数据集概述
本数据集聚焦夏威夷特有潜叶蛾属Philodoria的起源与宏进化研究,包含基于锚定杂交富集技术构建的首个夏威夷动物类群系统发育基因组数据集(507个基因位点),以及相关的基因覆盖度、年代校准和系统发育树文件,共6份文件。
文件详解
- 基因序列数据文件
- 文件名称:ESM4-Dataset1_FcC_supermatrix_507_AA.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:含507个基因位点的氨基酸序列超级矩阵
- 文件名称:ESM3-Dataset1_FcC_supermatrix_507_nuc.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:含507个基因位点的核苷酸序列超级矩阵
- 文件名称:ESM5-Dataset2_FcC_supermatrix_D60E15_FULL_LENGTH_FINAL.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:全长最终版的核苷酸序列超级矩阵
- 辅助分析文件
- 文件名称:ESM19-Gene_Coverage.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基因覆盖度相关数据表格
- 文件名称:ESM16-A3_MCC_BEAST_infile.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:BEAST软件分析用的XML输入文件
- 文件名称:ESM15-A3_MCC_BEAST.trees
- 文件格式:TREES
- 字段映射介绍:BEAST分析得到的最大类群置信度系统发育树文件
数据来源
论文“Origin and macroevolution of micro-moths on sunken Hawaiian islands”
适用场景
- 夏威夷生物多样性起源研究: 分析Philodoria属微蛾的起源时间与模式,探讨夏威夷群岛生物演化机制
- 昆虫宏进化分析: 基于507个基因位点的系统发育基因组数据,研究微蛾类群的宏进化过程
- 生物地理校准方法比较: 对比生物地理校准与二次校准两种年代测定策略的差异
- 宿主植物协同演化研究: 探究微蛾与濒危夏威夷植物类群的协同演化关系
- 系统发育软件应用验证: 基于BEAST输入输出文件,验证系统发育分析流程的可靠性