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微生物_GraftM_塑料降解酶及HMM模型数据
2026年2月9日 30 164 74
数据集概述 本数据集围绕全球生态系统中微生物谱系的塑料生物降解潜力展开，包含种子酶及隐马尔可夫模型（HMMs）相关信息、种子酶氨基酸序列，以及GraftM生成的HMM包，为研究塑料降解微生物及酶的分布和功能提供基础数据。 文件详解 1_Enzymes and HMMs summary.xlsx 文件格式：XLSX...
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基于进化信息数据的蛋白质界面残基相互作用预测
2026年2月1日 30 208 87
数据集概述 本数据集围绕蛋白质界面残基相互作用预测展开，基于进化信息分析氨基酸序列协变性，验证其在已知结构蛋白质复合物中的接触预测效果，并对未知结构复合物进行预测建模。包含8个文件，涵盖蛋白质结构文件与序列比对压缩包，用于支撑蛋白质复合物结构预测研究。 文件详解 .pdb格式文件（共4个）...
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βγ_CAT_Based大蹼铃蟾水维持机制研究数据
2026年1月31日 30 107 33
数据集概述 本数据集为大蹼铃蟾βγ-CAT蛋白介导水维持机制的研究数据，包含14个相关文件。βγ-CAT是一种受环境调控的孔形成蛋白与三叶因子复合物，在高渗应激下通过诱导巨胞饮、促进水摄入及外泌体释放，调节水通道蛋白分布，帮助蟾蜍维持水平衡。数据支持该蛋白在渗透压调节中的关键作用研究。 文件详解 说明文档 文件名称：README.xls...
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Timema_project_孤雌生殖进化分析中间数据
2026年1月31日 30 118 109
数据集概述 本数据集包含Timema竹节虫孤雌生殖进化分析过程中产生的关键中间文件，涵盖基因序列、进化树、直系同源群压缩包及格式化文本等类型，共七个文件，用于支持昆虫孤雌生殖进化机制的研究。 文件详解 基因序列文件（.fasta格式） 文件名称：trimmed_onesp_COIseqs_def.fasta、all_COIseqs.fasta...
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raw_data_Based_生物学原始实验数据文件集
2026年1月30日 30 19 5
数据集概述 本数据集为生物学领域的原始实验数据文件集，包含三十个文件，覆盖FASTA、PDB、TXT、CSV、TSV、XLSX、R等七种格式，涉及信号强度测量、序列比对、结构分析、数据处理脚本等内容，无明确目录结构，可用于生物信息学相关分析。 文件详解 数据文件类 信号强度测量文件：如Fig. S9Dand...
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Anammox_微生物基因组研究_厌氧氨氧化细菌电子受体补充数据
2026年1月27日 30 143 107
数据集概述 本数据集是关于厌氧氨氧化（anammox）细菌电子受体研究的补充数据，包含2个Excel补充表格和1个宏基因组氨基酸序列文件。研究聚焦于厌氧氨氧化细菌最初以一氧化氮（NO）为电子受体的假设，通过比较基因组学分析了相关基因的水平转移，并验证了菌群的代谢活性，为理解厌氧氨氧化细菌的进化和代谢机制提供支持。 文件详解...
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Aspergillus_sp_TS_A_木质素降解酶氨基酸序列数据
2026年1月27日 30 118 114
数据集概述 本数据集包含曲霉属菌株Aspergillus sp. TS-A的木质素降解酶氨基酸序列信息，涉及漆酶（Lac）、锰过氧化物酶（Mnp）和木质素过氧化物酶（Lip）三种酶，这些酶在污染物降解领域具有应用价值。数据集仅包含一个文档文件。 文件详解 文件名称：amino_acid_sequence.docx 文件格式：DOCX...
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Conidae_Based_芋螺食性广度与毒液复杂性关联研究数据集
2026年1月27日 30 111 77
数据集概述 本数据集围绕芋螺食性广度与毒液复杂性的关联性展开，包含12种系统发育差异显著的芋螺（10种食虫、1种食软体动物、1种广食性）的毒液管转录组数据及生态学数据，用于验证猎物分类和食性广度对毒液组成的影响假设，涉及毒液成分、食性及系统发育分析相关文件。 文件详解 表达结果压缩包 文件名称：expression_results.zip...
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菲洛多利亚属微型飞蛾在夏威夷沉没岛屿上的起源与宏观进化_研究数据集
2026年1月27日 30 154 50
数据集概述 本数据集聚焦夏威夷特有潜叶蛾属Philodoria的起源与宏进化研究，包含基于锚定杂交富集技术构建的首个夏威夷动物类群系统发育基因组数据集（507个基因位点），以及相关的基因覆盖度、年代校准和系统发育树文件，共6份文件。 文件详解 基因序列数据文件 文件名称：ESM4-Dataset1_FcC_supermatrix_507_AA.nex...
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Anchored_Based_天牛科系统发育与进化研究锚定杂交富集数据
2026年1月26日 30 143 1
数据集概述 本数据集基于锚定杂交富集技术生成的522个单拷贝核基因系统发育数据，用于重建天牛科（Cerambycidae）的高级系统发育关系。样本覆盖31个叶甲总科类群及4个外群，聚焦天牛科的系统发育地位与亚科间关系，为天牛科进化历史研究提供基础数据。 文件详解 文件名称：concatenated_nt.phy 文件格式：.phy...
