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HTSinfer_Supplementary_Materials_Based_生物信息学RNA测序元数据推断完整数据
2025年12月16日 30 24 20
数据集概述 本数据集包含用于测试HTSinfer工具的补充材料,HTSinfer是一款基于Python的工具,可从Illumina平台生成的批量RNA测序数据中直接推断元数据。数据集涵盖样本表、结果文件及功能对比表等。 文件详解 README.pdf:PDF格式,提供数据集相关说明...
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全基因组鸟枪法测序与DNA宏条形码物种鉴定对比研究表4数据集
2025年12月14日 30 8 3
数据集概述 该数据集为对比研究中的表4数据,记录了花粉样本全基因组鸟枪法测序(WGS)数据在质量过滤和分类处理步骤中保留的测序读段及Kraken2 k-mer片段数量,包含10个混合物样本、9个单一花粉样本及1个阴性对照的测序数据处理结果。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射:...
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ParaMask多拷贝基因组区域识别方法补充数据集
2025年12月14日 30 161 54
数据集概述 本数据集为论文《ParaMask, a new method to identify multicopy genomic regions, corrects major biases in whole-genome sequencing...
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基于PRIMAD模型和BioCompute_Object的高通量测序案例研究RO_Crate数据集
2025年12月12日 0 138 80
数据集概述 该数据集是基于PRIMAD模型和BioCompute Object(BCO)的高通量测序案例研究RO-Crate,包含研究方法、数据文件及可视化图表等结构化内容,用于评估BCO框架的可重复性,为生物信息学分析的可靠性研究提供支持。 文件详解 ro-crate-metadata.json:JSON格式,RO-...
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大肠杆菌K_12_MG1655的Albacore与Flappie序列召回对比数据集
2025年12月12日 0 68 47
数据集概述 本数据集基于大肠杆菌K-12 MG1655的超长读长测序数据,对比Albacore和Flappie两种工具的序列召回结果,包含原始测序数据处理后的序列文件、比对结果及可视化脚本。 文件详解 文件名称: aligned_all_ddea.fa,文件格式: FA (.fa),为序列比对结果文件,包含核苷酸序列比对信息 文件名称:...
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Galaxy_CRISPR_Screen_Based_基因编辑筛选分析完整数据
2025年12月11日 30 43 9
数据集概述 该数据集为Galaxy平台CRISPR筛选分析教程配套数据,包含原始测序数据、分析配置文件、结果报告等多种类型文件,覆盖CRISPR实验从原始数据到分析结果的全流程,为学习和实践CRISPR筛选数据分析提供完整支持。 文件详解 该数据集包含10个文件,具体说明如下: - 原始测序数据文件(.gz格式): -...
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拟南芥盐度耐受性平行进化研究数据集
2025年12月10日 30 132 126
数据集概述 本数据集包含Martinez-Rivas等人2025年发表于《Science Advances》的研究“Parallel Evolution of Salinity Tolerance in Arabidopsis thaliana Accessions from Cape Verde...
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manabuishii_yevis_getting_started_JGA_Based_全基因组测序数据处理工作流完整数据
2025年12月6日 30 124 63
数据集概述 该数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的工作流之一,围绕日本基因型表型档案库(JGA)的全基因组测序(WGS)数据处理展开,包含工作流配置、质量控制脚本、元数据及说明文档等文件,为JGA数据用户提供标准化的数据分析流程支持。 文件详解 文件名称: README.md,文件格式:...
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EpiSyStem研讨会示例文件集
2025年12月6日 30 16 5
数据集概述 该数据集为EpiSyStem研讨会提供的示例文件集合,包含17个文件,涵盖测序数据、基因组图谱、可视化图表等多种类型,用于辅助研讨会相关技术内容的演示与实践。 文件详解 主要文件类型及示例:...
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EAW_16S_rRNA基因生物信息学课程FASTQ文件2018
2025年12月6日 30 23 15
数据集概述 本数据集包含二零一八年九月在意大利加尔达湖不同区域及深度采集的六个样本的十六S核糖体RNA基因测序数据,采用Illumina MiSeq技术生成,含正向(R1)和反向(R2)测序文件及相关描述文档,适用于生物信息学课程教学与实践。 文件详解 该数据集包含十四份文件,具体说明如下: - 描述文档: -...
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SARS_CoV_2再感染病例基因组证据数据集
2025年12月5日 30 87 61
数据集概述 本数据集围绕SARS-CoV-2再感染病例的基因组证据展开,包含该病例相关的基因组测序数据、变异分析文件、实验方法脚本及附录文档,为研究新冠病毒再感染的基因组特征提供支持。 文件详解 该数据集包含14个文件,按类型分类说明如下: - 基因组变异文件(.vcf格式,共5个): -...



