数据集概述
本数据集为极危物种星状鲟(Acipenser stellatus)的转录组资源数据,包含组装序列、变异数据、功能注释及分析代码等5个文件,支持该非模式物种的分子生物学与保护遗传学研究,无目录结构,文件类型涵盖压缩包与Python脚本。
文件详解
- 组装序列文件:CDNA1-2_11_2010_1_final_assembly.tgz,格式为tgz,包含转录组最终组装结果
- 变异数据文件:stellatus_var.zip,格式为zip,包含星状鲟转录组变异信息
- 功能注释文件:stellatus_annot_GAF_20121111_1852.zip,格式为zip,包含基于GAF格式的功能注释数据
- KEGG注释文件:stellatus_kegg_txt_20121109_1825.zip,格式为zip,包含KEGG通路注释的文本数据
- 分析代码文件:make_repeated_assembly.py,格式为py,包含重复组装分析的Python脚本
数据来源
Genomic Resources Notes期刊论文"Transcriptomic resources for the critically endangered stellate sturgeon Acipenser stellatus"
适用场景
- 极危物种保护遗传学研究:分析星状鲟的转录组变异与遗传多样性,支持保护策略制定
- 非模式物种转录组分析:作为星状鲟分子生物学研究的基础数据资源
- 功能基因组学研究:利用注释文件开展基因功能与通路分析
- 生物信息学方法验证:通过分析代码复现转录组重复组装流程,优化分析方法