数据集概述
本数据集包含新蛙类（Neobatrachia）及其近缘类群的线粒体全基因组与核基因序列数据，用于研究新蛙类起源过程中分子进化速率的变化。数据涵盖6种蛙类（含1种非新蛙类）的序列，支持构建系统发育树、分析线粒体与核基因替代速率差异及选择压力变化。
文件详解
- 线粒体核苷酸序列文件：Neobatrachia_mt_nucleotide.nex，格式NEX，包含新蛙类及近缘种的线粒体基因组核苷酸序列
- 核基因核苷酸序列文件：Neobatrachia_nuc_nucleotide.nex，格式NEX，包含9个核基因座的核苷酸序列
- 线粒体氨基酸序列文件：Neobatrachia_mt_aminoacid.nex，格式NEX，线粒体基因编码的氨基酸序列
- 联合氨基酸序列文件：Neobatrachia_combined_aminoacid.nex，格式NEX，线粒体与核基因的联合氨基酸序列
- 核基因氨基酸序列文件：Neobatrachia_nuc_aminoacid.nex，格式NEX，核基因编码的氨基酸序列
- 联合核苷酸序列文件：Neobatrachia_combined_nucleotide.nex，格式NEX，线粒体与核基因的联合核苷酸序列
- BEAST分析文件：Neobatrachia_Beast_file.xml，格式XML，用于BEAST软件进行系统发育树构建与分化时间估算的配置文件
数据来源
论文“The origin of modern frogs (Neobatrachia) was accompanied by acceleration in mitochondrial and nuclear substitution rates”
适用场景
- 蛙类系统发育研究：基于线粒体与核基因序列重建新蛙类及其近缘类群的系统发育关系
- 分子进化速率分析：比较新蛙类与非新蛙类的线粒体、核基因替代速率差异
- 选择压力分析：通过选择系数（ω）探究新蛙类进化过程中纯化选择的放松机制
- 进化时间估算：利用BEAST文件分析新蛙类主要支系的分化时间节点
- 基因组进化研究：分析线粒体基因组重排与替代速率变化的关联性
