数据集概述
本数据集包含2018年9月在意大利加尔达湖不同区域及深度采集的6个样本的18S核糖体RNA基因测序数据，采用Illumina MiSeq技术生成，含正向（R1）和反向（R2）测序文件，以及相关描述文档和元数据，用于生物信息学课程教学与分析实践。
文件详解
- 描述文档：
- EAW_2018_FASTQ_18S_description.pdf：PDF格式，提供数据集的背景信息、采样过程及分析说明
- 元数据文件：
- EAW_2018_18S_metadata.ods：ODS格式，可能包含样本的采样位置、深度、处理方法等元数据信息
- 测序数据文件（共12个.gz压缩文件）：
- 正向测序文件（R1）：如ECOALPSWATER-18S-Porto0918stv_S144_L001_R1_001.fastq.gz，包含约300bp的正向测序读段
- 反向测序文件（R2）：如ECOALPSWATER-18S-386-09-18-4stv_S146_L001_R2_001.fastq.gz，包含约300bp的反向测序读段
- 命名规则：包含样本ID、测序通道、读段方向等信息，所有文件均来自同一批eDNA提取物
数据来源
Eco-AlpsWater项目（ASP569），由Interreg Alpine Space计划资助；测序由FEM设施测序平台完成
适用场景
- 生物信息学教学：用于演示18S rRNA基因序列的质控、拼接及分类学注释流程
- 环境微生物多样性分析：研究淡水环境中真核微生物群落结构与分布
- 测序数据处理方法验证：测试DADA2等生物信息学工具在扩增子数据分析中的应用效果
- 教学案例开发：构建针对湖沼生态系统微生物研究的实践教学案例
