数据集概述
本数据集基于大肠杆菌K-12 MG1655的超长读长测序数据,对比Albacore和Flappie两种工具的序列召回结果,包含原始测序数据处理后的序列文件、比对结果及可视化脚本。
文件详解
- 文件名称: aligned_all_ddea.fa,文件格式: FA (.fa),为序列比对结果文件,包含核苷酸序列比对信息
- 文件名称: called_flappie_Ecoli_MinKNOW_1.4_RAD002_Sambrook.fq.gz,文件格式: 压缩FASTQ (.fq.gz),为Flappie工具召回的序列文件
- 文件名称: called_albacore_Ecoli_MinKNOW_1.4_RAD002_Sambrook.fq.gz,文件格式: 压缩FASTQ (.fq.gz),为Albacore工具召回的序列文件
- 文件名称: msa_nucl.png,文件格式: PNG (.png),为多序列比对的可视化图片
- 文件名称: spiralign.r,文件格式: R脚本 (.r),为序列比对可视化的R语言源代码
适用场景
- 生物信息学工具评估: 对比不同碱基识别工具的序列召回性能
- 测序数据分析: 研究大肠杆菌K-12 MG1655的超长读长测序数据特征
- 可视化方法应用: 探索序列比对结果的螺旋可视化呈现方式
- 计算生物学研究: 分析不同参数设置对测序数据处理结果的影响