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标签: 非模式物种

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  • 南极毛皮海狮皮肤转录组基因发现与标记数据

    2026年2月9日 30 199 153

    数据集概述 本数据集基于12只南极毛皮海狮皮肤活检样本的标准化cDNA文库,通过454测序生成超412Mb序列数据,包含156个contigs、22869个isotigs及18576个isogroups。数据覆盖多种功能基因,多数可映射至犬类基因组,支持海洋哺乳动物基因组资源开发,用于解决鳍足类生态与进化问题。 文件详解 Sequence...
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  • GRM_Based_蓝山雀野生种群遗传力估计研究数据

    2026年1月31日 30 53 29

    数据集概述 本数据集包含科西嘉岛野生蓝山雀种群的遗传力研究数据,基于约50,000个过滤后的RAD-seq SNPs,对494个样本的跗骨长度、翼长、喙长和体重4个数量性状,分别通过社会系谱(PED-social)、遗传校正系谱(PED-...
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  • Agabus_潜水甲虫物种复合体蛋白质表达与热耐受性研究数据

    2026年1月29日 30 54 17

    数据集概述 本数据集聚焦西地中海潜水甲虫物种复合体(Agabus ramblae和Agabus brunneus),研究其蛋白质表达与热耐受性、生态变化及物种分化的关联。包含蛋白质表达差异分析数据及参考EST文库相关文件,助力理解非模式物种进化与生态过程中的生理变化机制。 文件详解...
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  • Felidae_Based_富集条件对猫科动物DNA捕获影响研究数据

    2026年1月27日 30 157 138

    数据集概述 本数据集围绕富集条件对猫科动物线粒体DNA捕获效果的影响展开,通过杂交捕获技术结合高通量测序,评估不同杂交温度对新鲜、档案及古代样本捕获成功率的作用,为优化非模式物种及降解样本的DNA捕获方案提供数据支持。 文件详解 Tree-files.zip 文件格式:ZIP 内容说明:包含与实验相关的树文件压缩包 LSE-...
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  • Whole_genome_Based_保护生物学全基因组测序方法分析数据

    2026年1月22日 30 92 10

    数据集概述 本数据集围绕保护生物学领域的全基因组测序方法展开,涵盖高深度单倍型解析/未解析测序、群体混合池测序、低深度群体测序四种技术,分析其在非模式物种中的应用优势、局限及优化建议,为保护遗传学研究提供方法参考。 文件详解 文件名称:data_Genbank_june2017.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • PolarBear_SNP_Based北极熊9K_SNP芯片设计原始数据

    2026年1月22日 30 30 9

    数据集概述 本数据集记录了为北极熊(Ursus maritimus)设计的9K Illumina Infinium BeadChip芯片数据,通过RAD测序和转录组测序技术筛选6000个RAD SNPs与3000个转录组SNPs构建芯片,用于研究加拿大北极熊种群精细结构及哈德逊湾西部亚种群表型性状的基因组结构。 文件详解 文件名称:DRYAD.zip...
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  • Mojave_Desert_Based_本地植物恢复适应性遗传差异研究数据

    2026年1月21日 30 57 3

    数据集概述 本数据集为莫哈韦沙漠两种重要恢复植物(Ephedra nevadensis和Sphaeralcea ambigua)的景观遗传学研究数据,包含AFLP标记基因型数据及补充文件,用于分析适应性遗传分化的环境驱动因素,支持生态恢复中的种子来源策略制定。 文件详解 DataS1.zip 文件格式:ZIP...
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  • Heredity_Based_非模式物种连锁不平衡Ne估计模拟数据_2016

    2026年1月20日 30 198 157

    数据集概述 本数据集包含论文《Estimating contemporary effective population size in non-model species using linkage disequilibrium across thousands of...
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  • Microbotryum_Source_非模式病原体宿主专业化正选择候选基因数据

    2026年1月15日 30 209 12

    数据集概述 本数据集聚焦非模式物种中受正选择的候选基因研究,以导致石竹科植物花药黑粉病的4种Microbotryum真菌病原体为对象,通过转录组测序识别宿主专业化相关的快速进化基因,包含4个EST序列压缩文件,为病原体-宿主协同进化及功能基因研究提供基础数据。 文件详解 Mviol_Svulgaris_EST.fasta.zip...
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  • SNP_Community_Genetics_多物种SNP标记开发成本效益分析数据

    2026年1月15日 30 83 24

    数据集概述 本数据集围绕多物种SNP标记开发的成本效益分析展开,记录了通过RAD-Seq技术结合Python管道为40种非模式物种(含植物、无脊椎动物、鱼类、哺乳动物)开发SNP标记的过程,以及18种法属圭亚那鱼类SNP标记的验证结果,包含6个相关文件。 文件详解...
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  • 莱西乌鲁斯_Lasiurus_分子生态学资源_2013年蝙蝠基因组微卫星标记开发数据集

