R等七种格式,涉及信号强度测量、序列比对、结构分析、数据处理脚本等内容,无明确目录结构,可用于生物信息学相关分析。 文件详解 数据文件类 信号强度测量文件:如Fig. S9Dand...
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  • reassortment_Based_流感病毒重配路径研究数据

    2026年1月28日 30 4 3

    数据集概述 本数据集围绕流感病毒重配路径研究展开,包含支持重配事件检测算法开发的相关文件。研究提出两种检测方法(MLreassort和Breassort),可识别流感等分段病毒的重配事件,数据集含2个压缩文件,用于算法实现与验证。 文件详解 文件名称:scripts_reassort.zip 文件格式:ZIP...
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  • CmeA_Based周质适配蛋白预测结构及CmeABC组装模型数据

    2026年1月27日 30 106 92

    数据集概述 本数据集包含CmeA周质适配蛋白的预测结构、序列比对结果,以及CmeABC转运蛋白复合体的完整组装模型,内容源自Kahlan Newman博士论文的第六章。数据以单个压缩文件形式呈现,为研究CmeA蛋白结构与功能及CmeABC复合体组装机制提供支持。 文件详解 文件名称:Chapter_6.zip 文件格式:ZIP...
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  • wrynecks_Based糖感知选择性丧失研究数据_生物进化分析

    2026年1月27日 30 161 153

    数据集概述 本数据集围绕啄木鸟科鸟类味觉受体进化展开,聚焦 wrynecks 单氨基酸突变导致糖感知选择性丧失的分子机制,包含受体序列比对、祖先序列重建、实验结果表格及食性数据等,用于研究脊椎动物感官受体逆转的分子基础与结构功能关系。 文件详解 序列文件(.fasta格式)...
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  • OGRDB_Based_小鼠CAST_EiJ品系IGLV免疫受体种系参考数据集

    2026年1月19日 30 101 84

    数据集概述 本数据集为小鼠CAST/EiJ品系的IGLV免疫受体种系参考数据,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),包含种系序列的带间隙、无间隙Fasta文件、JSON格式数据及许可文件,共4个文件,支持免疫受体相关的生物信息学研究。 文件详解 EiJ IGLV_rev_1.json 文件格式:JSON...
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  • Latent_infection_Based_单细胞绿藻巨型内源性病毒潜伏感染研究补充数据

    2026年1月12日 30 157 129

    数据集概述 本数据集是论文《Latent infection of an active giant endogenous virus in a unicellular green alga》的补充数据,包含7个文件,涉及单细胞绿藻中巨型内源性病毒潜伏感染相关的基因组序列、蛋白质序列、模型文件及重复序列信息,支持病毒基因结构、蛋白质模型及序列特征的研究。...
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  • Geneious_Source_Oreocarya基因组简化测序系统发育研究数据

    2026年1月15日 30 45 32

    数据集概述 本数据集基于Geneious平台的简化基因组测序方法,针对Boraginaceae科Oreocarya属25个类群开展系统发育研究,包含核核糖体顺反子、质体组及12个线粒体基因数据,支持植物系统发育分析及基因组资源开发。 文件详解 文件名称:mtDNA exon alignments.zip 文件格式:ZIP...
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  • Oslofjord_Tunnel_Based_新厌氧氨氧化菌科MAGs基因注释与序列数据

    2026年1月13日 30 101 42

    数据集概述 本数据集包含三个代表奥斯陆峡湾隧道新厌氧氨氧化菌科的宏基因组组装基因组(MAGs)相关数据,涵盖DRAM注释结果、优化的blastp分析结果,以及基因核苷酸和氨基酸序列,共3个文件,支持微生物基因功能与分类研究。 文件详解 文件名称:3_MAGs_annotations_and_blastp_results.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Adeno_associated_virus_2_Based美国儿童急性重症肝炎病毒研究数据

    2026年1月12日 30 148 138

    数据集概述 本数据集包含论文“Adeno-associated virus type 2 in children from the United States with acute severe...
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  • SARS2r_CoV_Supplementary_中国野味动物数据集新型冠状病毒法医分析数据

    2026年1月12日 30 186 158

    数据集概述 本数据集为新型SARS2r-CoV法医分析的补充信息与数据,包含病毒基因组序列、填充间隙的基因组序列、序列比对文件及相关补充表格,支持研究该病毒与穿山甲GX CoV分支的进化关系及遗传特征分析。 文件详解 补充信息文件 文件名称:Supp_Info_2.xlsx、Supp_Info_3.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • TAXON_Submitted_Apiaceae科Selineae分支系统基因组学序列比对数据_2025