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Prioninae_Based_澳大利亚长角甲虫系统发育与分类研究数据_2023
2026年1月19日 30 78 45
数据集概述 本数据集包含澳大利亚Prioninae（鞘翅目：天牛科）的系统发育研究数据，通过博物馆标本的全基因组 shotgun 测序，利用线粒体蛋白编码基因重建系统发育关系，结合形态特征提出分类修订建议，将澳大利亚Prioninae划分为7个族。数据集含5个文件，涵盖样本信息、序列比对、系统发育树等核心内容。 文件详解 README.md...
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Cm28_Scorpion_toxin_蝎毒素Cm28氨基酸序列数据
2026年1月23日 30 40 1
数据集概述 本数据集包含Centruroides margaritatus蝎毒中发现的肽毒素Cm28的氨基酸序列，相关肽序列及功能数据已发表于《Journal of General Physiology》期刊，数据将收录于UniProt知识库（登录号C0HM22），为研究蝎毒素结构与功能提供基础序列信息。 文件详解 文件名称：Cm28_scorpion...
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BacLABNet_Based_乳酸菌细菌素序列分类深度学习模型开发数据
2026年1月22日 30 37 12
数据集概述 本数据集为乳酸菌细菌素序列分类深度学习神经网络开发项目的配套数据，包含软件相关文件、模型训练测试验证文件及附加文件三类，涉及深度学习模型脚本、训练权重、结构文件、序列数据集等，可支持细菌素序列分类模型的复现与应用。 文件详解 软件相关文件 BacLABNet_script.ipynb：IPYNB格式，用于细菌素序列分类的深度学习神经网络脚本...
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arch_3_In_silico_Based_古紫质3结构预测建模文件包
2026年1月22日 30 23 9
数据集概述 本数据集包含使用Medeller和RosettaCM算法预测古紫质3（arch-3）蛋白质结构所需的全部文件，支持从序列比对、模板处理到结构建模、优化及结果评估的完整流程，可用于生物信息学领域的蛋白质结构预测研究。 文件详解 核心输入文件 文件名称：P96787.fasta、1UAZ.fasta 文件格式：FASTA...
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Prochlorococcus_Based_海洋蓝细菌多样分离株基因组数据
2026年1月21日 30 114 19
数据集概述 本数据集包含27株海洋蓝细菌Prochlorococcus的全基因组序列（2株完整闭合，25株草稿质量），覆盖5个主要系统发育分支，分离自全球不同海域。同时提供预计算的蛋白质直系同源组（COGs）聚类数据，可用于比较基因组学研究，是微生物生态学、进化和海洋学领域的重要参考资料。 文件详解 文档文件（document_files）...
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Neobatrachia_Based_新蛙类线粒体与核基因分子进化速率数据
2026年1月21日 30 53 46
数据集概述 本数据集包含新蛙类（Neobatrachia）及其近缘类群的线粒体全基因组与核基因序列数据，用于研究新蛙类起源过程中分子进化速率的变化。数据涵盖6种蛙类（含1种非新蛙类）的序列，支持构建系统发育树、分析线粒体与核基因替代速率差异及选择压力变化。 文件详解...
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Passerida_Based_鸟类线粒体基因组转录组测序系统发育研究数据
2026年1月21日 30 91 79
数据集概述 本数据集通过转录组测序获取四种雀形目Passerida鸟类的线粒体基因组蛋白编码基因序列，用于研究Passerida基部类群的系统发育关系，提出Sylvioidea与Passeroidea为姐妹群、Paridae和Muscicapidae依次为其外类群的新假设，验证转录组测序获取线粒体基因组的有效性。 文件详解...
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酶底物分类SDRs和SAM甲基转移酶_SAM_MTases_酶底物分类数据集
2026年1月20日 30 114 103
数据集概述 本数据集包含358个短链脱氢酶/还原酶（SDRs）和953个S-腺苷甲硫氨酸依赖甲基转移酶（SAM-MTases）的序列信息、AlphaFold2模型三维结构及底物分类标签，支持酶底物分类研究，共14个文件。 文件详解 序列文件 文件名称：SDR_sequences.fasta、SAM_sequences.fasta 文件格式：FASTA...
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Hydrophis_cyanocinctus_南海环纹海蛇毒腺转录组毒素数据
2026年1月20日 30 66 52
数据集概述 本数据集包含南海环纹海蛇（Hydrophis cyanocinctus）毒腺转录组相关的四个补充表格，涵盖毒素基因序列、蛋白家族表达占比及正选择检测所用序列等信息，为海蛇毒素分子研究提供结构化数据支持。 文件详解 文件名称：Supplementary Materials.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：包含四个表格： Table...
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Kakusan4_Aminosan_Based_分子系统发育模型选择程序数据
2026年1月20日 30 131 100
数据集概述 本数据集包含Kakusan4和Aminosan两个程序的样本文件，用于多基因座序列数据的分子系统发育分析。这两个程序支持基于信息准则选择非分区、比例和单独模型，可处理DNA及氨基酸序列，提供图形界面与命令行接口，并生成主流系统发育软件的模型配置文件。 文件详解 文件名称：Sample_Aminosan.zip 文件格式：ZIP...
