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标签: 基因家族进化

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  • GSK3_植物基因家族系统发育与进化历史研究数据

    2026年2月9日 30 101 45

    数据集概述 本数据集围绕陆地植物GSK3/SHAGGY样激酶基因家族展开,包含系统发育分析所需的基因序列矩阵、进化树文件及基因表达数据。通过对关键类群(基础被子植物、裸子植物等)的基因分析,揭示该家族的复制事件与功能分化,为理解植物形态复杂度提升与基因家族进化的关联提供支持。 文件详解 文件名称:GSK3 phylogenetic tree.nex...
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  • Timema_project_孤雌生殖进化分析中间数据

    2026年1月31日 30 198 171

    数据集概述 本数据集包含Timema竹节虫孤雌生殖进化分析过程中产生的关键中间文件,涵盖基因序列、进化树、直系同源群压缩包及格式化文本等类型,共七个文件,用于支持昆虫孤雌生殖进化机制的研究。 文件详解 基因序列文件(.fasta格式) 文件名称:trimmed_onesp_COIseqs_def.fasta、all_COIseqs.fasta...
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  • Tas2r_Genbank_两栖动物基因基因组位置数据

    2026年1月30日 30 46 13

    数据集概述 本数据集记录两栖动物Tas2r基因的基因组位置或GenBank登录号,包含基因在支架或染色体上的定位信息,是两栖动物味觉受体基因研究的基础数据资源,仅包含一个文档文件。 文件详解 文件名称:The genomic location or Genbank accession of Tas2r genes in amphibians.docx...
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  • BURP_Based_植物特异性蛋白家族分化与正选择研究数据

    2026年1月29日 30 207 93

    数据集概述 本数据集源自植物特异性BURP结构域蛋白家族的分化与正选择研究,包含15种植物基因组中鉴定的125个BURP蛋白编码基因相关信息,涉及4个主要植物谱系的13个高等植物物种。数据覆盖基因起源、分化模式、进化速率及功能分析,揭示该家族在植物适应陆地环境中的关键作用,文件总数为1个。 文件详解 文件名称:Figures, Tables, and...
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  • GeneSeqToFamily_Based基因家族进化分析数据

    2026年1月28日 30 147 9

    数据集概述 本数据集为GeneSeqToFamily项目相关的基因JSON数据压缩包,聚焦基因家族进化研究,涉及基因复制、家族收缩/扩张与生物适应的关联,以及同源基因分析、基因结构变化(如外显子边界保守性)等内容,支持基因家族进化机制的探索。 文件详解 文件名称:gene.json.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • ADF_CFL_Based基因家族密码子进化系统发育模式研究数据

    2026年1月28日 30 94 50

    数据集概述 本数据集围绕肌动蛋白解聚因子/丝切蛋白(ADF/CFL)基因家族的密码子进化系统发育模式展开,包含动植物谱系中该基因家族的序列、系统发育树、模型拟合结果及图表相关文件,用于研究基因家族多样化的进化动力,共12个文件。 文件详解 说明文档(README)...
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  • Drosophila_Sdic_Based基因家族早期进化研究数据

    2026年1月27日 30 55 31

    数据集概述 本数据集围绕黑腹果蝇特有串联重复基因家族Sdic展开,包含其在20个地理种群中的结构与功能进化研究数据。通过基因组组装、读深分析及qPCR等方法,探究该基因家族的拷贝数变异、转座元件插入、基因转换及选择压力等特征,为理解串联重复基因家族的早期进化路径提供支持。 文件详解 文件名称:Dataset_1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • FT_Homologs_Based_甜菜开花时间调控分子机制研究数据

    2026年1月27日 30 186 162

    数据集概述 本数据集围绕甜菜开花时间调控机制展开,核心内容为甜菜中两个FLOWERING LOCUS T(FT)同源基因(BvFT1和BvFT2)的功能分析数据。BvFT2与拟南芥FT功能保守,是开花必需基因;BvFT1受春化作用下调,具有抑制开花的拮抗功能,为甜菜开花调控的独特机制提供数据支持。 文件详解 小型PEBP分析文件 文件名称:small...
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  • Cerapachys_biroi_Based克隆掠夺者蚂蚁基因组研究数据

    2026年1月22日 30 44 6

    数据集概述 本数据集为无 queen 克隆掠夺者蚂蚁 Cerapachys biroi 的基因组相关数据,该蚂蚁是研究昆虫社会分工分子调控的重要模型。数据集包含基因序列、进化树及基因列表等文件,支持对其繁殖方式、社会行为相关基因的分析,共5个文件。 文件详解 进化树文件(.tre) 文件名称:CYPs_573.tre、UGTs_321.tre...
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  • paleoMIXTA_based_植物MIXTA基因家族进化功能研究数据集

    2026年1月21日 30 202 194

    数据集概述 本数据集围绕真双子叶植物MIXTA基因家族祖先(paleoMIXTA)的进化历史与功能展开,包含23种唐松草属植物paleoMIXTA直系同源基因的克隆与系统发育分析、表达模式检测、功能验证及转录组分析结果,支持研究其在锥状细胞和毛状体发育中的联合作用。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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  • Platyplectrum_Dryad_Files_蛙类基因组转录组研究数据_压缩包