    2026年1月1日 30 30 24

    数据集概述 本数据集为投稿至TAXON期刊的植物系统基因组学研究配套数据,包含北美多年生特有芹亚科Selineae分支的序列比对信息,涉及样本标识符、主分析数据等内容,用于支持该分支的系统发育关系研究与分类界定。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • 聂氏副短颈绦虫线粒体基因组研究补充材料4_2018

    2025年12月24日 30 115 17

    数据集概述 本数据集为聂氏副短颈绦虫(Parabreviscolex niepini)线粒体基因组研究的补充材料,包含其转运RNA基因trnS1与其他绦虫物种的序列比对图,用于辅助解析该物种的分子特征。 文件详解 文件名称: oo_227017.jpg 文件格式: JPG(.jpg) 文件内容:...
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  • Nudix超家族功能进化数据集

    2025年12月23日 30 80 36

    数据集概述 该数据集围绕Nudix超家族蛋白功能进化展开,整合了205个Nudix蛋白的实验与结构数据,修正并补充了基因本体注释,构建了序列比对与系统发育树,分析了水解酶基序下游环区的结构功能关系,揭示功能辐射的结构基础及系统发育规律。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 代码文件: - 3DCOMB_alignment.py:...
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  • 土耳其黄芪属新物种ITS序列比对表

    2025年12月20日 30 195 51

    数据集概述 该数据集为土耳其黄芪属新物种(H. yilmazunalii)的ITS序列比对表,包含其与近缘种H. candidissimum的核苷酸差异对比,由MEGA 6.0构建,支持植物分类学研究。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML (.html) 内容说明:包含H. yilmazunalii与H....
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  • 大肠杆菌K_12_MG1655的Albacore与Flappie序列召回对比数据集

    2025年12月12日 30 186 1

    数据集概述 本数据集基于大肠杆菌K-12 MG1655的超长读长测序数据,对比Albacore和Flappie两种工具的序列召回结果,包含原始测序数据处理后的序列文件、比对结果及可视化脚本。 文件详解 文件名称: aligned_all_ddea.fa,文件格式: FA (.fa),为序列比对结果文件,包含核苷酸序列比对信息 文件名称:...
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  • 结核分枝杆菌复合群最近共同祖先基因组数据集

    2025年12月5日 30 185 65

    数据集概述 本数据集包含结核分枝杆菌复合群(MTBC)最近共同祖先的基因组参考序列及相关分析图表,基于2010年发表的研究构建,可用于区分MTBC不同分支的祖先与衍生突变,为结核分枝杆菌进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:MTB_ancestor_reference.fasta 文件格式:FASTA(.fasta)...
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  • 质体外膜蛋白进化历史研究的比对与树文件数据集

    2025年12月5日 30 51 21

    数据集概述 该数据集包含为研究“质体外膜蛋白的进化历史——结构-序列比较”而生成的比对文件与系统发育树文件,涉及OEP40、OEP21A_B等多个质体外膜蛋白家族,支持结构与序列层面的进化分析。 文件详解 系统发育树文件(.treefile格式,共5个): OEP40_ginsi.fas.treefile:OEP40蛋白序列的系统发育树文件...
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  • Eresus属蜘蛛新物种分类研究补充材料2025

    2025年12月14日 30 35 17

    数据集概述 该数据集为Eresus属蜘蛛新物种分类研究的补充材料,包含研究中使用的序列比对信息,支持对高加索地区新发现Eresus物种的分类学验证,为蜘蛛分类学研究提供数据支撑。 文件详解 文件名称: oo_1393279.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 研究中使用的序列比对相关补充材料,具体字段及内容需通过PDF文档查看 适用场景...
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  • 蜘蛛蝇系统发育基因组学研究补充材料数据集

    2025年12月14日 30 169 125

    数据集概述 本数据集为蜘蛛蝇(双翅目,Acroceridae)系统发育基因组学研究的补充材料,包含支撑论文结论的补充图表、核苷酸与氨基酸序列比对及基因分区文件,用于揭示其演化关系及核苷酸与氨基酸数据的不一致性。 文件详解 该数据集包含六个独立文件,具体说明如下: - 文档类文件: -...
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