数据集概述
本数据集包含澳大利亚装饰穴居蛙(Platyplectrum ornatum)的基因组和转录组数据,其基因组大小约1.06 Gb,是目前已知蛙类中最小的基因组之一。数据用于研究基因组大小缩减的分子机制,包括转座元件(TEs)动态、内含子长度变化、Piwi基因家族扩张及piRNA通路表达等,并通过比较近缘物种验证TE减少对基因组缩减的驱动作用。
文件详解
- 文件名称:
Platyplectrum_Dryad_files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含Platyplectrum ornatum的基因组和转录组数据,具体内容未提供预览,推测涵盖基因组序列、转录组测序数据、基因注释信息及相关分析结果文件,支持研究TE动态、基因家族进化及性别分化通路等主题。
数据来源
Dryad数据平台(文件名称:Platyplectrum_Dryad_files.zip)
适用场景
- 基因组大小进化机制研究: 分析转座元件丰度、删除偏向性及Piwi基因家族扩张对基因组缩减的驱动作用。
- 脊椎动物比较基因组学: 对比蛙类与其他脊椎动物基因组,探究基因组大小变化的分子约束因素。
- 转座元件动态分析: 研究TEs在小基因组物种中的调控机制及piRNA通路的作用。
- 两栖动物性别分化通路研究: 利用多组织转录组数据解析Platyplectrum的性别差异表达基因及分化机制。
- 宏观进化模式验证: 通过近缘物种基因组扫描,验证生活史(如蝌蚪发育速度、食性)对基因组大小的收敛性影响。