数据集概述
本数据集聚焦非模式物种中受正选择的候选基因研究,以导致石竹科植物花药黑粉病的4种Microbotryum真菌病原体为对象,通过转录组测序识别宿主专业化相关的快速进化基因,包含4个EST序列压缩文件,为病原体-宿主协同进化及功能基因研究提供基础数据。
文件详解
- Mviol_Svulgaris_EST.fasta.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含感染Silene vulgaris宿主的Microbotryum violaceum物种的EST(表达序列标签)序列数据,格式为FASTA
- Mviol_Slatifolia_EST.fasta.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含感染Silene latifolia宿主的Microbotryum violaceum物种的EST序列数据,格式为FASTA
- Mviol_Snutans_EST.fasta.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含感染Silene nutans宿主的Microbotryum violaceum物种的EST序列数据,格式为FASTA
- Mviol_Dcarthusianorum_EST.fasta.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含感染Dianthus carthusianorum宿主的Microbotryum violaceum物种的EST序列数据,格式为FASTA
适用场景
- 病原体宿主专业化机制研究:分析不同宿主特异性Microbotryum物种的基因进化差异,识别宿主适应相关基因
- 正选择基因功能验证:基于候选基因列表开展后续分子实验,验证其在宿主-病原体互作中的作用
- 非模式物种进化分析方法优化:参考本研究的EST测序与正选择检测策略,应用于其他非模式生物的进化研究
- 植物病害防控靶点筛选:挖掘病原体关键致病基因,为石竹科植物花药黑粉病的疫苗或药物研发提供候选靶点
- 基因家族进化分析:结合跨物种序列数据,研究营养吸收、次生代谢等功能基因家族的进化动态