极危物种_欧亚鲟_Acipenser_stellatus_的转录组资源数据_2015年

数据集概述

本数据集为极危物种星状鲟(Acipenser stellatus)的转录组资源数据,包含组装序列、变异数据、功能注释及分析代码等5个文件,支持该非模式物种的分子生物学与保护遗传学研究,无目录结构,文件类型涵盖压缩包与Python脚本。

文件详解

  • 组装序列文件:CDNA1-2_11_2010_1_final_assembly.tgz,格式为tgz,包含转录组最终组装结果
  • 变异数据文件:stellatus_var.zip,格式为zip,包含星状鲟转录组变异信息
  • 功能注释文件:stellatus_annot_GAF_20121111_1852.zip,格式为zip,包含基于GAF格式的功能注释数据
  • KEGG注释文件:stellatus_kegg_txt_20121109_1825.zip,格式为zip,包含KEGG通路注释的文本数据
  • 分析代码文件:make_repeated_assembly.py,格式为py,包含重复组装分析的Python脚本

数据来源

Genomic Resources Notes期刊论文"Transcriptomic resources for the critically endangered stellate sturgeon Acipenser stellatus"

适用场景

  • 极危物种保护遗传学研究:分析星状鲟的转录组变异与遗传多样性,支持保护策略制定
  • 非模式物种转录组分析:作为星状鲟分子生物学研究的基础数据资源
  • 功能基因组学研究:利用注释文件开展基因功能与通路分析
  • 生物信息学方法验证:通过分析代码复现转录组重复组装流程,优化分析方法
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 32.46 MiB
最后更新 2026年1月14日
创建于 2026年1月14日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。