数据集 - 海数据

植物微生物互作研究_土壤微生物组结构数据集

2026年2月9日 30 48 42

数据集概述本数据集围绕植物-植物、植物-微生物及微生物-微生物互作对土壤微生物组结构的影响展开，包含目标植物（Andropogon gerardii等4种）在不同植物丰富度群落中的土壤微生物采样数据，涉及细菌和链霉菌群落的测序分析及拮抗活性评估，共7个文件。文件详解序列文件（.fasta）...

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MineSV_Test_小样本肿瘤测序测试数据集

2026年2月9日 30 119 18

数据集概述本数据集为MineSV的小样本测试数据集，包含通过bamsurgeon工具合成的正常-肿瘤配对下一代测序数据，用于支持基因组变异检测相关的测试或验证工作。文件详解文件名称：MineSV_Demo_SeqInput.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内包含通过bamsurgeon工具合成的正常-...

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yevis_demo_Based生物信息学工作流文件集

2026年1月31日 30 49 20

数据集概述本数据集是suecharo/yevis-demo中的一个工作流，包含6个文件，无目录层级。文件类型涵盖压缩数据、配置文件、文档等，主要用于支持Yevis工作流注册表的构建与维护，涉及工作流元数据、参数配置、测序数据及流程定义等内容。文件详解 yevis-metadata-1.0.0.yml 文件格式：YML...

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yevis_demo_Based生物信息学工作流管理数据

2026年1月30日 30 197 143

数据集概述本数据集是suecharo/yevis-demo项目中的一个工作流数据集，包含6个文件，涵盖配置文件、数据文件、文档文件等类型。主要用于支持Yevis工作流注册库的构建与维护，涉及元数据模板生成、验证、测试执行等功能相关的数据内容。文件详解配置与元数据文件文件名称：yevis-metadata-1.0.0.yml 文件格式：YML...

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Jackson_ME_大黄蜂遗传多样性与分化驱动因素研究存档数据

2026年1月28日 30 174 14

数据集概述本数据集为大黄蜂遗传多样性与分化驱动因素研究的存档数据，包含两种大黄蜂（Bombus vosnesenskii和Bombus bifarius）的RADseq测序分析相关文件，涉及美国加州、俄勒冈州和华盛顿州山脉不同纬度和海拔的种群连通性、遗传多样性模式研究，共2个文件。文件详解 README_for_data_uploads.txt...

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示例数据集_哥伦巴1000基因组计划人类染色体19单倍型测试数据集

2026年1月27日 30 21 14

数据集概述本数据集为测试用基因组数据，包含来自1000 Genomes Project的人类个体HG00096和HG00097的19号染色体两个单倍型参考序列文件，以及从SRR17981962测序数据中采样得到的10万条双端测序读数文件，所有数据打包为一个压缩文件。文件详解压缩包文件文件名称：test_data.zip 文件格式：ZIP...

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suecharo_yevis_demo_Based_工作流文件数据集

2026年1月23日 30 35 32

数据集概述本数据集是suecharo/yevis-demo中的一个工作流文件集合，包含8个文件，涵盖配置文件、压缩数据文件、文档文件等5种类型，主要用于生物信息学分析流程的定义与执行，无目录层级结构。文件详解配置与元数据文件文件名称：yevis-metadata-1.0.0.yml 文件格式：YML 字段映射介绍：工作流元数据配置文件...

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GTN_Training_Galaxy平台ENA数据上传教程训练数据

2026年1月23日 30 55 48

数据集概述本数据集是Zenodo.3732359数据的子集，用于Galaxy培训网络（GTN）的“Upload data to ENA”教程。已按指定流程移除人类序列痕迹，包含基于Illumina PE数据生成的SARS-CoV-2共识序列及相关原始数据，共8个文件。文件详解数据文件...

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Drosophila_Based铅暴露下两种果蝇微生物群多样性影响研究数据

2026年1月21日 30 85 71

数据集概述本数据集记录了铅暴露环境下，两种果蝇（黑腹果蝇和拟暗果蝇）微生物群多样性的研究数据。通过16S rRNA基因V3-V4区域测序，分析了不同种群来源和重金属暴露对幼虫及成虫微生物群组成的影响，包含四个补充表格文件。文件详解文件名称：Supplementary Table S1_Number of sequences before and...

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BMock12_Community_Standards_LMAS测试数据集

2026年1月21日 30 122 116

数据集概述本数据集以BMock12群落标准的12个细菌复制子为参考，包含12种菌株的物种名称、样本ID及覆盖深度信息。原始测序数据源自SRR8073716，经降采样处理保留原样本20%的读数，主要挑战为组装ANIb相似度较高的菌株基因组。数据集包含2个文件。文件详解文件名称：README.md 文件格式：MD...

