数据集概述
本数据集围绕富集条件对猫科动物线粒体DNA捕获效果的影响展开，通过杂交捕获技术结合高通量测序，评估不同杂交温度对新鲜、档案及古代样本捕获成功率的作用，为优化非模式物种及降解样本的DNA捕获方案提供数据支持。
文件详解
- Tree-files.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含与实验相关的树文件压缩包
- LSE-NNE_incomplete-mitogenomes.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含LSE-NNE不完整线粒体基因组数据的压缩包
- filter_multiple_sample_gatk1.5_vcf_mtDNA_indels.pl
- 文件格式：PL
- 内容说明：用于过滤多样本GATK1.5生成的线粒体DNA插入缺失VCF文件的脚本
- convert_callsfile_to_one_line_fasta.pl
- 文件格式：PL
- 内容说明：用于将调用文件转换为单行FASTA格式的脚本
- felids_ancestral_29.11.2013.fasta
- 文件格式：FASTA
- 内容说明：2013年11月29日生成的猫科动物祖先序列文件
适用场景
- 分子生物学实验优化：分析杂交温度对不同质量样本（新鲜、降解）线粒体DNA捕获效率的影响，优化实验条件
- 非模式物种基因组研究：支持缺乏先验序列信息的非模式物种DNA捕获方案设计
- 古DNA研究：探索富集条件对古代降解样本DNA捕获成功率的作用机制
- 生物信息学分析：利用脚本工具进行线粒体DNA数据的过滤与格式转换，辅助后续序列分析