    2026年1月18日 30 74 46

    数据集概述 本数据集包含澳大利亚装饰穴居蛙(Platyplectrum ornatum)的基因组和转录组数据,其基因组大小约1.06 Gb,是目前已知蛙类中最小的基因组之一。数据用于研究基因组大小缩减的分子机制,包括转座元件(TEs)动态、内含子长度变化、Piwi基因家族扩张及piRNA通路表达等,并通过比较近缘物种验证TE减少对基因组缩减的驱动作用。...
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  • Microbotryum_Source_非模式病原体宿主专业化正选择候选基因数据

    2026年1月15日 30 55 53

    数据集概述 本数据集聚焦非模式物种中受正选择的候选基因研究,以导致石竹科植物花药黑粉病的4种Microbotryum真菌病原体为对象,通过转录组测序识别宿主专业化相关的快速进化基因,包含4个EST序列压缩文件,为病原体-宿主协同进化及功能基因研究提供基础数据。 文件详解 Mviol_Svulgaris_EST.fasta.zip...
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  • Ceratodon_purpureus_De_novo_转录组组装与比较分析数据

    2026年1月15日 30 18 4

    数据集概述 本数据集包含紫萼藓(Ceratodon purpureus)雌雄分离株的转录组从头组装与比较分析数据,使用454 FLX技术生成。通过与小立碗藓(Physcomitrella patens)的比较分析,覆盖了原丝体转录组,为研究苔藓植物基因家族进化、生理发育分化及密码子使用偏好提供资源,共含12个文件。 文件详解 预测序列文件...
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  • OGRDB开放的种系受体数据库_小鼠BALB_c_ByJ品系IGKV基因胚系参考数据集

    2026年1月14日 30 44 1

    数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠BALB/c/ByJ品系免疫球蛋白κ轻链可变区(IGKV)基因胚系参考集,包含基因序列及相关元数据,为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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  • Neodiprion_lecontei_Based松食叶蜂环境响应基因家族进化研究数据集

    2026年1月13日 30 36 26

    数据集概述 本数据集为松食叶蜂(Neodiprion lecontei)环境响应基因家族进化研究的配套数据,包含手动注释的基因序列、多物种比对文件及附录表格,覆盖嗅觉受体、味觉受体、细胞色素P450等5类基因家族,支持基因进化规律及适应性遗传变化的分析验证。 文件详解 说明文档 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • Compositae_Phylogenomics_Based_菊科系统发育基因组学研究数据集

    2026年1月12日 30 8 3

    数据集概述 本数据集为菊科系统发育基因组学研究成果,包含23个菊科物种及1个近缘科物种的测序数据。通过靶向捕获低拷贝序列与Illumina测序,生成795个核基因位点数据及叶绿体基因组数据,采用保守单拷贝基因与多拷贝基因聚类两种方法构建系统发育关系,为解析大型植物科的复杂亲缘关系提供方法框架与数据支撑。 文件详解 系统发育树文件...
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  • ABC_Transporter_Genome_wide_Analysis_七鳃鳗基因家族进化研究数据

    2026年1月5日 30 118 55

    数据集概述 本数据集围绕七鳃鳗(海七鳃鳗和日本七鳃鳗)的ABC转运蛋白基因家族展开全基因组分析,识别出37个ABC转运蛋白基因并分为7个亚家族,探讨其在脊椎动物中的早期进化事件,包括基因的扩张、收缩及保守性特征,为理解脊椎动物基因家族进化提供关键信息。 文件详解 文件名称:Phytree-original-data.zip 文件格式:ZIP...
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  • 系统发育树文件_Newick格式

    2025年12月19日 30 179 163

    数据集概述 本数据集包含以Newick格式存储的系统发育树文件,核心围绕生物学基因相关的进化关系分析,通过压缩包形式提供,便于获取和使用。 文件详解 文件名称: phylogenetic_tree_files.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip) 内容说明:...
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  • 多基因座多物种溯祖模型与基因家族进化数据集

    2025年12月15日 30 111 52

    数据集概述 该数据集围绕“多基因座多物种溯祖”(MLMSC)模型展开,该模型是一种用于分析基因家族进化的新模型,整合了不完全谱系分选(ILS)与基因复制、转移、丢失(DTL)的相互作用,为基因树与物种树的模拟和推断提供框架。 文件详解 数据文件: 文件名称:hemiplasy_data.xlsx 文件格式:Excel(.xlsx)...
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  • 脊椎动物烟碱型乙酰胆碱受体进化数据集

    2025年12月4日 30 85 43

    数据集概述 该数据集聚焦脊椎动物烟碱型乙酰胆碱受体(nAChR)的进化研究,通过序列系统发育、染色体同线性及内含子位置分析,揭示其基因家族从脊椎动物祖先到现生类群的扩张与丢失过程,为理解该受体家族复杂性的起源提供数据支持。 文件详解 系统发育树文件: Maximum likelihood tree nAChR gene...
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