数据集概述
本数据集包含科西嘉岛野生蓝山雀种群的遗传力研究数据，基于约50,000个过滤后的RAD-seq SNPs，对494个样本的跗骨长度、翼长、喙长和体重4个数量性状，分别通过社会系谱（PED-social）、遗传校正系谱（PED-corrected）和基因组相关矩阵（GRM）进行遗传力估计，同时分析性状间遗传相关性及染色体遗传力分区，总计4个文件。
文件详解
- PED.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含社会系谱（PED-social）数据，记录个体间的系谱关系，示例内容显示个体编号（如ind1、ind2）及系谱相关标识（如1_PIRE、10_PIRE）
- plink.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩文件，推测包含基于PLINK软件的基因组相关矩阵（GRM）计算所需的基因型数据或相关中间文件
- traits.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含4个数量性状（跗骨长度、翼长、喙长、体重）的表型数据
- blups.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含最佳线性无偏预测（BLUPs）数据，用于数量性状的遗传参数估计
数据来源
论文“Heritability estimates from genome wide relatedness matrices in wild populations: application to a passerine, using a small sample size”
适用场景
- 野生种群遗传力研究：对比社会系谱与基因组相关矩阵在非模式物种小样本中遗传力估计的差异
- 数量性状遗传分析：分析蓝山雀形态性状（跗骨、翼、喙长度及体重）的遗传相关性及染色体遗传力分布
- 基因组系谱校正应用：验证遗传数据校正社会系谱对遗传力估计准确性的影响
- 小样本基因组分析方法评估：探讨小样本量（n=494）对野生种群基因组相关矩阵分析结果的限制及改进方向
