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苏塞克斯大学果蝇基因型重现性测试数据
2026年2月15日 30 136 28
数据集概述 本数据集包含在Sussex LHM黑腹果蝇种群样本中，使用三对半克隆个体进行基因型可重复性测试的代码、日志及结果摘要。通过GATK HaplotypeCaller和Genomestrip完成基因组序列变异的发现与基因分型，利用GATK GenotypeConcordance进行每对半克隆个体间基因型调用的数值比较，共包含2个压缩文件。...
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GBS_Based_针叶树群体基因组分析策略优化数据
2026年1月31日 30 163 99
数据集概述 本数据集为针叶树群体基因组分析中基因分型测序（GBS）策略优化研究的数据，包含GBS实验设计、数据处理流程及分析结果，涉及限制性内切酶选择、测序深度、片段大小筛选等参数优化，以及UNEAK、Stacks、GATK等分析流程测试，为缺乏参考基因组的物种提供无参考SNP calling策略指导。 文件详解 参考序列文件 文件名称：9pt-...
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Wheat_EMS_Based小麦增强抗病性突变体研究数据
2026年1月29日 30 103 46
数据集概述 本数据集为小麦EMS突变体抗病性研究相关数据，包含通过GATK和QTL-seq技术生成的分析文件，用于研究小麦增强抗病性EMS突变体（含模拟病斑突变体）对条锈病的成株抗性，共包含2个压缩文件。 文件详解 Kr620_GATK.zip 文件格式：ZIP...
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Felidae_Based_富集条件对猫科动物DNA捕获影响研究数据
2026年1月27日 30 168 54
数据集概述 本数据集围绕富集条件对猫科动物线粒体DNA捕获效果的影响展开，通过杂交捕获技术结合高通量测序，评估不同杂交温度对新鲜、档案及古代样本捕获成功率的作用，为优化非模式物种及降解样本的DNA捕获方案提供数据支持。 文件详解 Tree-files.zip 文件格式：ZIP 内容说明：包含与实验相关的树文件压缩包 LSE-...
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MPB_Dendroctonus_ponderosae_山松大小蠹生殖隔离与环境适应系统地理学研究数据
2026年1月1日 30 75 14
数据集概述 本数据集基于北美西部山松大小蠹全分布区的RAD测序数据，分析Y染色体单倍型与常染色体、X连锁位点的系统地理差异，揭示生殖隔离、环境适应对种群分化的作用，以及更新世冰期避难所与冰后期扩张的历史。数据含4个文件，支持种群遗传结构与环境适应性研究。 文件详解 集合信息文件 文件名称：S2CollectionInformation.xlsx...
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女性与雌性犬乳腺癌液体活检诊断预后工具数据集
2025年12月19日 30 70 57
数据集概述 该数据集包含对女性与雌性犬乳腺癌液体活检中获得的基因变异的多项分析。研究收集了女性和雌性犬的核心活检及血浆样本，通过下一代测序（NGS）处理并提交至Genome Analysis ToolKit（GATK），旨在探究液体活检在乳腺癌诊断与随访中的有效性。 文件详解 数据文件： Table S2 Genetic variants...
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基因组变异检测工具在系统基因组学应用的补充信息
2025年12月19日 30 10 1
数据集概述 本数据集为关于基因组变异检测工具（基因型识别器）在系统基因组学应用的研究补充信息，通过模拟对比GATK与ATLAS两种工具在不同系统发育尺度下的表现差异，量化其变异检测准确性与参考基因组距离的关系。 文件详解 文件名称: Duchen_USBY_2020_149_SupplementaryInformation.pdf 文件格式: PDF...
