大肠杆菌K_12_MG1655的Albacore与Flappie序列召回对比数据集

数据集概述

本数据集基于大肠杆菌K-12 MG1655的超长读长测序数据,对比Albacore和Flappie两种工具的序列召回结果,包含原始测序数据处理后的序列文件、比对结果及可视化脚本。

文件详解

  • 文件名称: aligned_all_ddea.fa,文件格式: FA (.fa),为序列比对结果文件,包含核苷酸序列比对信息
  • 文件名称: called_flappie_Ecoli_MinKNOW_1.4_RAD002_Sambrook.fq.gz,文件格式: 压缩FASTQ (.fq.gz),为Flappie工具召回的序列文件
  • 文件名称: called_albacore_Ecoli_MinKNOW_1.4_RAD002_Sambrook.fq.gz,文件格式: 压缩FASTQ (.fq.gz),为Albacore工具召回的序列文件
  • 文件名称: msa_nucl.png,文件格式: PNG (.png),为多序列比对的可视化图片
  • 文件名称: spiralign.r,文件格式: R脚本 (.r),为序列比对可视化的R语言源代码

适用场景

  • 生物信息学工具评估: 对比不同碱基识别工具的序列召回性能
  • 测序数据分析: 研究大肠杆菌K-12 MG1655的超长读长测序数据特征
  • 可视化方法应用: 探索序列比对结果的螺旋可视化呈现方式
  • 计算生物学研究: 分析不同参数设置对测序数据处理结果的影响
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 14.62 MiB
最后更新 2025年12月17日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。