数据集概述
本数据集基于Geneious平台的简化基因组测序方法，针对Boraginaceae科Oreocarya属25个类群开展系统发育研究，包含核核糖体顺反子、质体组及12个线粒体基因数据，支持植物系统发育分析及基因组资源开发。
文件详解
- 文件名称：mtDNA exon alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含线粒体DNA外显子序列的比对文件
- 文件名称：Final ML trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含最终的最大似然法构建的系统发育树文件
- 文件名称：Nicotiana tabacum exons BA000042.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含烟草（Nicotiana tabacum）外显子序列参考数据（编号BA000042）
- 文件名称：cpDNA alignment.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含叶绿体DNA序列的比对文件
- 文件名称：nrDNA alignment.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含核核糖体DNA序列的比对文件
- 文件名称：mtDNA exon sequences.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含线粒体DNA外显子的原始序列文件
数据来源
论文“Data from: Geneious! Simplified genome skimming methods for phylogenetic systematic studies: a case study in Oreocarya (Boraginaceae)”
适用场景
- 植物系统发育分析：利用系统发育树及序列比对数据，研究Oreocarya属物种间的亲缘关系
- 基因组资源开发：基于核核糖体、质体组及线粒体基因数据，构建Oreocarya属基因组资源库
- 测序方法验证：验证简化基因组测序方法在植物系统发育研究中的适用性
- 比较基因组学研究：通过与烟草参考序列对比，分析Oreocarya属基因组特征