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基因组资源笔记_已录用_双翅目幼虫肠道微生物组与食物来源测序数据_2015年

2026年1月20日 30 8 6

数据集概述本数据集包含454扩增子测序获得的双翅目幼虫（Dilophus febrilis）肠道微生物组及其潜在食物来源（矮灌木凋落物、草凋落物、牛粪）的宏基因组序列数据，相关研究于2015年6月1日至7月31日被Genomic Resources Notes接收，数据集仅含一个压缩文件。文件详解文件名称：Filtered_data.zip...

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DoTA_seq_Processed_测序read与barcode映射表数据集

2026年1月20日 30 135 25

数据集概述本数据集为DoTA-seq测序reads处理后生成的barcode与read映射表数据，包含3个文件，可用于生成相关研究的1-3号图表。数据无训练/测试、数据/标签、原始/处理拆分，主要文件类型为xlsx和csv，覆盖bfragilis、gutcommunity、colibs三类样本数据。文件详解 bfragilis-data.csv...

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BMC_Genomics_Source_虎纹钝口螈SNP频率估算与转录本多态性研究数据

2026年1月14日 30 92 20

数据集概述本数据集支持BMC Genomics发表的虎纹钝口螈SNP频率研究论文，包含454焦磷酸测序原始数据及组装contig序列，用于分析contig长度和测序深度对SNP频率估算的影响，以及编码与非编码转录本的SNP丰度差异，验证长非编码转录本保守性较低的假设。文件详解 README文件...

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MycoKeys_补充材料1_山毛榉叶内生真菌测序数据生物信息学分析补充材料_2017

2026年1月14日 30 17 16

数据集概述本数据集为论文的补充材料1，核心内容是生物信息学分析流程文档，提供山毛榉叶内生真菌高通量测序原始双端fastq序列的质量过滤与解复用所需的全部步骤及命令，用于支持内生真菌群落组成研究。文件详解文件名称：oo_123365.zip 文件格式：ZIP...

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Nature_Ecology_Evolution_碳水化合物复杂性对肠道菌群稳定性影响研究数据

2026年1月12日 30 137 78

数据集概述本数据集为2022年发表于《Nature Ecology and Evolution》的研究配套数据，围绕碳水化合物复杂性对合成人类肠道菌群生长及扰动敏感性的影响展开。包含基因测序处理代码、分类学文件、数据库文件及图表数据，共13个文件，支持肠道微生物生态系统的相关分析。文件详解代码文件（.py格式，共7个）...

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BAM_Files_Human_RNA_seq_WES_Visualization_Practice_Data

2025年12月28日 30 91 48

数据集概述本数据集包含两组人类小BAM文件，分别用于RNA-seq和全外显子测序（WES）可视化教学练习。RNA-seq数据来自上皮间质转化细胞系的0天（未诱导）和7天（诱导后）样本，WES数据来自非小细胞肺癌患者的肿瘤和血液组织样本，所有数据均从开放获取的SRA数据集处理而来。文件详解 RNA-EMT.zip 文件格式：ZIP...

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EAW_2018_FASTQ_18S核糖体RNA基因生物信息学课程数据集

2025年12月19日 30 94 81

数据集概述本数据集包含2018年9月在意大利加尔达湖不同区域及深度采集的6个样本的18S核糖体RNA基因测序数据，采用Illumina MiSeq技术生成，含正向（R1）和反向（R2）测序文件，以及相关描述文档和元数据，用于生物信息学课程教学与分析实践。文件详解描述文档：...

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基于PRIMAD模型和BioCompute_Object的高通量测序案例研究RO_Crate数据集

2025年12月12日 30 145 84

数据集概述该数据集是基于PRIMAD模型和BioCompute Object（BCO）的高通量测序案例研究RO-Crate，包含研究方法、数据文件及可视化图表等结构化内容，用于评估BCO框架的可重复性，为生物信息学分析的可靠性研究提供支持。文件详解 ro-crate-metadata.json：JSON格式，RO-...

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大肠杆菌K_12_MG1655的Albacore与Flappie序列召回对比数据集

2025年12月12日 30 10 2

数据集概述本数据集基于大肠杆菌K-12 MG1655的超长读长测序数据，对比Albacore和Flappie两种工具的序列召回结果，包含原始测序数据处理后的序列文件、比对结果及可视化脚本。文件详解文件名称: aligned_all_ddea.fa，文件格式: FA (.fa)，为序列比对结果文件，包含核苷酸序列比对信息文件名称:...