Passerida_Based_鸟类线粒体基因组转录组测序系统发育研究数据

数据集概述

本数据集通过转录组测序获取四种雀形目Passerida鸟类的线粒体基因组蛋白编码基因序列,用于研究Passerida基部类群的系统发育关系,提出Sylvioidea与Passeroidea为姐妹群、Paridae和Muscicapidae依次为其外类群的新假设,验证转录组测序获取线粒体基因组的有效性。

文件详解

  • README_for_gene.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:说明压缩包内文件类型,包括未比对核苷酸序列(.fst)、比对后氨基酸序列(.mafft.fst)、比对后核苷酸序列(*_base.fst),以及四种鸟类(corvusBrachyrhynchos、parusCaeruleus、manacusVitellinus、ficedulaHypoleuca)序列的来源为脑转录组测序。
  • gene.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含三种类型序列文件,对应四种Passerida鸟类的线粒体基因组相关序列数据。

数据来源

论文“Obtaining mtDNA genomes from next-generation transcriptome sequencing: a case study on the basal Passerida (Aves: Passeriformes) phylogeny”

适用场景

  • 鸟类系统发育研究: 分析Passerida基部类群的演化关系,验证新的系统发育假设。
  • 线粒体基因组获取方法验证: 评估转录组测序技术在获取线粒体基因组数据中的有效性和准确性。
  • 分子进化分析: 基于线粒体蛋白编码基因序列,研究Passerida鸟类的分子进化速率与模式。
  • 生物信息学方法应用: 探索转录组数据中提取特定基因组序列的技术流程与工具优化。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.19 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。