数据集概述
本数据集为松食叶蜂（Neodiprion lecontei）环境响应基因家族进化研究的配套数据，包含手动注释的基因序列、多物种比对文件及附录表格，覆盖嗅觉受体、味觉受体、细胞色素P450等5类基因家族，支持基因进化规律及适应性遗传变化的分析验证。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：数据集说明文档，介绍数据内容、文件类型及对应基因家族信息。
- 基因序列文件
- 文件名称：Nlec_manual_gene_annotation_sequences.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含松食叶蜂手动注释的基因序列（氨基酸及cDNA序列）。
- 多物种比对文件（共5个.fasta文件）
- 文件名称：OR_intact_350AAmin_AmArCcDmHsNlNv_mafftLinsi.fasta
- 对应基因家族：嗅觉受体（OR）
- 文件名称：GR_intact_350AAmin_AmArCcDmHsNlNv_mafftLinsi.fasta
- 对应基因家族：味觉受体（GR）
- 文件名称：OBP_intact_100AAmin_AmCcDmHsNlNv_mafftLinsi.fasta
- 对应基因家族：气味结合蛋白（OBP）
- 文件名称：CYP450_intact_350AAmin_AmDmPbNlNv_mafftGinsi.fasta
- 对应基因家族：细胞色素P450（CYP450）
- 文件名称：HisnavicinFullAlignment_AmDmHsNlNv.fasta
- 对应基因家族：抗菌肽相关（Hisnavicin）
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含松食叶蜂及其他物种（如蜜蜂、果蝇等）的基因序列比对结果，序列长度≥100/350氨基酸。
- 附录表格文件
- 文件名称：AppendixB_tables.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：研究附录B的表格数据，补充基因家族进化分析的相关信息。
数据来源
论文“Evolution of five environmentally responsive gene families in a pine-feeding sawfly, Neodiprion lecontei (Hymenoptera: Diprionidae)”
适用场景
- 昆虫基因家族进化研究：分析松食叶蜂环境响应基因家族的扩张、收缩及选择压力。
- 比较基因组学分析：通过多物种序列比对，探究基因家族的保守性与特异性。
- 适应性进化机制研究：验证环境响应基因对松食叶蜂宿主专一性（松树取食）的适应性作用。
- 基因功能注释参考：为昆虫环境响应基因（嗅觉、解毒、免疫相关）的功能注释提供序列数据支持。
