数据集概述
本数据集为雨林树木叶绿体基因组变异研究数据,通过下一代测序技术分析12种非模式雨林树木的叶绿体全基因组变异,涉及南北两个进化区域。数据包含叶绿体参考序列及核rDNA标记信息,可用于识别生物地理屏障、分析遗传多样性分布及进化历史。
文件详解
- 文件名称:Next_Gen_phylogeography_of_rainforest_trees_van_der_Merwe_et_al.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含11个物种特异性叶绿体参考序列文件(SSCrefs),由全基因组鸟枪法测序数据组装生成,记录叶绿体基因组序列信息。
- 文件名称:README_for_Next_Gen_phylogeography_of_rainforest_trees_van_der_Merwe_et_al.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、数据来源、文件内容概述及使用方法,涉及作者信息、测序技术及分析流程等关键说明。
数据来源
论文“Next Gen phylogeography of rainforest trees: exploring landscape-level cpDNA variation from whole-genome sequencing”
适用场景
- 进化生态学研究:分析雨林树木叶绿体基因组变异与地理区域的关联,识别生物地理屏障及避难所。
- 遗传多样性分布分析:比较南北区域雨林树木的遗传多样性水平,探究扩张区域与避难所的遗传差异。
- 分子标记开发:利用核rDNA标记及叶绿体基因组序列,开发适用于非模式雨林树种的分子标记。
- 功能特征与遗传多样性关联研究:探索树木功能特征(如适应性)与遗传多样性的关联模式。
- 景观水平进化研究:支持无需物种特异性先验知识的景观尺度进化生态学问题研究。