    2026年1月14日 30 198 126

    数据集概述 本数据集为针对受风力涡轮机致死影响的两种非模式蝙蝠(红蝙蝠Lasiurus borealis和灰蝙蝠L. cinereus)开发的全基因组微卫星标记数据,包含测序分析得到的微卫星位点、引物序列及相关实验验证结果,支持蝙蝠种群遗传多样性与结构研究。 文件详解 说明文件(README)...
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  • 极危物种_欧亚鲟_Acipenser_stellatus_的转录组资源数据_2015年

    2026年1月14日 30 68 32

    数据集概述 本数据集为极危物种星状鲟(Acipenser stellatus)的转录组资源数据,包含组装序列、变异数据、功能注释及分析代码等5个文件,支持该非模式物种的分子生物学与保护遗传学研究,无目录结构,文件类型涵盖压缩包与Python脚本。 文件详解...
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  • transcriptomes_light_response_中国亚热带森林幼苗死亡率研究数据

    2026年1月12日 30 122 55

    数据集概述 本数据集聚焦中国亚热带森林中幼苗死亡率与光环境响应转录组的关系,包含相关研究的原始数据与说明文档。通过分析物种转录组相似性对幼苗生存的影响,探索基因功能如何作用于物种共存及群落动态,为森林生态学研究提供基础数据支持。 文件详解 README_for_Hanetal.2017.JEcol.txt 文件格式:TXT...
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  • Zulliger_etal_MolEcol2013_Based_高山十字花科物种适应性基因座研究数据

    2026年1月5日 30 89 18

    数据集概述 本数据集围绕高山十字花科物种适应性基因座的跨物种可转移性展开研究,通过AFLP标记基因组扫描、异常值与环境关联分析,识别潜在适应性位点,并对候选位点Cre_P1_212.5进行测序和SNP基因分型,探究其在不同物种中的环境关联,为高山植物适应机制研究提供数据支持。 文件详解...
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  • Transcriptome_Resources_Based地中海淡水甲壳类转录组研究补充数据2014

    2026年1月5日 30 35 25

    数据集概述 本数据集是研究地中海两种常见淡水甲壳类(剑水蚤Eucyclops serrulatus和钩虾Echinogammarus veneris)全转录组的补充资料,旨在为缺乏基因组信息的物种提供环境胁迫响应研究的基因资源,助力识别适应污染环境的关键基因,支持后续表达谱分析。 文件详解 文件名称:AppendixS1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • seminal_proteins_Identification_蟋蟀雌性求偶抑制相关精浆蛋白鉴定数据

    2026年1月4日 30 70 68

    数据集概述 本数据集围绕雄性蟋蟀精浆蛋白对雌性求偶行为的抑制作用展开,通过实验验证澳大利亚田蟋蟀Teleogryllus oceanicus交配后雌性求偶行为的变化规律,进而鉴定出ToSfp022和ToSfp011两种与该行为相关的精浆蛋白,为研究非模式物种的精浆蛋白功能提供基础数据。 文件详解 文件名称:Dataset.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Next_Gen_phylogeography_rainforest_trees_叶绿体基因组变异研究数据

    2025年12月30日 30 164 53

    数据集概述 本数据集为雨林树木叶绿体基因组变异研究数据,通过下一代测序技术分析12种非模式雨林树木的叶绿体全基因组变异,涉及南北两个进化区域。数据包含叶绿体参考序列及核rDNA标记信息,可用于识别生物地理屏障、分析遗传多样性分布及进化历史。 文件详解...
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  • Development_validation_high_throughput_非模式物种序列标记设计与分析数据

    2025年12月28日 30 77 10

    数据集概述 本数据集围绕非模式物种序列标记的开发、验证及高通量分析展开,提供了适用于无参考基因组物种的遗传标记设计框架相关数据,包含标记序列、基因型数据、生物信息学脚本及参考序列等,可支持群体遗传学、系统发育学研究中标记的应用与分析。 文件详解 VCF_files.tar 文件格式:TAR(压缩包)...
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  • 美洲黑松适应性性状全基因组关联遗传学数据集

    2025年12月15日 30 143 104

    数据集概述 该数据集围绕美洲黑松球果闭鳞性这一关键适应性性状展开全基因组关联遗传学研究,包含通过限制性酶切与PCR扩增法生成的群体基因组数据,涉及98株样本的95000余个单核苷酸多态性位点,为解析该性状的遗传结构提供支持。 文件详解 REFpine27apr11-0.bam:BAM格式文件,可能为测序比对后的基因组数据文件...
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  • 锚定杂交富集高通量系统发育基因组学数据集

    2025年12月8日 30 102 43

    数据集概述 本数据集围绕锚定杂交富集技术展开,该技术通过脊椎动物基因组保守锚定区域设计探针,在非模式物种中高效获取大量基因位点,可应用于不同时间尺度的系统发育研究,具备低成本、快速数据收集的特点。 文件详解 说明文档文件: README_for_Lemmon-etal2012_Scripts.txt:TXT格式,可能说明脚本相关信息...
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